44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1041 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1041  ATPase-like  100 
 
 
447 aa  916    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3541  ATPase-like protein  55.63 
 
 
426 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0995  RloA protein  34.4 
 
 
425 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1557  hypothetical protein  35.32 
 
 
422 aa  220  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662923  normal  0.436276 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2208  hypothetical protein  34.03 
 
 
422 aa  210  5e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0741  putative phage resistance protein  34.8 
 
 
417 aa  203  5e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333006  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0298  putative phage resistance protein  32.4 
 
 
422 aa  189  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.066915  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0050  hypothetical protein  30.98 
 
 
451 aa  178  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2064  hypothetical protein  32.56 
 
 
421 aa  176  7e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.906065  normal  0.239178 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1294  hypothetical protein  32.8 
 
 
456 aa  169  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2148  hypothetical protein  30.84 
 
 
431 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.61865 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12600  hypothetical protein  30.7 
 
 
435 aa  164  4.0000000000000004e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11638  abortive infection protein, putative  30.54 
 
 
438 aa  160  4e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1920  abortive phage resistance protein-like  30.53 
 
 
448 aa  156  7e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000340563  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3791  abortive phage resistance protein-like  30.75 
 
 
448 aa  156  7e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.618475  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7388  hypothetical protein  29.12 
 
 
440 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2870  hypothetical protein  28.79 
 
 
435 aa  154  4e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.716536  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0903  hypothetical protein  31.9 
 
 
429 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4361  hypothetical protein  28.09 
 
 
465 aa  144  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.77847 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1784  ATPase-like protein  28.21 
 
 
459 aa  137  4e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00463649  normal  0.498848 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3302  hypothetical protein  28.83 
 
 
428 aa  137  5e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1074  abortive phage resistance protein-like protein  28.91 
 
 
456 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.960814  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0079  abortive infection protein, putative  27.49 
 
 
433 aa  132  1.0000000000000001e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2132  abortive infection protein, putative  27.42 
 
 
432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.903649  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1948  abortive phage resistance protein-like protein  24.18 
 
 
454 aa  111  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4229  abortive infection protein  22.25 
 
 
405 aa  70.5  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1899  abortive infection protein, internal deletion  23.36 
 
 
394 aa  70.1  0.00000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136383  normal  0.598011 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3852  abortive infection protein  23.56 
 
 
394 aa  69.3  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000425466 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1616  abortive infection protein, internal deletion  23.41 
 
 
400 aa  67.4  0.0000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0255755 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3995  abortive infection protein, internal deletion  21.48 
 
 
388 aa  67  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0493  abortive infection protein  22.1 
 
 
407 aa  63.9  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2166  AAA ATPase  32 
 
 
445 aa  63.2  0.000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000280978  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0054  abortive infection protein  22.17 
 
 
407 aa  58.5  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0733  hypothetical protein  29.37 
 
 
437 aa  57  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00594005  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1118  SMC domain-containing protein  23.11 
 
 
368 aa  54.3  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.266234  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2014  hypothetical protein  31.71 
 
 
449 aa  51.2  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4680  hypothetical protein  28.9 
 
 
458 aa  50.1  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.105377  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2991  abortive infection protein  30.93 
 
 
380 aa  47.4  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0164345  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  28.77 
 
 
399 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1530  abortive infection protein  32.86 
 
 
392 aa  45.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00764911  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4828  ABC transporter related  31.37 
 
 
252 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2523  abortive infection protein  22.4 
 
 
478 aa  44.3  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.237288  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  33.33 
 
 
424 aa  44.7  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1824  DNA repair ATPase  38.1 
 
 
495 aa  43.5  0.007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>