40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1544 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_1544  ATPase-like protein  100 
 
 		 391 aa  797    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0152832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0926  AAA ATPase  46.13 
 
 		 382 aa  323  4e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0900  AAA ATPase  46.13 
 
 		 382 aa  322  8e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3672  hypothetical protein  24.37 
 
 		 378 aa  99.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0777  ATPase-like protein  27.07 
 
 		 381 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0748  hypothetical protein  26.41 
 
 		 377 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1413  hypothetical protein  25.14 
 
 		 396 aa  83.6  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.923641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0488  ATPase-like protein  33.15 
 
 		 350 aa  73.6  0.000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4266  ATPase-like protein  37.93 
 
 		 361 aa  70.5  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1861  hypothetical protein  34.69 
 
 		 353 aa  69.7  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3860  hypothetical protein  21.79 
 
 		 345 aa  63.9  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.925149  normal  0.074002 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3946  hypothetical protein  29.51 
 
 		 356 aa  59.7  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1457  putative ATPase  25 
 
 		 347 aa  57  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0937  ATPase-like protein  28.87 
 
 		 356 aa  55.5  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1141  ATPase-like protein  34.02 
 
 		 366 aa  54.7  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.956923  normal  0.756779 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0732  hypothetical protein  28.18 
 
 		 399 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.699164  normal  0.348353 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0703  hypothetical protein  28.18 
 
 		 399 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1569  ATPase-like protein  29.36 
 
 		 354 aa  52.8  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.768338  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4244  hypothetical protein  42.59 
 
 		 538 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.777185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3830  hypothetical protein  42.59 
 
 		 534 aa  52.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.531313  hitchhiker  0.000259973 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  23.68 
 
 		 564 aa  49.7  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0470  SMC domain-containing protein  38.46 
 
 		 346 aa  48.5  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0499  SMC domain-containing protein  33.33 
 
 		 349 aa  48.1  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000698714 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2057  putative ATPase  53.66 
 
 		 341 aa  46.6  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3716  DNA replication and repair protein RecF  52.38 
 
 		 359 aa  45.8  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.362635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2592  hypothetical protein  55.56 
 
 		 429 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002007  DNA recombination and repair protein RecF  48.84 
 
 		 359 aa  45.8  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0003677  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00444  recombination protein F  48.84 
 
 		 357 aa  45.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2505  recombination protein F  48.84 
 
 		 363 aa  45.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0488541  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3185  ATP-dependent endonuclease family protein  48.94 
 
 		 641 aa  45.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0003  recombination protein F  48.84 
 
 		 368 aa  44.7  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000843052  unclonable  0.00000000000512174 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0004  recombination protein F  51.28 
 
 		 374 aa  44.3  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0003  recombination protein F  40.91 
 
 		 379 aa  43.9  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0714428  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0003  recombination protein F  52.27 
 
 		 361 aa  43.5  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0385213  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0003  recombination protein F  52.27 
 
 		 361 aa  43.5  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0661286  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0004  DNA replication and repair protein RecF  44.44 
 
 		 353 aa  42.7  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000383314  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0003  recombination protein F  53.49 
 
 		 361 aa  42.7  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279219  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0003  recombination protein F  42.31 
 
 		 378 aa  42.7  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.552608  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2549  SMC domain protein  50 
 
 		 315 aa  42.7  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0441079  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1102  hypothetical protein  44.68 
 
 		 411 aa  42.7  0.01  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.89522  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>