44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1948 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_1948  abortive phage resistance protein-like protein  100 
 
 
454 aa  916    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3791  abortive phage resistance protein-like  31.04 
 
 
448 aa  176  5e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.618475  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1920  abortive phage resistance protein-like  30.6 
 
 
448 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000340563  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1074  abortive phage resistance protein-like protein  30.26 
 
 
456 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.960814  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1784  ATPase-like protein  29.12 
 
 
459 aa  169  9e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00463649  normal  0.498848 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1557  hypothetical protein  27.03 
 
 
422 aa  144  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662923  normal  0.436276 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2064  hypothetical protein  27.51 
 
 
421 aa  144  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.906065  normal  0.239178 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0995  RloA protein  26.75 
 
 
425 aa  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12600  hypothetical protein  26.94 
 
 
435 aa  141  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2870  hypothetical protein  26.75 
 
 
435 aa  138  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.716536  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0903  hypothetical protein  25.63 
 
 
429 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2208  hypothetical protein  25.71 
 
 
422 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2148  hypothetical protein  27.67 
 
 
431 aa  130  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.61865 
 
 
-
 
NC_002950  PG0079  abortive infection protein, putative  25.81 
 
 
433 aa  129  1.0000000000000001e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0741  putative phage resistance protein  25.92 
 
 
417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333006  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0050  hypothetical protein  26.51 
 
 
451 aa  125  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3541  ATPase-like protein  25 
 
 
426 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4361  hypothetical protein  25.9 
 
 
465 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.77847 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0298  putative phage resistance protein  23.86 
 
 
422 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.066915  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7388  hypothetical protein  24.95 
 
 
440 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1294  hypothetical protein  26.65 
 
 
456 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1041  ATPase-like  23.53 
 
 
447 aa  104  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11638  abortive infection protein, putative  24.67 
 
 
438 aa  103  5e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2132  abortive infection protein, putative  25.65 
 
 
432 aa  100  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.903649  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4229  abortive infection protein  23.38 
 
 
405 aa  81.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3302  hypothetical protein  29.3 
 
 
428 aa  78.6  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2014  hypothetical protein  25.83 
 
 
449 aa  76.6  0.0000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0493  abortive infection protein  23.48 
 
 
407 aa  75.9  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2166  AAA ATPase  33.09 
 
 
445 aa  68.6  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000280978  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3852  abortive infection protein  21.03 
 
 
394 aa  65.1  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000425466 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4680  hypothetical protein  30.08 
 
 
458 aa  63.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.105377  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0054  abortive infection protein  23.96 
 
 
407 aa  61.6  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1616  abortive infection protein, internal deletion  21.1 
 
 
400 aa  59.7  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0255755 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2275  hypothetical protein  27.15 
 
 
315 aa  50.8  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.972527  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2991  abortive infection protein  21.71 
 
 
380 aa  46.2  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0164345  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3562  ATPase-like  40.74 
 
 
394 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76495  normal  0.327688 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  33.33 
 
 
448 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  33.33 
 
 
448 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2311  SMC domain protein  23.5 
 
 
397 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8073  ATPase-like protein  28.47 
 
 
362 aa  43.9  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1573  SMC domain-containing protein  38.71 
 
 
373 aa  43.9  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0501523  normal  0.47865 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3397  hypothetical protein  26.19 
 
 
395 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1118  SMC domain-containing protein  30.77 
 
 
368 aa  43.5  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.266234  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2706  hypothetical protein  26.19 
 
 
395 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>