142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8073 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8073  ATPase-like protein  100 
 
 		 362 aa  706    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  28.91 
 
 		 369 aa  95.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1320  SMC domain protein  35.89 
 
 		 422 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3600  ATPase-like protein  26.58 
 
 		 416 aa  76.3  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2311  SMC domain protein  29.31 
 
 		 397 aa  75.5  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  26.75 
 
 		 380 aa  70.1  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  26.01 
 
 		 362 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  26.1 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2290  hypothetical protein  25.66 
 
 		 409 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3924  ATPase-like protein  34.46 
 
 		 336 aa  63.9  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.801052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3070  SMC domain-containing protein  27.53 
 
 		 365 aa  63.5  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0310  SMC domain protein  22.87 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1131  SMC domain protein  32.78 
 
 		 450 aa  60.1  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.526004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02963  hypothetical protein  25.15 
 
 		 376 aa  60.1  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  22.29 
 
 		 399 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1458  hypothetical protein  27.44 
 
 		 431 aa  58.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1947  ATPase, RecF-like protein  27.48 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.942384  normal  0.334746 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2545  ATPase-like  29.01 
 
 		 419 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000977998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4093  SMC domain protein  35.15 
 
 		 454 aa  54.7  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136453  normal  0.0462835 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  42.86 
 
 		 386 aa  53.9  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0592  hypothetical protein  28.95 
 
 		 361 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  23.37 
 
 		 367 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  23.37 
 
 		 367 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1302  ATPase-like  26.83 
 
 		 419 aa  53.1  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000145655  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  24.01 
 
 		 411 aa  52.8  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  26.11 
 
 		 448 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1288  SMC domain protein  27.91 
 
 		 417 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0947514  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  22.49 
 
 		 378 aa  52.8  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  26.11 
 
 		 448 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  21.99 
 
 		 378 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  25.28 
 
 		 424 aa  51.6  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1846  ATPase-like protein  25.64 
 
 		 409 aa  51.2  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0053  SMC domain protein  42.65 
 
 		 397 aa  51.2  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0197  ATPase-like protein  24.84 
 
 		 367 aa  50.4  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.875501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2161  hypothetical protein  26.22 
 
 		 392 aa  50.1  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587323  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4235  ATPase-like protein  38.27 
 
 		 187 aa  50.1  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.837298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2912  SMC protein-like  27.98 
 
 		 418 aa  50.1  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.492401  normal  0.0605125 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4110  ATPase-like protein  26.6 
 
 		 427 aa  50.1  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000135453 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0765  chromosome segregation protein SMC  51.02 
 
 		 1189 aa  49.7  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.430738 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1775  endonuclease III  23.01 
 
 		 357 aa  49.7  0.00008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17856  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  25.8 
 
 		 370 aa  48.9  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  24.55 
 
 		 394 aa  49.3  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  50 
 
 		 1185 aa  49.3  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  27.17 
 
 		 378 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3622  SMC domain protein  24.15 
 
 		 363 aa  48.9  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4659  hypothetical protein  28.65 
 
 		 385 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478904  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0765  hypothetical protein  23.89 
 
 		 365 aa  48.5  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.63543  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6253  ATPase, RecF-like protein  26.37 
 
 		 393 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5526  hypothetical protein  27.04 
 
 		 384 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768664  normal  0.0253524 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  31.66 
 
 		 390 aa  47.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0343  hypothetical protein  27.01 
 
 		 385 aa  47.8  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.261126 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1890  hypothetical protein  38.71 
 
 		 389 aa  47.4  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0931  hypothetical protein  34.15 
 
 		 385 aa  47.4  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0331  chromosome segregation protein SMC  51.11 
 
 		 1201 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.535871  normal  0.0329796 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2640  chromosome segregation protein SMC  48.89 
 
 		 1192 aa  47.4  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3822  hypothetical protein  23.87 
 
 		 370 aa  47.4  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0324063 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3749  hypothetical protein  31.36 
 
 		 394 aa  47  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  22.85 
 
 		 368 aa  47  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0121  ATPase-like protein  36.05 
 
 		 407 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.188452 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3860  ATPase-like  41.18 
 
 		 370 aa  46.6  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.247695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  26.52 
 
 		 390 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  26.52 
 
 		 390 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3499  SMC domain protein  23.69 
 
 		 363 aa  46.6  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0337  SMC domain protein  36.17 
 
 		 427 aa  46.6  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  32 
 
 		 385 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  45.1 
 
 		 1185 aa  45.8  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0490  hypothetical protein  25.39 
 
 		 416 aa  45.8  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  47.06 
 
 		 1176 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1792  hypothetical protein  26.24 
 
 		 390 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2697  AAA ATPase  29.66 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  45.45 
 
 		 1191 aa  45.4  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4237  hypothetical protein  24.18 
 
 		 370 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  47.06 
 
 		 1176 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  48.98 
 
 		 1189 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  48.98 
 
 		 1189 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  48.98 
 
 		 1189 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  48.98 
 
 		 1189 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  51.02 
 
 		 1173 aa  45.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  48.98 
 
 		 1189 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  48.98 
 
 		 1189 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  25.21 
 
 		 388 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1016  SMC domain-containing protein  26.3 
 
 		 386 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0527217  normal  0.402685 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0855  chromosome segregation protein SMC  50 
 
 		 1200 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00379552  normal  0.0307887 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  48.98 
 
 		 1189 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  34.83 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  48.98 
 
 		 1189 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  48.98 
 
 		 1189 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  48.98 
 
 		 1189 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  50 
 
 		 1403 aa  44.3  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3546  AAA ATPase  22.73 
 
 		 573 aa  44.7  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0847793  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4080  hypothetical protein  32.08 
 
 		 397 aa  44.7  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0507  hypothetical protein  24.93 
 
 		 373 aa  44.3  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5019  ATPase, RecF-like protein  30.72 
 
 		 388 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  45.83 
 
 		 1168 aa  44.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1025  hypothetical protein  28.97 
 
 		 362 aa  43.9  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000305528 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1754  hypothetical protein  22.85 
 
 		 405 aa  43.9  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  46.94 
 
 		 1164 aa  43.9  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1948  abortive phage resistance protein-like protein  28.47 
 
 		 454 aa  43.9  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  38.46 
 
 		 647 aa  43.9  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  48.98 
 
 		 1189 aa  43.9  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>