43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1294 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1294  hypothetical protein  100 
 
 
456 aa  922    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0050  hypothetical protein  56.8 
 
 
451 aa  501  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7388  hypothetical protein  58.09 
 
 
440 aa  479  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2064  hypothetical protein  41.77 
 
 
421 aa  293  4e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.906065  normal  0.239178 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2208  hypothetical protein  36.08 
 
 
422 aa  258  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1557  hypothetical protein  36.32 
 
 
422 aa  256  6e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662923  normal  0.436276 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0741  putative phage resistance protein  35.14 
 
 
417 aa  256  8e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333006  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4361  hypothetical protein  35.77 
 
 
465 aa  251  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.77847 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0995  RloA protein  35.12 
 
 
425 aa  249  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0298  putative phage resistance protein  34.28 
 
 
422 aa  240  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.066915  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11638  abortive infection protein, putative  34.17 
 
 
438 aa  232  1e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2148  hypothetical protein  34.77 
 
 
431 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.61865 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2870  hypothetical protein  35.21 
 
 
435 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.716536  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0903  hypothetical protein  30.96 
 
 
429 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0079  abortive infection protein, putative  32.18 
 
 
433 aa  197  5.000000000000001e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3302  hypothetical protein  34.73 
 
 
428 aa  191  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1041  ATPase-like  32.34 
 
 
447 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12600  hypothetical protein  29.68 
 
 
435 aa  174  2.9999999999999996e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3541  ATPase-like protein  30.94 
 
 
426 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1074  abortive phage resistance protein-like protein  29.09 
 
 
456 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.960814  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1784  ATPase-like protein  26.88 
 
 
459 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00463649  normal  0.498848 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1920  abortive phage resistance protein-like  27.95 
 
 
448 aa  126  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000340563  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3791  abortive phage resistance protein-like  27.73 
 
 
448 aa  125  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.618475  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1948  abortive phage resistance protein-like protein  26.65 
 
 
454 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3852  abortive infection protein  25.24 
 
 
394 aa  118  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000425466 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1899  abortive infection protein, internal deletion  26.51 
 
 
394 aa  108  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136383  normal  0.598011 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1616  abortive infection protein, internal deletion  24.68 
 
 
400 aa  106  8e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0255755 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2132  abortive infection protein, putative  23.55 
 
 
432 aa  106  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.903649  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4229  abortive infection protein  27.73 
 
 
405 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0493  abortive infection protein  24.54 
 
 
407 aa  94.7  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0054  abortive infection protein  22.74 
 
 
407 aa  90.9  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3995  abortive infection protein, internal deletion  23.85 
 
 
388 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2991  abortive infection protein  21 
 
 
380 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0164345  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2014  hypothetical protein  33.06 
 
 
449 aa  57.8  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1530  abortive infection protein  36.92 
 
 
392 aa  50.4  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00764911  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2166  AAA ATPase  24.03 
 
 
445 aa  48.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000280978  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2523  abortive infection protein  21.46 
 
 
478 aa  47  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.237288  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0733  hypothetical protein  20.87 
 
 
437 aa  46.6  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00594005  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  26.23 
 
 
386 aa  46.2  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0024  recombination protein RecR  29.1 
 
 
373 aa  45.8  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000424013  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1118  SMC domain-containing protein  22.62 
 
 
368 aa  45.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.266234  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4680  hypothetical protein  27.67 
 
 
458 aa  43.9  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.105377  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0472  AAA ATPase  33.33 
 
 
369 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>