40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2991 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2991  abortive infection protein  100 
 
 
380 aa  776    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0164345  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3995  abortive infection protein, internal deletion  40.21 
 
 
388 aa  310  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1899  abortive infection protein, internal deletion  31.33 
 
 
394 aa  186  5e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136383  normal  0.598011 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1616  abortive infection protein, internal deletion  32.84 
 
 
400 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0255755 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3852  abortive infection protein  30.95 
 
 
394 aa  157  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000425466 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0493  abortive infection protein  31.95 
 
 
407 aa  154  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0054  abortive infection protein  29.68 
 
 
407 aa  143  5e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4229  abortive infection protein  26.95 
 
 
405 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0741  putative phage resistance protein  25.12 
 
 
417 aa  105  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333006  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2148  hypothetical protein  26.82 
 
 
431 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.61865 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1557  hypothetical protein  25 
 
 
422 aa  103  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662923  normal  0.436276 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2064  hypothetical protein  26.43 
 
 
421 aa  100  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.906065  normal  0.239178 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0903  hypothetical protein  25.35 
 
 
429 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2208  hypothetical protein  25.48 
 
 
422 aa  94  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3302  hypothetical protein  22.84 
 
 
428 aa  92  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0050  hypothetical protein  25.33 
 
 
451 aa  91.7  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2132  abortive infection protein, putative  24.02 
 
 
432 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.903649  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0079  abortive infection protein, putative  24.7 
 
 
433 aa  84.7  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11638  abortive infection protein, putative  23.89 
 
 
438 aa  82.4  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12600  hypothetical protein  23.47 
 
 
435 aa  80.9  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2870  hypothetical protein  21.07 
 
 
435 aa  77  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.716536  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0298  putative phage resistance protein  21.82 
 
 
422 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.066915  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1294  hypothetical protein  20.37 
 
 
456 aa  67.8  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0995  RloA protein  22.31 
 
 
425 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3541  ATPase-like protein  23.58 
 
 
426 aa  63.5  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4361  hypothetical protein  28.06 
 
 
465 aa  61.2  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.77847 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1784  ATPase-like protein  31.25 
 
 
459 aa  57.4  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00463649  normal  0.498848 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7388  hypothetical protein  29.55 
 
 
440 aa  56.2  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1118  SMC domain-containing protein  26.35 
 
 
368 aa  54.3  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.266234  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1573  SMC domain-containing protein  26.4 
 
 
373 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0501523  normal  0.47865 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1041  ATPase-like  30.93 
 
 
447 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.59 
 
 
595 aa  46.6  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1948  abortive phage resistance protein-like protein  21.71 
 
 
454 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3791  abortive phage resistance protein-like  21.46 
 
 
448 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.618475  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1920  abortive phage resistance protein-like  21.23 
 
 
448 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000340563  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  31.07 
 
 
364 aa  44.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2549  SMC domain protein  32.94 
 
 
315 aa  44.7  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0441079  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  29.17 
 
 
398 aa  44.3  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0733  hypothetical protein  30.86 
 
 
437 aa  43.5  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00594005  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0024  recombination protein RecR  23.53 
 
 
373 aa  43.5  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000424013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>