100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2851 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2851  SMC domain protein  100 
 
 		 423 aa  860    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0808223 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0539  SMC domain-containing protein  29.4 
 
 		 391 aa  162  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  21.4 
 
 		 411 aa  67  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  28.57 
 
 		 369 aa  63.2  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3600  ATPase-like protein  23.73 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  30.77 
 
 		 399 aa  59.7  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1302  ATPase-like  29.82 
 
 		 419 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000145655  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2290  hypothetical protein  30.6 
 
 		 409 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3220  SMC domain-containing protein  21.54 
 
 		 394 aa  57.4  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2545  ATPase-like  31.13 
 
 		 419 aa  57.4  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000977998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1288  SMC domain protein  28 
 
 		 417 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0947514  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  24.74 
 
 		 380 aa  54.7  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0900  AAA ATPase  49.06 
 
 		 382 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0926  AAA ATPase  49.06 
 
 		 382 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  23.87 
 
 		 382 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1472  ATPase-like protein  50 
 
 		 426 aa  53.9  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0862565  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2311  SMC domain protein  22 
 
 		 397 aa  53.1  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0777  ATPase-like protein  45 
 
 		 381 aa  53.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2613  SMC domain protein  22.58 
 
 		 369 aa  52.4  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4235  ATPase-like protein  32.43 
 
 		 187 aa  52.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.837298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  20.9 
 
 		 393 aa  51.6  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1413  hypothetical protein  56.82 
 
 		 396 aa  51.6  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.923641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6914  initiation factor 2 associated domain-containing protein  45.83 
 
 		 680 aa  51.2  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0748  hypothetical protein  54.76 
 
 		 377 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1320  SMC domain protein  22.37 
 
 		 422 aa  50.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1132  hypothetical protein  34.33 
 
 		 358 aa  50.1  0.00008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0249333  normal  0.954197 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3946  hypothetical protein  42.62 
 
 		 356 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0112  hypothetical protein  26.73 
 
 		 430 aa  49.7  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4466  ABC transporter-like  20.45 
 
 		 351 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.486534  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  29.03 
 
 		 424 aa  48.9  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3070  SMC domain-containing protein  30.65 
 
 		 365 aa  48.9  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  31.82 
 
 		 390 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  31.82 
 
 		 390 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0592  hypothetical protein  37.1 
 
 		 361 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2035  hypothetical protein  20 
 
 		 388 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4093  SMC domain protein  29.93 
 
 		 454 aa  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136453  normal  0.0462835 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  30.65 
 
 		 362 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  43.9 
 
 		 388 aa  47.4  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1131  SMC domain protein  30.26 
 
 		 450 aa  47.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.526004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  50 
 
 		 647 aa  47.4  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3860  hypothetical protein  44.68 
 
 		 345 aa  47  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.925149  normal  0.074002 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003897  hypothetical protein  22.69 
 
 		 643 aa  47  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  44.68 
 
 		 403 aa  46.6  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2912  SMC protein-like  26.77 
 
 		 418 aa  46.6  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.492401  normal  0.0605125 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1235  SMC domain-containing protein  48.84 
 
 		 359 aa  46.6  0.0008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1107  AAA ATPase  51.16 
 
 		 571 aa  46.6  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0989005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  40.74 
 
 		 406 aa  46.6  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1098  hypothetical protein  33.87 
 
 		 410 aa  46.6  0.0009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  21.56 
 
 		 399 aa  46.6  0.0009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  22.97 
 
 		 382 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  22.97 
 
 		 382 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0937  ATPase-like protein  40.35 
 
 		 356 aa  46.6  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  21.61 
 
 		 394 aa  45.8  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0144  ATPase  46.51 
 
 		 565 aa  45.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  22.02 
 
 		 556 aa  45.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1947  ATPase, RecF-like protein  41.46 
 
 		 388 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.942384  normal  0.334746 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  41.46 
 
 		 390 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2281  ATPase  30.65 
 
 		 390 aa  45.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3672  hypothetical protein  48.84 
 
 		 378 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0003  recombination protein F  39.71 
 
 		 360 aa  45.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0188151  hitchhiker  0.0000523089 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1861  hypothetical protein  50 
 
 		 353 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  44.74 
 
 		 367 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  55.26 
 
 		 564 aa  45.1  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3140  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  47.5 
 
 		 681 aa  44.7  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239895  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  32.08 
 
 		 607 aa  44.7  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2549  SMC domain protein  44 
 
 		 315 aa  44.7  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0441079  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  39.34 
 
 		 377 aa  44.7  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  44.74 
 
 		 367 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0507  hypothetical protein  33.33 
 
 		 373 aa  44.7  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1792  hypothetical protein  37.21 
 
 		 390 aa  44.7  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  44 
 
 		 935 aa  44.3  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2974  hypothetical protein  27.93 
 
 		 393 aa  44.7  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00544047  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0229  hypothetical protein  41.46 
 
 		 386 aa  44.3  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  42 
 
 		 640 aa  44.3  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0005  DNA replication and repair protein RecF  28.89 
 
 		 401 aa  44.7  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1025  hypothetical protein  27.13 
 
 		 362 aa  43.9  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000305528 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1784  ATPase-like protein  28.57 
 
 		 459 aa  43.9  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00463649  normal  0.498848 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0820  hypothetical protein  39.02 
 
 		 395 aa  43.9  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0257  hypothetical protein  37.5 
 
 		 159 aa  43.9  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00160125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2903  ATP-binding protein involved in virulence-like protein  47.73 
 
 		 453 aa  43.9  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47820  hypothetical protein  29.23 
 
 		 395 aa  43.9  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.088572  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1950  hypothetical protein  46.34 
 
 		 460 aa  43.9  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00278389  hitchhiker  1.70461e-18 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0036  DNA repair protein RecN  51.16 
 
 		 532 aa  44.3  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  37.5 
 
 		 626 aa  43.9  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2009  hypothetical protein  28.83 
 
 		 922 aa  43.9  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1779  DNA repair protein RecN  47.62 
 
 		 581 aa  43.9  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.666721 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4760  SMC domain-containing protein  36.36 
 
 		 533 aa  43.5  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1095  hypothetical protein  43.9 
 
 		 453 aa  43.5  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00653553  hitchhiker  0.00178411 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5508  DNA replication and repair protein RecF  31.43 
 
 		 368 aa  43.5  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  45.95 
 
 		 409 aa  43.5  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2238  recombination protein F  48.78 
 
 		 359 aa  43.5  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4266  ATPase-like protein  39.68 
 
 		 361 aa  43.5  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3397  hypothetical protein  34.43 
 
 		 395 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2931  hypothetical protein  29.03 
 
 		 382 aa  43.5  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3924  ATPase-like protein  25.58 
 
 		 336 aa  43.5  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.801052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  40 
 
 		 626 aa  43.5  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31021  Protein involved in recombination repair  38.18 
 
 		 1063 aa  43.1  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.109982 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0644  DNA repair protein RecN  45.83 
 
 		 592 aa  43.1  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.659362  normal  0.0659728 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1041  ATPase-like  27.55 
 
 		 447 aa  43.1  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2057  putative ATPase  40.43 
 
 		 341 aa  43.1  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>