34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4680 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4680  hypothetical protein  100 
 
 
458 aa  941    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.105377  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0733  hypothetical protein  37.56 
 
 
437 aa  295  1e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00594005  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2166  AAA ATPase  36.28 
 
 
445 aa  265  1e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000280978  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2014  hypothetical protein  33.7 
 
 
449 aa  228  2e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11638  abortive infection protein, putative  29.13 
 
 
438 aa  63.9  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0079  abortive infection protein, putative  23.78 
 
 
433 aa  63.9  0.000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1948  abortive phage resistance protein-like protein  30.08 
 
 
454 aa  63.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1074  abortive phage resistance protein-like protein  31.85 
 
 
456 aa  62  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.960814  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2870  hypothetical protein  32.39 
 
 
435 aa  61.2  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.716536  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4229  abortive infection protein  27.21 
 
 
405 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3170  putative abortive phage resistance  25.52 
 
 
488 aa  55.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0995  RloA protein  26.32 
 
 
425 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2064  hypothetical protein  27.61 
 
 
421 aa  53.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.906065  normal  0.239178 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2208  hypothetical protein  26.47 
 
 
422 aa  51.6  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0493  abortive infection protein  23.66 
 
 
407 aa  51.2  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0050  hypothetical protein  25.93 
 
 
451 aa  50.4  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12600  hypothetical protein  27.03 
 
 
435 aa  49.3  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7388  hypothetical protein  28.68 
 
 
440 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3541  ATPase-like protein  28.42 
 
 
426 aa  48.5  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1557  hypothetical protein  28.46 
 
 
422 aa  48.5  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662923  normal  0.436276 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0054  abortive infection protein  25 
 
 
407 aa  48.9  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1041  ATPase-like  30.89 
 
 
447 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0741  putative phage resistance protein  28.1 
 
 
417 aa  47.8  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333006  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0024  recombination protein RecR  28.1 
 
 
373 aa  47.4  0.0005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000424013  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1784  ATPase-like protein  25.81 
 
 
459 aa  47.8  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00463649  normal  0.498848 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3302  hypothetical protein  26.05 
 
 
428 aa  47.4  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1824  DNA repair ATPase  35.37 
 
 
495 aa  47  0.0008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0903  hypothetical protein  25 
 
 
429 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1235  SMC domain-containing protein  43.64 
 
 
359 aa  46.6  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3791  abortive phage resistance protein-like  29.25 
 
 
448 aa  45.8  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.618475  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1920  abortive phage resistance protein-like  29.25 
 
 
448 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000340563  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4080  hypothetical protein  43.14 
 
 
397 aa  45.1  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3008  hypothetical protein  30 
 
 
582 aa  43.5  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568683  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0298  putative phage resistance protein  27.82 
 
 
422 aa  43.1  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.066915  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>