44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0493 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0493  abortive infection protein  100 
 
 		 407 aa  837    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0054  abortive infection protein  81.33 
 
 		 407 aa  705    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3852  abortive infection protein  38.67 
 
 		 394 aa  281  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000425466 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1616  abortive infection protein, internal deletion  36.87 
 
 		 400 aa  255  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0255755 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1899  abortive infection protein, internal deletion  33.09 
 
 		 394 aa  250  3e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136383  normal  0.598011 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3995  abortive infection protein, internal deletion  30.24 
 
 		 388 aa  159  7e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2991  abortive infection protein  31.95 
 
 		 380 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0164345  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3302  hypothetical protein  25.86 
 
 		 428 aa  124  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2870  hypothetical protein  24.15 
 
 		 435 aa  124  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.716536  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4229  abortive infection protein  27.23 
 
 		 405 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0741  putative phage resistance protein  25.45 
 
 		 417 aa  108  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333006  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1557  hypothetical protein  24.14 
 
 		 422 aa  102  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662923  normal  0.436276 
 
 
-
 
NC_002950  PG0079  abortive infection protein, putative  26.52 
 
 		 433 aa  101  2e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11638  abortive infection protein, putative  24.55 
 
 		 438 aa  97.1  6e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2148  hypothetical protein  25.5 
 
 		 431 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.61865 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0050  hypothetical protein  25.17 
 
 		 451 aa  90.5  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4361  hypothetical protein  22.73 
 
 		 465 aa  89.4  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.77847 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2208  hypothetical protein  26.34 
 
 		 422 aa  88.6  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1294  hypothetical protein  24.07 
 
 		 456 aa  85.5  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0298  putative phage resistance protein  22.81 
 
 		 422 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.066915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2132  abortive infection protein, putative  26.65 
 
 		 432 aa  83.2  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.903649  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7388  hypothetical protein  22.72 
 
 		 440 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0903  hypothetical protein  25.78 
 
 		 429 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1948  abortive phage resistance protein-like protein  23.48 
 
 		 454 aa  75.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0995  RloA protein  22.78 
 
 		 425 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1784  ATPase-like protein  25.48 
 
 		 459 aa  74.3  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00463649  normal  0.498848 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2064  hypothetical protein  32.52 
 
 		 421 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.906065  normal  0.239178 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12600  hypothetical protein  21.94 
 
 		 435 aa  63.2  0.000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1041  ATPase-like  31 
 
 		 447 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2014  hypothetical protein  26.92 
 
 		 449 aa  54.3  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3170  putative abortive phage resistance  28.89 
 
 		 488 aa  53.5  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1074  abortive phage resistance protein-like protein  22.2 
 
 		 456 aa  53.5  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.960814  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1530  abortive infection protein  23.22 
 
 		 392 aa  52.8  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00764911  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2166  AAA ATPase  28.79 
 
 		 445 aa  52  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000280978  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3541  ATPase-like protein  22.67 
 
 		 426 aa  51.6  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4680  hypothetical protein  23.66 
 
 		 458 aa  51.2  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.105377  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2275  hypothetical protein  24.7 
 
 		 315 aa  50.8  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.972527  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0733  hypothetical protein  25.19 
 
 		 437 aa  48.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00594005  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1920  abortive phage resistance protein-like  23.56 
 
 		 448 aa  47.8  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000340563  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3397  hypothetical protein  21.26 
 
 		 395 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2706  hypothetical protein  21.26 
 
 		 395 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2549  SMC domain protein  32.2 
 
 		 315 aa  44.7  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0441079  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3924  ATPase-like protein  25.64 
 
 		 336 aa  44.3  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.801052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  33.33 
 
 		 364 aa  43.5  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>