44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0488 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0488  ATPase-like protein  100 
 
 		 350 aa  702    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4266  ATPase-like protein  32.89 
 
 		 361 aa  192  8e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3672  hypothetical protein  29.66 
 
 		 378 aa  132  6.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1861  hypothetical protein  29.21 
 
 		 353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1569  ATPase-like protein  27.52 
 
 		 354 aa  116  7.999999999999999e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.768338  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3946  hypothetical protein  26.86 
 
 		 356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1413  hypothetical protein  27.99 
 
 		 396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.923641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0937  ATPase-like protein  26.12 
 
 		 356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0748  hypothetical protein  26.38 
 
 		 377 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0926  AAA ATPase  27.54 
 
 		 382 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0900  AAA ATPase  27.54 
 
 		 382 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0777  ATPase-like protein  25.95 
 
 		 381 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2057  putative ATPase  27.45 
 
 		 341 aa  99.4  8e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3860  hypothetical protein  25.62 
 
 		 345 aa  98.2  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.925149  normal  0.074002 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0703  hypothetical protein  34.32 
 
 		 399 aa  92.8  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0732  hypothetical protein  34.32 
 
 		 399 aa  92.8  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.699164  normal  0.348353 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1544  ATPase-like protein  27.2 
 
 		 391 aa  86.3  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0152832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1141  ATPase-like protein  33.33 
 
 		 366 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.956923  normal  0.756779 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0499  SMC domain-containing protein  20.89 
 
 		 349 aa  55.5  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000698714 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2549  SMC domain protein  25.95 
 
 		 315 aa  53.9  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0441079  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2073  ATPase-like protein  25.71 
 
 		 497 aa  53.9  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.672394  normal  0.790362 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1457  putative ATPase  23.87 
 
 		 347 aa  53.5  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0470  SMC domain-containing protein  22.74 
 
 		 346 aa  52.4  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  37.18 
 
 		 369 aa  49.7  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4760  SMC domain-containing protein  23.89 
 
 		 533 aa  47.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1132  hypothetical protein  55 
 
 		 358 aa  47  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0249333  normal  0.954197 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1095  hypothetical protein  36.62 
 
 		 453 aa  45.4  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00653553  hitchhiker  0.00178411 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1745  hypothetical protein  23.38 
 
 		 323 aa  45.1  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814918  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1950  hypothetical protein  38.03 
 
 		 460 aa  45.4  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00278389  hitchhiker  1.70461e-18 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0144  ATPase  22.96 
 
 		 565 aa  44.3  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0018  RecF protein  52.63 
 
 		 363 aa  44.3  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0744  ATP-dependent OLD family endonuclease  46.34 
 
 		 642 aa  43.1  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0093  conserved hypothetical protein  22.93 
 
 		 495 aa  43.1  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1107  AAA ATPase  20.55 
 
 		 571 aa  42.7  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0989005  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  42.86 
 
 		 375 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  42.86 
 
 		 375 aa  42.7  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  42.86 
 
 		 375 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  42.86 
 
 		 375 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000104808  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  42.86 
 
 		 375 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0003  DNA replication and repair protein  29.27 
 
 		 363 aa  42.7  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0241212  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  42.86 
 
 		 375 aa  42.7  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  42.86 
 
 		 375 aa  42.7  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0004  recombination protein F  42.86 
 
 		 375 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.340003 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5316  recombination protein F  42.86 
 
 		 375 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0155044  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>