36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3995 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3995  abortive infection protein, internal deletion  100 
 
 		 388 aa  800    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2991  abortive infection protein  40.21 
 
 		 380 aa  310  2e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0164345  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1899  abortive infection protein, internal deletion  30.32 
 
 		 394 aa  176  9e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136383  normal  0.598011 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0054  abortive infection protein  31.34 
 
 		 407 aa  166  9e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0493  abortive infection protein  30.24 
 
 		 407 aa  159  7e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3852  abortive infection protein  30.05 
 
 		 394 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000425466 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1616  abortive infection protein, internal deletion  31.26 
 
 		 400 aa  153  4e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0255755 
 
 
-
 
NC_002950  PG0079  abortive infection protein, putative  25.34 
 
 		 433 aa  113  4.0000000000000004e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2148  hypothetical protein  27.19 
 
 		 431 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.61865 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3302  hypothetical protein  26.18 
 
 		 428 aa  109  8.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11638  abortive infection protein, putative  24.42 
 
 		 438 aa  104  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4229  abortive infection protein  25.06 
 
 		 405 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2870  hypothetical protein  23.41 
 
 		 435 aa  96.7  7e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.716536  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0741  putative phage resistance protein  25.06 
 
 		 417 aa  93.2  7e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333006  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2208  hypothetical protein  26.74 
 
 		 422 aa  89  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2064  hypothetical protein  24.11 
 
 		 421 aa  88.2  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.906065  normal  0.239178 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4361  hypothetical protein  22.83 
 
 		 465 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.77847 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0050  hypothetical protein  23.8 
 
 		 451 aa  83.2  0.000000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0903  hypothetical protein  25.66 
 
 		 429 aa  82.8  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1294  hypothetical protein  24.08 
 
 		 456 aa  78.2  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7388  hypothetical protein  22.71 
 
 		 440 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1074  abortive phage resistance protein-like protein  22.61 
 
 		 456 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.960814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12600  hypothetical protein  23.14 
 
 		 435 aa  70.9  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0298  putative phage resistance protein  22.3 
 
 		 422 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.066915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1041  ATPase-like  21.4 
 
 		 447 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1920  abortive phage resistance protein-like  21.85 
 
 		 448 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000340563  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0995  RloA protein  22.95 
 
 		 425 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1784  ATPase-like protein  32.62 
 
 		 459 aa  63.9  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00463649  normal  0.498848 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3541  ATPase-like protein  23.02 
 
 		 426 aa  63.9  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3791  abortive phage resistance protein-like  21.62 
 
 		 448 aa  63.9  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.618475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2132  abortive infection protein, putative  32.26 
 
 		 432 aa  57  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.903649  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1557  hypothetical protein  28.89 
 
 		 422 aa  54.7  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662923  normal  0.436276 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2281  ATPase  28.18 
 
 		 390 aa  45.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  32.71 
 
 		 390 aa  44.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3170  putative abortive phage resistance  30.7 
 
 		 488 aa  43.9  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  26.4 
 
 		 364 aa  43.1  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>