40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0054 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_0493  abortive infection protein  81.33 
 
 
407 aa  705    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0054  abortive infection protein  100 
 
 
407 aa  838    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3852  abortive infection protein  38.42 
 
 
394 aa  281  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000425466 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1899  abortive infection protein, internal deletion  35.63 
 
 
394 aa  270  4e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136383  normal  0.598011 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1616  abortive infection protein, internal deletion  36.5 
 
 
400 aa  258  1e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0255755 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3995  abortive infection protein, internal deletion  31.34 
 
 
388 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2991  abortive infection protein  29.68 
 
 
380 aa  143  5e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0164345  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2870  hypothetical protein  24.22 
 
 
435 aa  123  4e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.716536  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0741  putative phage resistance protein  27.06 
 
 
417 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333006  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4229  abortive infection protein  27.59 
 
 
405 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3302  hypothetical protein  25.06 
 
 
428 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1557  hypothetical protein  26.41 
 
 
422 aa  114  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662923  normal  0.436276 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2148  hypothetical protein  25.76 
 
 
431 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.61865 
 
 
-
 
NC_002950  PG0079  abortive infection protein, putative  24.62 
 
 
433 aa  89.4  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0298  putative phage resistance protein  23.39 
 
 
422 aa  89  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.066915  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0050  hypothetical protein  23.92 
 
 
451 aa  88.6  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11638  abortive infection protein, putative  22.83 
 
 
438 aa  87.4  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4361  hypothetical protein  22.81 
 
 
465 aa  87  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.77847 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2208  hypothetical protein  23.04 
 
 
422 aa  84.7  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1294  hypothetical protein  22.35 
 
 
456 aa  83.2  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7388  hypothetical protein  22.52 
 
 
440 aa  82.8  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2132  abortive infection protein, putative  26.64 
 
 
432 aa  79  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.903649  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0995  RloA protein  23.29 
 
 
425 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0903  hypothetical protein  25.12 
 
 
429 aa  76.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2064  hypothetical protein  31.34 
 
 
421 aa  74.3  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.906065  normal  0.239178 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1948  abortive phage resistance protein-like protein  23.96 
 
 
454 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12600  hypothetical protein  20.91 
 
 
435 aa  60.8  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1041  ATPase-like  21.52 
 
 
447 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1784  ATPase-like protein  21.81 
 
 
459 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00463649  normal  0.498848 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3170  putative abortive phage resistance  28.67 
 
 
488 aa  54.7  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2014  hypothetical protein  25.76 
 
 
449 aa  53.1  0.000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3541  ATPase-like protein  21.55 
 
 
426 aa  49.7  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2166  AAA ATPase  26.36 
 
 
445 aa  49.3  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000280978  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4680  hypothetical protein  25 
 
 
458 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.105377  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2549  SMC domain protein  22.19 
 
 
315 aa  48.9  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0441079  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1530  abortive infection protein  24.88 
 
 
392 aa  46.6  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00764911  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0733  hypothetical protein  24.6 
 
 
437 aa  46.6  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00594005  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1074  abortive phage resistance protein-like protein  21.58 
 
 
456 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.960814  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0337  SMC domain protein  23.98 
 
 
427 aa  44.7  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1920  abortive phage resistance protein-like  21.27 
 
 
448 aa  43.5  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000340563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>