92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3924 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3924  ATPase-like protein  100 
 
 		 336 aa  681    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.801052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  26.6 
 
 		 369 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2613  SMC domain protein  29.92 
 
 		 369 aa  83.6  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  29.95 
 
 		 367 aa  83.2  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  29.95 
 
 		 367 aa  83.2  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  24.75 
 
 		 386 aa  82  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1025  hypothetical protein  22.87 
 
 		 362 aa  81.3  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000305528 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  24.67 
 
 		 395 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  22.86 
 
 		 378 aa  79.3  0.00000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  23.43 
 
 		 364 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  27.41 
 
 		 378 aa  77  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  31.47 
 
 		 409 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0507  hypothetical protein  24 
 
 		 373 aa  70.9  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  26.83 
 
 		 382 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  24.34 
 
 		 369 aa  68.9  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0562  hypothetical protein  25.2 
 
 		 370 aa  68.9  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.260913  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  26.83 
 
 		 382 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3708  ATPase-like protein  25 
 
 		 364 aa  68.2  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  36.3 
 
 		 398 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  21.02 
 
 		 378 aa  67.4  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  36 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0765  hypothetical protein  26.77 
 
 		 365 aa  64.3  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.63543  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8073  ATPase-like protein  34.46 
 
 		 362 aa  63.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1775  endonuclease III  21.41 
 
 		 357 aa  62.4  0.000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17856  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3749  hypothetical protein  32.62 
 
 		 394 aa  62  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3622  SMC domain protein  28.28 
 
 		 363 aa  62.4  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  26.21 
 
 		 370 aa  61.2  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  19.69 
 
 		 377 aa  61.2  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0112  hypothetical protein  24.55 
 
 		 430 aa  60.5  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  26.32 
 
 		 368 aa  59.7  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2912  SMC protein-like  29.58 
 
 		 418 aa  59.3  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.492401  normal  0.0605125 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3499  SMC domain protein  21.01 
 
 		 363 aa  58.5  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3822  hypothetical protein  28.43 
 
 		 370 aa  58.9  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0324063 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1302  ATPase-like  28 
 
 		 419 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000145655  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4237  hypothetical protein  28.43 
 
 		 370 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2706  hypothetical protein  26.94 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3397  hypothetical protein  26.42 
 
 		 395 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  20.05 
 
 		 382 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1226  hypothetical protein  26.32 
 
 		 384 aa  55.5  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3552  hypothetical protein  25.52 
 
 		 416 aa  55.1  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2311  SMC domain protein  23.85 
 
 		 397 aa  55.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  30.65 
 
 		 424 aa  54.3  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  26.24 
 
 		 399 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0121  ATPase-like protein  20.63 
 
 		 407 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.188452 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4235  ATPase-like protein  31.82 
 
 		 187 aa  52.8  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.837298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1131  SMC domain protein  29.81 
 
 		 450 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.526004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  24.62 
 
 		 411 aa  52  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4093  SMC domain protein  30.36 
 
 		 454 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136453  normal  0.0462835 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1846  ATPase-like protein  25.91 
 
 		 409 aa  51.2  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4110  ATPase-like protein  24.91 
 
 		 427 aa  50.1  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000135453 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  25.93 
 
 		 394 aa  49.7  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47820  hypothetical protein  29.78 
 
 		 395 aa  48.9  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.088572  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0490  hypothetical protein  26.37 
 
 		 416 aa  49.3  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  30.4 
 
 		 393 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  26.32 
 
 		 398 aa  49.3  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1288  SMC domain protein  26.13 
 
 		 417 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0947514  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2314  hypothetical protein  23.56 
 
 		 376 aa  48.5  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198863 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  28.46 
 
 		 385 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0229  hypothetical protein  28.57 
 
 		 386 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02963  hypothetical protein  30.71 
 
 		 376 aa  47  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3220  SMC domain-containing protein  25.23 
 
 		 394 aa  47.4  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  29.17 
 
 		 390 aa  47  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  29.17 
 
 		 390 aa  47  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0053  SMC domain protein  28.57 
 
 		 397 aa  46.6  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1458  hypothetical protein  22.22 
 
 		 431 aa  46.2  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0146  ATPase-like  28.46 
 
 		 226 aa  45.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2545  ATPase-like  24.14 
 
 		 419 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000977998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0310  SMC domain protein  23.17 
 
 		 412 aa  45.4  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  28.57 
 
 		 390 aa  45.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1016  SMC domain-containing protein  28.57 
 
 		 386 aa  45.8  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0527217  normal  0.402685 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3672  hypothetical protein  22.19 
 
 		 378 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1107  hypothetical protein  44.19 
 
 		 591 aa  45.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000952777  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0003  DNA replication and repair protein RecF  43.48 
 
 		 362 aa  44.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000115018  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5019  ATPase, RecF-like protein  40.82 
 
 		 388 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2281  ATPase  30.73 
 
 		 390 aa  44.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1792  hypothetical protein  29.17 
 
 		 390 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3701  hypothetical protein  32.74 
 
 		 390 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0493  abortive infection protein  25.64 
 
 		 407 aa  44.3  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4449  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  18.93 
 
 		 564 aa  44.3  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1754  hypothetical protein  33.33 
 
 		 405 aa  43.9  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2290  hypothetical protein  20.72 
 
 		 409 aa  43.9  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6914  initiation factor 2 associated domain-containing protein  45 
 
 		 680 aa  43.5  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3562  ATPase-like  34.12 
 
 		 394 aa  43.9  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76495  normal  0.327688 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  24.29 
 
 		 448 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  24.29 
 
 		 448 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1235  SMC domain-containing protein  36.36 
 
 		 359 aa  43.5  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0592  hypothetical protein  40 
 
 		 361 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2851  SMC domain protein  25.58 
 
 		 423 aa  43.5  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0808223 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  29.14 
 
 		 388 aa  43.1  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2991  abortive infection protein  28.97 
 
 		 380 aa  42.7  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0164345  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  36.23 
 
 		 410 aa  42.7  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1759  sulphate transport system permease protein 1  34.94 
 
 		 367 aa  42.7  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>