33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1569 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1569  ATPase-like protein  100 
 
 
354 aa  706    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.768338  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4266  ATPase-like protein  28.57 
 
 
361 aa  116  6.9999999999999995e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1861  hypothetical protein  27.03 
 
 
353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0488  ATPase-like protein  27.2 
 
 
350 aa  113  5e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3672  hypothetical protein  28.09 
 
 
378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0777  ATPase-like protein  24.54 
 
 
381 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0748  hypothetical protein  25.71 
 
 
377 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3946  hypothetical protein  25.55 
 
 
356 aa  99.8  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1141  ATPase-like protein  24.51 
 
 
366 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.956923  normal  0.756779 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2057  putative ATPase  26.44 
 
 
341 aa  78.2  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0703  hypothetical protein  37.1 
 
 
399 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0732  hypothetical protein  37.1 
 
 
399 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.699164  normal  0.348353 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1413  hypothetical protein  25.21 
 
 
396 aa  71.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.923641  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0926  AAA ATPase  22.29 
 
 
382 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0900  AAA ATPase  22.29 
 
 
382 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3860  hypothetical protein  29.82 
 
 
345 aa  64.7  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.925149  normal  0.074002 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0937  ATPase-like protein  31.82 
 
 
356 aa  64.3  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  22.83 
 
 
529 aa  58.9  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  23.39 
 
 
584 aa  58.5  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1544  ATPase-like protein  29.36 
 
 
391 aa  52.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0152832  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2549  SMC domain protein  25.15 
 
 
315 aa  48.9  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0441079  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5113  hypothetical protein  22.45 
 
 
422 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1472  ATPase-like protein  33.73 
 
 
426 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0862565  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0005  DNA replication and repair protein RecF  32.17 
 
 
370 aa  48.1  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000369508  hitchhiker  0.000000145417 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  22.42 
 
 
369 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1457  putative ATPase  25.51 
 
 
347 aa  45.8  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0499  SMC domain-containing protein  24.3 
 
 
349 aa  45.1  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000698714 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4711  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  19.52 
 
 
648 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2156  recombination protein F  31.94 
 
 
369 aa  45.1  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000779125  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  24.07 
 
 
440 aa  44.3  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0003  DNA replication and repair protein RecF  35.09 
 
 
362 aa  43.1  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000115018  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2550  recombination protein F  25.93 
 
 
371 aa  43.1  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0191996  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3548  hypothetical protein  36.21 
 
 
368 aa  43.1  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.112036 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>