13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2592 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2592  hypothetical protein  100 
 
 		 429 aa  875    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4244  hypothetical protein  45.35 
 
 		 538 aa  205  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.777185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3830  hypothetical protein  46.51 
 
 		 534 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.531313  hitchhiker  0.000259973 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0499  SMC domain-containing protein  21.32 
 
 		 349 aa  71.2  0.00000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000698714 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1544  ATPase-like protein  54.76 
 
 		 391 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0152832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0470  SMC domain-containing protein  22.16 
 
 		 346 aa  49.3  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0900  AAA ATPase  21.87 
 
 		 382 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0926  AAA ATPase  21.87 
 
 		 382 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1457  putative ATPase  44.44 
 
 		 347 aa  44.3  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3924  ATPase-like protein  36.96 
 
 		 336 aa  44.3  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.801052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3716  DNA replication and repair protein RecF  46.67 
 
 		 359 aa  43.9  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.362635  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2057  putative ATPase  41.82 
 
 		 341 aa  43.9  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3087  ATP-dependent OLD family endonuclease  51.16 
 
 		 605 aa  43.5  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>