52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0748 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0748  hypothetical protein  100 
 
 		 377 aa  766    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0777  ATPase-like protein  71.99 
 
 		 381 aa  534  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1413  hypothetical protein  44.01 
 
 		 396 aa  317  3e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.923641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3946  hypothetical protein  44.74 
 
 		 356 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1861  hypothetical protein  33.33 
 
 		 353 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3672  hypothetical protein  31.22 
 
 		 378 aa  151  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4266  ATPase-like protein  31.82 
 
 		 361 aa  139  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3860  hypothetical protein  25.23 
 
 		 345 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.925149  normal  0.074002 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1569  ATPase-like protein  25.71 
 
 		 354 aa  102  7e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.768338  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0732  hypothetical protein  27.32 
 
 		 399 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.699164  normal  0.348353 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0703  hypothetical protein  27.32 
 
 		 399 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1544  ATPase-like protein  26.41 
 
 		 391 aa  91.3  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0152832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2057  putative ATPase  24.61 
 
 		 341 aa  84  0.000000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0488  ATPase-like protein  30.77 
 
 		 350 aa  82  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0926  AAA ATPase  46.97 
 
 		 382 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0900  AAA ATPase  46.97 
 
 		 382 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1141  ATPase-like protein  65.85 
 
 		 366 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.956923  normal  0.756779 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0937  ATPase-like protein  27.34 
 
 		 356 aa  56.6  0.0000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1362  DNA replication and repair protein RecF  46.81 
 
 		 339 aa  52  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  23.34 
 
 		 369 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2851  SMC domain protein  54.76 
 
 		 423 aa  50.8  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0808223 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4760  SMC domain-containing protein  45.45 
 
 		 533 aa  47.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1457  putative ATPase  29.06 
 
 		 347 aa  47  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2994  ATP-dependent OLD family endonuclease  47.73 
 
 		 608 aa  47  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0002  DNA replication and repair protein RecF  36.67 
 
 		 350 aa  46.6  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.617644  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0003  DNA replication and repair protein RecF  36.67 
 
 		 350 aa  46.6  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00329262  decreased coverage  0.000397503 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00030  recF protein  50 
 
 		 378 aa  46.2  0.0008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.172429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0539  SMC domain-containing protein  34.43 
 
 		 391 aa  45.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0003  recombination protein F  47.5 
 
 		 364 aa  45.4  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.26612  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00030  recF protein  36.96 
 
 		 376 aa  45.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000612951  decreased coverage  0.0000132668 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0003  recombination protein F  47.5 
 
 		 364 aa  45.4  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0185053  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3860  ATPase-like  48.84 
 
 		 370 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.247695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1095  hypothetical protein  32.35 
 
 		 453 aa  44.3  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00653553  hitchhiker  0.00178411 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0004  recombination protein F  31.96 
 
 		 370 aa  44.7  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.188075  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0004  recombination protein F  31.96 
 
 		 370 aa  44.7  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.320094  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1132  hypothetical protein  45.65 
 
 		 358 aa  44.7  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0249333  normal  0.954197 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2290  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.87 
 
 		 669 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1950  hypothetical protein  33.33 
 
 		 460 aa  44.3  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00278389  hitchhiker  1.70461e-18 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  48.84 
 
 		 406 aa  44.7  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0742  antigen PgaA  51.16 
 
 		 445 aa  44.3  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  40 
 
 		 758 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0764  hypothetical protein  44.44 
 
 		 371 aa  43.9  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0004  DNA replication and repair protein RecF  25.33 
 
 		 420 aa  43.9  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000011529  hitchhiker  0.000000444236 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0282  AAA ATPase  22.92 
 
 		 378 aa  43.9  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  28.24 
 
 		 565 aa  43.5  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  36.84 
 
 		 390 aa  43.1  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2610  hypothetical protein  35.59 
 
 		 744 aa  43.1  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  36.73 
 
 		 650 aa  43.1  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0004  DNA replication and repair protein RecF  43.4 
 
 		 373 aa  43.1  0.008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0003  DNA replication and repair protein RecF  37.5 
 
 		 372 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2750  DNA replication and repair protein RecF  44.19 
 
 		 387 aa  42.7  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.433504  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4732  hypothetical protein  31.94 
 
 		 387 aa  42.7  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>