115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4110 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4110  ATPase-like protein  100 
 
 		 427 aa  872    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000135453 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1458  hypothetical protein  31.36 
 
 		 431 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0053  SMC domain protein  24.11 
 
 		 397 aa  86.7  8e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0112  hypothetical protein  26.65 
 
 		 430 aa  85.1  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0310  SMC domain protein  22.47 
 
 		 412 aa  82.8  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  24.12 
 
 		 394 aa  81.6  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02963  hypothetical protein  22.86 
 
 		 376 aa  76.6  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  25.58 
 
 		 399 aa  76.6  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3220  SMC domain-containing protein  24.61 
 
 		 394 aa  76.3  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  23.78 
 
 		 398 aa  75.9  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  20.05 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1846  ATPase-like protein  23.92 
 
 		 409 aa  74.3  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  28.25 
 
 		 369 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3397  hypothetical protein  22.94 
 
 		 395 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  25.06 
 
 		 395 aa  71.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  28.87 
 
 		 386 aa  71.2  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2706  hypothetical protein  23.01 
 
 		 395 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  27.27 
 
 		 393 aa  70.5  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  26.07 
 
 		 424 aa  70.1  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3708  ATPase-like protein  26.15 
 
 		 364 aa  68.2  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3749  hypothetical protein  31.89 
 
 		 394 aa  67.4  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  28.14 
 
 		 448 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  35.21 
 
 		 409 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  28.14 
 
 		 448 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4093  SMC domain protein  24.57 
 
 		 454 aa  64.3  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136453  normal  0.0462835 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  32.14 
 
 		 378 aa  64.3  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  28.64 
 
 		 364 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  25.63 
 
 		 411 aa  63.2  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  24.64 
 
 		 399 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3924  ATPase-like protein  24.91 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.801052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1302  ATPase-like  24.41 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000145655  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8073  ATPase-like protein  26.6 
 
 		 362 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3600  ATPase-like protein  23.27 
 
 		 416 aa  60.5  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2311  SMC domain protein  25.9 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  29.46 
 
 		 377 aa  59.3  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  19.91 
 
 		 378 aa  59.3  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  31.58 
 
 		 367 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  31.58 
 
 		 367 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  27.42 
 
 		 368 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1025  hypothetical protein  28.45 
 
 		 362 aa  57.4  0.0000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000305528 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0490  hypothetical protein  29.71 
 
 		 416 aa  57.4  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0507  hypothetical protein  22.81 
 
 		 373 aa  57  0.0000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2912  SMC protein-like  22.32 
 
 		 418 aa  57  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.492401  normal  0.0605125 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4237  hypothetical protein  33.06 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3822  hypothetical protein  33.06 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0324063 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0146  ATPase-like  30.5 
 
 		 226 aa  56.2  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0765  hypothetical protein  33.04 
 
 		 365 aa  56.2  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.63543  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  31.86 
 
 		 382 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  31.86 
 
 		 382 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3499  SMC domain protein  31.3 
 
 		 363 aa  54.7  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3552  hypothetical protein  25.39 
 
 		 416 aa  54.7  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3622  SMC domain protein  24.87 
 
 		 363 aa  54.7  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  31.86 
 
 		 382 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  25.28 
 
 		 398 aa  53.5  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2613  SMC domain protein  28.45 
 
 		 369 aa  53.1  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1754  hypothetical protein  25.63 
 
 		 405 aa  52.8  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3070  SMC domain-containing protein  37.93 
 
 		 365 aa  52.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4659  hypothetical protein  25.13 
 
 		 385 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478904  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  38.71 
 
 		 430 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2290  hypothetical protein  24.67 
 
 		 409 aa  52  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1226  hypothetical protein  26.34 
 
 		 384 aa  51.6  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  28.57 
 
 		 378 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0121  ATPase-like protein  38.24 
 
 		 407 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.188452 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0197  ATPase-like protein  28.08 
 
 		 367 aa  52  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.875501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3562  ATPase-like  36.9 
 
 		 394 aa  50.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76495  normal  0.327688 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1775  endonuclease III  27.01 
 
 		 357 aa  50.8  0.00005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17856  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4526  hypothetical protein  30.86 
 
 		 452 aa  50.4  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  28.47 
 
 		 380 aa  50.1  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2014  hypothetical protein  24.83 
 
 		 449 aa  49.7  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  24.18 
 
 		 370 aa  48.5  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0562  hypothetical protein  25.41 
 
 		 370 aa  48.5  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.260913  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1320  SMC domain protein  41.07 
 
 		 422 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2314  hypothetical protein  29.11 
 
 		 376 aa  47.8  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198863 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0343  hypothetical protein  25.25 
 
 		 385 aa  47.8  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.261126 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  31.3 
 
 		 397 aa  47.8  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  30.56 
 
 		 362 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2954  putative exonuclease  32.89 
 
 		 659 aa  47.4  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1950  hypothetical protein  32.18 
 
 		 460 aa  47  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00278389  hitchhiker  1.70461e-18 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  22.92 
 
 		 388 aa  47  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1680  hypothetical protein  31.58 
 
 		 771 aa  47  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0387712  normal  0.041067 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47820  hypothetical protein  24.06 
 
 		 395 aa  47  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.088572  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1288  SMC domain protein  30.77 
 
 		 417 aa  47  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0947514  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2545  ATPase-like  40 
 
 		 419 aa  46.6  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000977998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.91 
 
 		 594 aa  45.8  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4266  ATPase-like protein  39.39 
 
 		 361 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4235  ATPase-like protein  32.94 
 
 		 187 aa  45.8  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.837298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3668  ABC transporter related  33.33 
 
 		 542 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39123  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1745  hypothetical protein  42 
 
 		 323 aa  45.8  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814918  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3074  ABC transporter related  28.57 
 
 		 552 aa  45.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  0.0994868 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1964  hypothetical protein  31.68 
 
 		 203 aa  45.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0046  GTP-binding protein LepA  30.11 
 
 		 276 aa  45.8  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0304076  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0673  ATP-dependent endonuclease family protein  28.89 
 
 		 619 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.924756 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1516  ATP-dependent endonuclease family protein  33.33 
 
 		 586 aa  45.8  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.749e-16 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2742  ABC transporter-related protein  33.33 
 
 		 563 aa  44.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676431 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11501  macrolide ABC transporter ATP-binding protein  32.1 
 
 		 542 aa  44.7  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.126079 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3087  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.78 
 
 		 605 aa  44.7  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  28 
 
 		 385 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3668  hypothetical protein  35.71 
 
 		 408 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1131  SMC domain protein  27.14 
 
 		 450 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.526004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2446  ABC transporter related  32.1 
 
 		 542 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>