32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4266 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4266  ATPase-like protein  100 
 
 
361 aa  731    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0748  hypothetical protein  31.82 
 
 
377 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3672  hypothetical protein  29.67 
 
 
378 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0777  ATPase-like protein  29.95 
 
 
381 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0703  hypothetical protein  28.64 
 
 
399 aa  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0937  ATPase-like protein  29.85 
 
 
356 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0732  hypothetical protein  28.64 
 
 
399 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.699164  normal  0.348353 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1861  hypothetical protein  27.6 
 
 
353 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1569  ATPase-like protein  28.57 
 
 
354 aa  116  6.9999999999999995e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.768338  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3946  hypothetical protein  27.64 
 
 
356 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1413  hypothetical protein  24.87 
 
 
396 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.923641  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0926  AAA ATPase  28.11 
 
 
382 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0900  AAA ATPase  28.11 
 
 
382 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3860  hypothetical protein  25.21 
 
 
345 aa  99  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.925149  normal  0.074002 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2057  putative ATPase  27.41 
 
 
341 aa  88.6  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1544  ATPase-like protein  37.93 
 
 
391 aa  70.5  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0152832  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1457  putative ATPase  26.26 
 
 
347 aa  68.9  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1141  ATPase-like protein  29.01 
 
 
366 aa  62.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.956923  normal  0.756779 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0499  SMC domain-containing protein  24.04 
 
 
349 aa  58.2  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000698714 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0488  ATPase-like protein  54.35 
 
 
350 aa  53.9  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0470  SMC domain-containing protein  21.47 
 
 
346 aa  50.1  0.00006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2750  DNA replication and repair protein RecF  50 
 
 
387 aa  47.8  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.433504  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03481  recombination protein F  30.53 
 
 
365 aa  47.4  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1362  DNA replication and repair protein RecF  44 
 
 
339 aa  46.2  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1691  SMC domain protein  32.97 
 
 
378 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  50 
 
 
758 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3600  ATPase-like protein  28.21 
 
 
416 aa  43.9  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00030  recF protein  23.7 
 
 
378 aa  43.9  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.172429  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2851  SMC domain protein  39.68 
 
 
423 aa  43.5  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0808223 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0003  DNA replication and repair protein RecF  38 
 
 
360 aa  43.9  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0698954  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2610  hypothetical protein  36.84 
 
 
744 aa  43.5  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  45.76 
 
 
574 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0910063 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>