41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1920 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3791  abortive phage resistance protein-like  99.11 
 
 
448 aa  914    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.618475  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1920  abortive phage resistance protein-like  100 
 
 
448 aa  919    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000340563  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1074  abortive phage resistance protein-like protein  31.04 
 
 
456 aa  196  6e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.960814  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1948  abortive phage resistance protein-like protein  30.6 
 
 
454 aa  186  9e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1784  ATPase-like protein  29.74 
 
 
459 aa  176  8e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00463649  normal  0.498848 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0903  hypothetical protein  30.82 
 
 
429 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0741  putative phage resistance protein  28.93 
 
 
417 aa  169  1e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333006  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1557  hypothetical protein  29.62 
 
 
422 aa  166  5.9999999999999996e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662923  normal  0.436276 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2148  hypothetical protein  29.02 
 
 
431 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.61865 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0995  RloA protein  29.05 
 
 
425 aa  162  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0298  putative phage resistance protein  27.96 
 
 
422 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.066915  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1041  ATPase-like  30.31 
 
 
447 aa  160  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11638  abortive infection protein, putative  27.86 
 
 
438 aa  160  4e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2064  hypothetical protein  29.14 
 
 
421 aa  159  9e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.906065  normal  0.239178 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3541  ATPase-like protein  28.48 
 
 
426 aa  159  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12600  hypothetical protein  30.43 
 
 
435 aa  158  2e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0079  abortive infection protein, putative  28.34 
 
 
433 aa  152  8.999999999999999e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2208  hypothetical protein  27.46 
 
 
422 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2870  hypothetical protein  28.29 
 
 
435 aa  138  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.716536  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0050  hypothetical protein  26.86 
 
 
451 aa  137  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4361  hypothetical protein  25.6 
 
 
465 aa  127  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.77847 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3302  hypothetical protein  29.26 
 
 
428 aa  125  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1294  hypothetical protein  27.95 
 
 
456 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7388  hypothetical protein  26.43 
 
 
440 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3852  abortive infection protein  23.37 
 
 
394 aa  85.1  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000425466 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1899  abortive infection protein, internal deletion  24.72 
 
 
394 aa  83.2  0.000000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136383  normal  0.598011 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2014  hypothetical protein  24.26 
 
 
449 aa  75.5  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3995  abortive infection protein, internal deletion  21.85 
 
 
388 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1616  abortive infection protein, internal deletion  24.02 
 
 
400 aa  73.6  0.000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0255755 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0024  recombination protein RecR  22.45 
 
 
373 aa  67.4  0.0000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000424013  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2166  AAA ATPase  30.08 
 
 
445 aa  65.9  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000280978  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4229  abortive infection protein  23.23 
 
 
405 aa  64.3  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0493  abortive infection protein  23.56 
 
 
407 aa  61.6  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0054  abortive infection protein  21.27 
 
 
407 aa  59.3  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4680  hypothetical protein  29.25 
 
 
458 aa  58.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.105377  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2132  abortive infection protein, putative  26.98 
 
 
432 aa  58.2  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.903649  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2912  SMC protein-like  22.98 
 
 
418 aa  56.6  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.492401  normal  0.0605125 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2991  abortive infection protein  21.46 
 
 
380 aa  55.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0164345  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0733  hypothetical protein  28.1 
 
 
437 aa  54.3  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00594005  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2851  SMC domain protein  26.72 
 
 
423 aa  50.1  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0808223 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1288  SMC domain protein  21.32 
 
 
417 aa  44.3  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0947514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>