18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4992 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4992  hypothetical protein  100 
 
 		 380 aa  764    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00030  recF protein  41.51 
 
 		 376 aa  54.7  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000612951  decreased coverage  0.0000132668 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0093  conserved hypothetical protein  34.38 
 
 		 495 aa  53.5  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  46.81 
 
 		 708 aa  50.4  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2073  ATPase-like protein  37.25 
 
 		 497 aa  46.2  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.672394  normal  0.790362 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0015  DNA replication and repair protein RecF  36.23 
 
 		 340 aa  46.2  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.486493  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  37.66 
 
 		 1170 aa  44.3  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2659  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.4 
 
 		 548 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0191795  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  45.83 
 
 		 564 aa  44.3  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  37.66 
 
 		 1170 aa  44.3  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1984  hypothetical protein  32.39 
 
 		 566 aa  44.3  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.370866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1141  ATPase-like protein  34.38 
 
 		 366 aa  44.3  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.956923  normal  0.756779 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1098  hypothetical protein  45.45 
 
 		 410 aa  43.9  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  33.78 
 
 		 584 aa  43.5  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1362  DNA replication and repair protein RecF  29.59 
 
 		 339 aa  43.5  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1751  hypothetical protein  29.5 
 
 		 513 aa  43.1  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1507  SMC domain protein  33.01 
 
 		 1115 aa  42.7  0.01  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.44218  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  40 
 
 		 1164 aa  42.7  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>