42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1557 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_1557  hypothetical protein  100 
 
 
422 aa  868    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662923  normal  0.436276 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0741  putative phage resistance protein  51.19 
 
 
417 aa  430  1e-119  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333006  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0298  putative phage resistance protein  51.69 
 
 
422 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.066915  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2208  hypothetical protein  45.82 
 
 
422 aa  369  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0995  RloA protein  38.53 
 
 
425 aa  289  8e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2064  hypothetical protein  40.14 
 
 
421 aa  270  4e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.906065  normal  0.239178 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11638  abortive infection protein, putative  39.44 
 
 
438 aa  264  2e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0050  hypothetical protein  37.44 
 
 
451 aa  258  2e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0079  abortive infection protein, putative  37.16 
 
 
433 aa  245  9.999999999999999e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1294  hypothetical protein  36.08 
 
 
456 aa  244  3e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7388  hypothetical protein  36.57 
 
 
440 aa  243  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0903  hypothetical protein  35.55 
 
 
429 aa  242  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12600  hypothetical protein  35.2 
 
 
435 aa  236  4e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2870  hypothetical protein  35.78 
 
 
435 aa  224  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.716536  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2148  hypothetical protein  33.94 
 
 
431 aa  219  6e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.61865 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1041  ATPase-like  35.32 
 
 
447 aa  216  7e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3541  ATPase-like protein  34.93 
 
 
426 aa  211  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4361  hypothetical protein  31.68 
 
 
465 aa  204  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.77847 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2132  abortive infection protein, putative  29.66 
 
 
432 aa  153  5.9999999999999996e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.903649  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3791  abortive phage resistance protein-like  29.84 
 
 
448 aa  149  6e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.618475  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1920  abortive phage resistance protein-like  29.62 
 
 
448 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000340563  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1948  abortive phage resistance protein-like protein  27.03 
 
 
454 aa  144  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1074  abortive phage resistance protein-like protein  28.66 
 
 
456 aa  134  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.960814  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1616  abortive infection protein, internal deletion  27.91 
 
 
400 aa  117  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0255755 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0054  abortive infection protein  26.41 
 
 
407 aa  114  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1899  abortive infection protein, internal deletion  26.4 
 
 
394 aa  108  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136383  normal  0.598011 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4229  abortive infection protein  26.5 
 
 
405 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3302  hypothetical protein  43.38 
 
 
428 aa  106  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2991  abortive infection protein  25 
 
 
380 aa  103  7e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0164345  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0493  abortive infection protein  24.14 
 
 
407 aa  102  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3852  abortive infection protein  25.36 
 
 
394 aa  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000425466 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1784  ATPase-like protein  37.23 
 
 
459 aa  94  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00463649  normal  0.498848 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2014  hypothetical protein  23.26 
 
 
449 aa  65.1  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1118  SMC domain-containing protein  24.2 
 
 
368 aa  57  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.266234  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2166  AAA ATPase  28.76 
 
 
445 aa  54.7  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000280978  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3995  abortive infection protein, internal deletion  28.89 
 
 
388 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1530  abortive infection protein  20.87 
 
 
392 aa  52.4  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00764911  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0733  hypothetical protein  27.87 
 
 
437 aa  51.6  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00594005  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4680  hypothetical protein  28.46 
 
 
458 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.105377  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2275  hypothetical protein  23.06 
 
 
315 aa  47.4  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.972527  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0024  recombination protein RecR  24.34 
 
 
373 aa  47.4  0.0005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000424013  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3170  putative abortive phage resistance  28.44 
 
 
488 aa  43.1  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>