36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4361 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4361  hypothetical protein  100 
 
 
465 aa  937    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.77847 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0050  hypothetical protein  39.52 
 
 
451 aa  291  2e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7388  hypothetical protein  36.65 
 
 
440 aa  269  7e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1294  hypothetical protein  35.77 
 
 
456 aa  236  9e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2870  hypothetical protein  34.28 
 
 
435 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.716536  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2208  hypothetical protein  31.47 
 
 
422 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12600  hypothetical protein  32.7 
 
 
435 aa  209  8e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0741  putative phage resistance protein  30.67 
 
 
417 aa  207  2e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333006  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1557  hypothetical protein  31.68 
 
 
422 aa  204  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662923  normal  0.436276 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0298  putative phage resistance protein  30.34 
 
 
422 aa  189  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.066915  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0995  RloA protein  28.54 
 
 
425 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0903  hypothetical protein  30.62 
 
 
429 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2148  hypothetical protein  29.26 
 
 
431 aa  173  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.61865 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11638  abortive infection protein, putative  29.45 
 
 
438 aa  166  9e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0079  abortive infection protein, putative  28.73 
 
 
433 aa  164  2.0000000000000002e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2064  hypothetical protein  50.35 
 
 
421 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.906065  normal  0.239178 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1041  ATPase-like  26.83 
 
 
447 aa  141  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3541  ATPase-like protein  27.54 
 
 
426 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1074  abortive phage resistance protein-like protein  27.7 
 
 
456 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.960814  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2132  abortive infection protein, putative  25.89 
 
 
432 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.903649  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1784  ATPase-like protein  26.5 
 
 
459 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00463649  normal  0.498848 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1948  abortive phage resistance protein-like protein  25.9 
 
 
454 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1920  abortive phage resistance protein-like  25.6 
 
 
448 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000340563  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3791  abortive phage resistance protein-like  25.38 
 
 
448 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.618475  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3302  hypothetical protein  45.39 
 
 
428 aa  114  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1899  abortive infection protein, internal deletion  26.94 
 
 
394 aa  105  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136383  normal  0.598011 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4229  abortive infection protein  39.01 
 
 
405 aa  103  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1616  abortive infection protein, internal deletion  25.42 
 
 
400 aa  100  7e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0255755 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0493  abortive infection protein  22.73 
 
 
407 aa  89.4  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0054  abortive infection protein  22.81 
 
 
407 aa  87  6e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3995  abortive infection protein, internal deletion  22.83 
 
 
388 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3852  abortive infection protein  36.69 
 
 
394 aa  84  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000425466 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2166  AAA ATPase  30.43 
 
 
445 aa  63.9  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000280978  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2991  abortive infection protein  28.06 
 
 
380 aa  61.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0164345  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2014  hypothetical protein  32.33 
 
 
449 aa  52.8  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0024  recombination protein RecR  25.58 
 
 
373 aa  43.9  0.007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000424013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>