56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2290 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2290  hypothetical protein  100 
 
 		 409 aa  835    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3600  ATPase-like protein  26.49 
 
 		 416 aa  70.1  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8073  ATPase-like protein  25.66 
 
 		 362 aa  66.6  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0337  SMC domain protein  23.92 
 
 		 427 aa  66.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4093  SMC domain protein  26.95 
 
 		 454 aa  58.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136453  normal  0.0462835 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1131  SMC domain protein  23.47 
 
 		 450 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.526004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2912  SMC protein-like  27.04 
 
 		 418 aa  57.4  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.492401  normal  0.0605125 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2851  SMC domain protein  30.6 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0808223 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1288  SMC domain protein  21.29 
 
 		 417 aa  57  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0947514  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  23.05 
 
 		 382 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  21.7 
 
 		 378 aa  55.1  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  23.32 
 
 		 377 aa  54.7  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2311  SMC domain protein  23.1 
 
 		 397 aa  54.7  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  25.14 
 
 		 382 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  25.14 
 
 		 382 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1302  ATPase-like  24.33 
 
 		 419 aa  53.9  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000145655  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  20.95 
 
 		 388 aa  53.1  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1950  hypothetical protein  27.52 
 
 		 460 aa  52  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00278389  hitchhiker  1.70461e-18 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1095  hypothetical protein  27.62 
 
 		 453 aa  51.2  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00653553  hitchhiker  0.00178411 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  23.16 
 
 		 386 aa  50.4  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  23.23 
 
 		 399 aa  50.1  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1947  ATPase, RecF-like protein  21.29 
 
 		 388 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.942384  normal  0.334746 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  28.57 
 
 		 395 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4235  ATPase-like protein  33.77 
 
 		 187 aa  48.5  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.837298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3070  SMC domain-containing protein  20.67 
 
 		 365 aa  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  22.92 
 
 		 411 aa  47.8  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0820  hypothetical protein  20.33 
 
 		 395 aa  47.8  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0310  SMC domain protein  24.68 
 
 		 412 aa  47.4  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2974  hypothetical protein  22.55 
 
 		 393 aa  47  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00544047  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  30.93 
 
 		 369 aa  47  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.408353 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2549  SMC domain protein  24.26 
 
 		 315 aa  47  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0441079  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  22.71 
 
 		 364 aa  46.6  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1769  DNA repair protein RecN  36.62 
 
 		 557 aa  46.2  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3220  SMC domain-containing protein  22.75 
 
 		 394 aa  45.8  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0344  hypothetical protein  28.85 
 
 		 378 aa  45.4  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  25.19 
 
 		 368 aa  45.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1320  SMC domain protein  37.1 
 
 		 422 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  25.27 
 
 		 380 aa  44.7  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2545  ATPase-like  29.67 
 
 		 419 aa  44.3  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000977998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3924  ATPase-like protein  20.72 
 
 		 336 aa  43.9  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.801052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  21.9 
 
 		 448 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  21.9 
 
 		 448 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1300  DNA repair protein RecN  34.65 
 
 		 549 aa  43.1  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00383913  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2333  DNA repair protein RecN  34.65 
 
 		 549 aa  43.1  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1679  hypothetical protein  29.52 
 
 		 351 aa  43.1  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489043 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2214  DNA repair protein RecN  34.65 
 
 		 549 aa  43.1  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.725261  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3319  DNA repair protein RecN  34.65 
 
 		 549 aa  43.1  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3286  DNA repair protein RecN  34.65 
 
 		 549 aa  43.1  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0539815  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1107  DNA repair protein RecN  34.65 
 
 		 549 aa  43.1  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0249547  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0492  DNA repair protein RecN  34.65 
 
 		 549 aa  43.1  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1714  DNA repair protein RecN  26.36 
 
 		 557 aa  43.1  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3329  DNA repair protein RecN  34.65 
 
 		 549 aa  43.1  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0713  DNA repair protein RecN  42.59 
 
 		 549 aa  43.1  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.685992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2641  DNA repair protein RecN  42.59 
 
 		 549 aa  43.1  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0743  DNA repair protein RecN  42.59 
 
 		 549 aa  43.1  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259434  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0259  DNA repair protein RecN  42.59 
 
 		 549 aa  43.1  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255628  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>