81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3860 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3860  hypothetical protein  100 
 
 		 345 aa  694    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.925149  normal  0.074002 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3672  hypothetical protein  26.8 
 
 		 378 aa  130  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1861  hypothetical protein  23.59 
 
 		 353 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3946  hypothetical protein  25.27 
 
 		 356 aa  109  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0748  hypothetical protein  25.23 
 
 		 377 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0777  ATPase-like protein  25.67 
 
 		 381 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4266  ATPase-like protein  25.21 
 
 		 361 aa  99  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1413  hypothetical protein  24.11 
 
 		 396 aa  91.3  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.923641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0703  hypothetical protein  22.81 
 
 		 399 aa  86.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0732  hypothetical protein  22.81 
 
 		 399 aa  86.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.699164  normal  0.348353 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2057  putative ATPase  20.31 
 
 		 341 aa  72  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0488  ATPase-like protein  31.82 
 
 		 350 aa  68.2  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0937  ATPase-like protein  27.73 
 
 		 356 aa  66.2  0.0000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1569  ATPase-like protein  29.82 
 
 		 354 aa  64.7  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.768338  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1544  ATPase-like protein  21.79 
 
 		 391 aa  63.9  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0152832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1141  ATPase-like protein  23.29 
 
 		 366 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.956923  normal  0.756779 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0926  AAA ATPase  28.28 
 
 		 382 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0900  AAA ATPase  28.28 
 
 		 382 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0499  SMC domain-containing protein  23.03 
 
 		 349 aa  54.3  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000698714 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47820  hypothetical protein  52.54 
 
 		 395 aa  51.2  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.088572  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1745  hypothetical protein  20.89 
 
 		 323 aa  50.8  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814918  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  50.98 
 
 		 390 aa  50.1  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2255  ATPase, RecF-like  47.46 
 
 		 393 aa  49.7  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1947  ATPase, RecF-like protein  49.15 
 
 		 388 aa  49.3  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.942384  normal  0.334746 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  50.98 
 
 		 390 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2035  hypothetical protein  45.76 
 
 		 388 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3134  hypothetical protein  50.98 
 
 		 390 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  49.02 
 
 		 390 aa  48.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0820  hypothetical protein  49.02 
 
 		 395 aa  47.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2281  ATPase  38.98 
 
 		 390 aa  47.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0843  hypothetical protein  49.02 
 
 		 393 aa  47.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0740  hypothetical protein  50.98 
 
 		 390 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3578  hypothetical protein  50.98 
 
 		 390 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.916758  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  52.17 
 
 		 388 aa  47.4  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3701  hypothetical protein  50.98 
 
 		 390 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  44.07 
 
 		 388 aa  47  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3510  hypothetical protein  50.98 
 
 		 390 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.807476 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2851  SMC domain protein  44.68 
 
 		 423 aa  47  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0808223 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54090  hypothetical protein  45.76 
 
 		 387 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4732  hypothetical protein  45.76 
 
 		 387 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  47.06 
 
 		 410 aa  46.2  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1691  SMC domain protein  43.86 
 
 		 385 aa  46.2  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  hitchhiker  0.000000699352 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0229  hypothetical protein  49.15 
 
 		 386 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745812  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2549  SMC domain protein  21.5 
 
 		 315 aa  45.8  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0441079  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0003  DNA replication and repair protein RecF  47.73 
 
 		 360 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0698954  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1457  putative ATPase  47.62 
 
 		 347 aa  45.8  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1362  DNA replication and repair protein RecF  47.62 
 
 		 339 aa  45.8  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3395  hypothetical protein  48.28 
 
 		 436 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1182  hypothetical protein  48.28 
 
 		 436 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1418  hypothetical protein  48.28 
 
 		 436 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.936146  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1132  hypothetical protein  47.83 
 
 		 358 aa  45.1  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0249333  normal  0.954197 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  42.37 
 
 		 390 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1909  hypothetical protein  48.28 
 
 		 436 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2994  ATP-dependent OLD family endonuclease  41.86 
 
 		 608 aa  45.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0003  recombination protein F  33.75 
 
 		 364 aa  44.3  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.26612  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2704  hypothetical protein  43.18 
 
 		 581 aa  44.3  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00140481  normal  0.0421451 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2313  hypothetical protein  48.28 
 
 		 392 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.969478  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1887  ATPase-like protein  44.83 
 
 		 391 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2434  hypothetical protein  48.28 
 
 		 392 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329765  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1016  SMC domain-containing protein  49.15 
 
 		 386 aa  44.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0527217  normal  0.402685 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0003  recombination protein F  33.75 
 
 		 364 aa  44.3  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0185053  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6192  ATPase-like  44.83 
 
 		 391 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1910  ATPase-like protein  44.83 
 
 		 391 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00358131 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2274  hypothetical protein  48.28 
 
 		 392 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.618217  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0866  ABC transporter ATP-binding protein  35.48 
 
 		 258 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.816936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2161  hypothetical protein  46.55 
 
 		 392 aa  44.3  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587323  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0898  ABC transporter ATP-binding protein  35.48 
 
 		 258 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0835  ABC transporter ATP-binding protein  35.48 
 
 		 258 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3757  hypothetical protein  44.74 
 
 		 532 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5187  ATPase-like  44.83 
 
 		 391 aa  43.9  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0921  ABC transporter ATP-binding protein  35.48 
 
 		 258 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.386488 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1824  ATPase-like protein  44.83 
 
 		 391 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.248078  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0470  SMC domain-containing protein  44.19 
 
 		 346 aa  43.9  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1750  ATPase  30.56 
 
 		 515 aa  43.5  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.52576  normal  0.584982 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0807  ABC transporter ATP-binding protein  35.48 
 
 		 259 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0606817  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1796  ATPase-like protein  44.83 
 
 		 391 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4032  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.67 
 
 		 338 aa  43.1  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.631221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5019  ATPase, RecF-like protein  40.35 
 
 		 388 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0003  recombination protein F  33.78 
 
 		 364 aa  43.1  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08280  predicted ATPase  39.22 
 
 		 392 aa  42.7  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0509 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0003  DNA replication and repair protein RecF  33.78 
 
 		 364 aa  42.7  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>