47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1074 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1074  abortive phage resistance protein-like protein  100 
 
 
456 aa  934    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.960814  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3791  abortive phage resistance protein-like  31.26 
 
 
448 aa  202  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.618475  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1920  abortive phage resistance protein-like  31.04 
 
 
448 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000340563  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1948  abortive phage resistance protein-like protein  30.26 
 
 
454 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1784  ATPase-like protein  29.27 
 
 
459 aa  190  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00463649  normal  0.498848 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2208  hypothetical protein  28.07 
 
 
422 aa  186  8e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2064  hypothetical protein  30.87 
 
 
421 aa  181  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.906065  normal  0.239178 
 
 
-
 
NC_002950  PG0079  abortive infection protein, putative  30.65 
 
 
433 aa  180  4.999999999999999e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0741  putative phage resistance protein  30.26 
 
 
417 aa  179  1e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333006  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0903  hypothetical protein  28.27 
 
 
429 aa  170  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2148  hypothetical protein  27.66 
 
 
431 aa  169  9e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.61865 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3541  ATPase-like protein  29.61 
 
 
426 aa  160  4e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12600  hypothetical protein  27.27 
 
 
435 aa  157  5.0000000000000005e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0995  RloA protein  28.04 
 
 
425 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1557  hypothetical protein  28.88 
 
 
422 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662923  normal  0.436276 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11638  abortive infection protein, putative  28.67 
 
 
438 aa  155  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0050  hypothetical protein  28.08 
 
 
451 aa  149  9e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1294  hypothetical protein  28.45 
 
 
456 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1041  ATPase-like  28.7 
 
 
447 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4361  hypothetical protein  28.12 
 
 
465 aa  146  7.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.77847 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7388  hypothetical protein  29.85 
 
 
440 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0298  putative phage resistance protein  28.04 
 
 
422 aa  138  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.066915  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3302  hypothetical protein  26.55 
 
 
428 aa  114  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2132  abortive infection protein, putative  24.74 
 
 
432 aa  92.4  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.903649  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2870  hypothetical protein  32.61 
 
 
435 aa  84  0.000000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.716536  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4229  abortive infection protein  34.04 
 
 
405 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3995  abortive infection protein, internal deletion  22.61 
 
 
388 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4680  hypothetical protein  31.85 
 
 
458 aa  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.105377  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1616  abortive infection protein, internal deletion  21.48 
 
 
400 aa  65.9  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0255755 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2166  AAA ATPase  25.37 
 
 
445 aa  61.6  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000280978  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0493  abortive infection protein  21.66 
 
 
407 aa  59.3  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3852  abortive infection protein  30.08 
 
 
394 aa  58.2  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000425466 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2523  abortive infection protein  22.11 
 
 
478 aa  53.1  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.237288  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0054  abortive infection protein  21.58 
 
 
407 aa  51.2  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1899  abortive infection protein, internal deletion  31.2 
 
 
394 aa  51.2  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136383  normal  0.598011 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2014  hypothetical protein  30.23 
 
 
449 aa  49.3  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0733  hypothetical protein  20.82 
 
 
437 aa  49.7  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00594005  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1530  abortive infection protein  39.71 
 
 
392 aa  49.7  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00764911  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2991  abortive infection protein  27.82 
 
 
380 aa  47.8  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0164345  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2311  SMC domain protein  32.63 
 
 
397 aa  47.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1118  SMC domain-containing protein  30.61 
 
 
368 aa  47  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.266234  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4093  SMC domain protein  36.9 
 
 
454 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136453  normal  0.0462835 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1302  ATPase-like  23.66 
 
 
419 aa  45.8  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000145655  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2545  ATPase-like  32.11 
 
 
419 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000977998  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  37.5 
 
 
448 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  37.5 
 
 
448 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1288  SMC domain protein  24.27 
 
 
417 aa  43.1  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0947514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>