More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5655 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6511  ABC transporter related  98.81 
 
 		 340 aa  657    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.192543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5655  ABC transporter related  100 
 
 		 337 aa  667    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305234  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6020  ABC transporter related  100 
 
 		 337 aa  667    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.628016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7429  ABC efflux pump, ATPase subunit  91.39 
 
 		 337 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0346135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6132  ABC transporter related  85.46 
 
 		 337 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  decreased coverage  0.00989011 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3152  ABC transporter, ATP-binding protein  54.11 
 
 		 318 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0700  ABC transporter, ATP-binding protein  54.11 
 
 		 318 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.430015  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0517  ABC transporter, ATP-binding protein  54.11 
 
 		 347 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0122  ABC transporter, ATP-binding protein  54.11 
 
 		 356 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1466  ABC transporter, ATP-binding protein  54.11 
 
 		 356 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0535  ABC transporter, ATP-binding protein  54.11 
 
 		 347 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2894  ABC transporter, ATP-binding protein  54.11 
 
 		 356 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3043  ABC transporter related  39.49 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0610173 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  36.89 
 
 		 300 aa  98.2  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  38.4 
 
 		 308 aa  97.8  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2039  ABC transporter-like protein protein  31.53 
 
 		 339 aa  98.2  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  36.93 
 
 		 313 aa  98.2  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  34.33 
 
 		 337 aa  97.4  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  38.89 
 
 		 309 aa  97.1  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  38.42 
 
 		 302 aa  97.1  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35 
 
 		 308 aa  96.3  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.252835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2148  ATPase  34.58 
 
 		 340 aa  96.3  7e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.96125  normal  0.315511 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  35.9 
 
 		 303 aa  95.9  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2342  ABC transporter related  41.34 
 
 		 319 aa  95.5  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.2832 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0652  ABC transporter related  32.95 
 
 		 307 aa  95.1  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.673494  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  39.46 
 
 		 302 aa  94.4  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1932  ABC transporter related  33.65 
 
 		 209 aa  94.7  2e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0191  ABC transporter-like  32.16 
 
 		 339 aa  93.6  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0494849 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  38.46 
 
 		 374 aa  93.6  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2080  ABC transporter related  37.97 
 
 		 388 aa  93.2  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1208  ABC transporter related  30.69 
 
 		 339 aa  93.2  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697219  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl646  putative multidrug ABC transporter ATP-binding component  28.11 
 
 		 234 aa  92.4  9e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1355  ABC transporter related protein  38.02 
 
 		 299 aa  92  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79712  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0191  ABC transporter related  32.43 
 
 		 305 aa  92.4  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.668087  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  34.5 
 
 		 741 aa  92  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0451  ABC transporter related  27.67 
 
 		 234 aa  91.3  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000589964  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4160  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.49 
 
 		 339 aa  91.7  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.144366 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.62 
 
 		 304 aa  91.7  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  33.94 
 
 		 274 aa  91.3  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05031  putative multidrug efflux ABC transporter  30.86 
 
 		 337 aa  90.9  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.123969 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  33.81 
 
 		 308 aa  90.9  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1780  multidrug ABC transporter  30.86 
 
 		 337 aa  90.9  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1751  ATPase  32.86 
 
 		 337 aa  90.9  3e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  31.07 
 
 		 283 aa  90.5  4e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1974  ABC transporter-like protein  37.66 
 
 		 308 aa  90.5  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495936 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  33.72 
 
 		 312 aa  90.1  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0612  ABC transporter related protein  36.87 
 
 		 314 aa  90.1  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.787595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  36.26 
 
 		 331 aa  90.1  5e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4919  ABC transporter related protein  36.31 
 
 		 302 aa  89.7  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0999062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  31.22 
 
 		 308 aa  89.7  7e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  29.67 
 
 		 300 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  34.62 
 
 		 290 aa  89.4  8e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5630  ABC transporter related protein  37.36 
 
 		 302 aa  89.4  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.694537  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0195  ABC transporter related  32.98 
 
 		 263 aa  89  9e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0925  ABC transporter related  34.08 
 
 		 256 aa  89.4  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560586  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  30.08 
 
 		 300 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1138  ABC transporter related  36.92 
 
 		 311 aa  88.6  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.129025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  35.68 
 
 		 301 aa  88.6  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  32.99 
 
 		 303 aa  88.6  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2545  ABC transporter related  33.49 
 
 		 315 aa  89  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1843  ABC transporter related  35.2 
 
 		 322 aa  89  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000163971 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  29.63 
 
 		 305 aa  88.6  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4016  ABC transporter related  33.64 
 
 		 265 aa  88.6  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.304399  normal  0.276484 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0810  ABC transporter related  28.52 
 
 		 932 aa  88.6  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  35.05 
 
 		 322 aa  87.4  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  31.52 
 
 		 299 aa  87.4  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0427  ABC transporter related  34.4 
 
 		 285 aa  87.4  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.713042  normal  0.299152 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  28.68 
 
 		 300 aa  87.8  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0326  ABC transporter related  31.71 
 
 		 359 aa  87.4  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  decreased coverage  0.00902644 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7343  ABC transporter related  38.64 
 
 		 284 aa  87  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991324 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  36.11 
 
 		 282 aa  87  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4747  ABC transporter related protein  39.56 
 
 		 237 aa  87  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.667529 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  33.15 
 
 		 310 aa  87  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1638  ABC transporter related protein  36.36 
 
 		 299 aa  86.7  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.374187  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  30.04 
 
 		 300 aa  86.3  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5504  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.32 
 
 		 270 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  29.17 
 
 		 301 aa  85.9  8e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5510  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  31.42 
 
 		 270 aa  85.9  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5559  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  31.42 
 
 		 270 aa  85.9  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5230  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  32.5 
 
 		 270 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3547  ABC transporter-like protein  36.32 
 
 		 290 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.757976 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5061  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.5 
 
 		 270 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5078  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.5 
 
 		 270 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5473  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.5 
 
 		 270 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0418  ABC transporter related  34.3 
 
 		 307 aa  85.5  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.987895 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5629  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  32.5 
 
 		 270 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0144  ABC transporter related protein  36.32 
 
 		 300 aa  85.5  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2580  ABC transporter-like protein  32.7 
 
 		 256 aa  85.1  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.195194 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0057  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.5 
 
 		 362 aa  85.5  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04731  putative multidrug efflux ABC transporter  27.27 
 
 		 338 aa  85.1  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3334  hypothetical protein  34.8 
 
 		 267 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.435313  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  27.54 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  34.58 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  34.81 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1776  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.63 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.179608 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2680  ABC transporter related protein  39.18 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4044  ABC transporter related  34.93 
 
 		 281 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0445  ATPase  32.02 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.577639  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  30.99 
 
 		 316 aa  84  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5478  ABC transporter, ATP-binding protein  27.97 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>