37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2392 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2392  hypothetical protein  100 
 
 
486 aa  1002    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0546417  hitchhiker  0.00518189 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2778  hypothetical protein  26.98 
 
 
490 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000124034  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1750  ATPase  24.5 
 
 
515 aa  85.9  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.52576  normal  0.584982 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1454  ATPase  37.24 
 
 
597 aa  78.6  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2294  hypothetical protein  35.97 
 
 
549 aa  78.6  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.646796  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5059  AAA ATPase  28.06 
 
 
518 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.32918 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0211  ATPase  23.79 
 
 
586 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0158049  hitchhiker  0.00000676149 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0155  AAA ATPase  25.85 
 
 
544 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.754147  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0049  prophage Lp2 protein 4  20.71 
 
 
558 aa  60.1  0.00000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.19169  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2912  SMC protein-like  23.1 
 
 
418 aa  60.1  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.492401  normal  0.0605125 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3546  AAA ATPase  22.49 
 
 
573 aa  59.7  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0847793  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0843  ATPase  25.88 
 
 
602 aa  55.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000396112  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  27.78 
 
 
666 aa  51.6  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3178  putative ATP binding protein  31.16 
 
 
496 aa  50.4  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.033124  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.9 
 
 
652 aa  49.3  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3955  AAA ATPase  30.93 
 
 
642 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262295  hitchhiker  0.00100841 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0146  ATPase-like  25.41 
 
 
226 aa  47.8  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2704  hypothetical protein  23.95 
 
 
581 aa  48.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00140481  normal  0.0421451 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0145  hypothetical protein  24.83 
 
 
518 aa  47.8  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2979  hypothetical protein  33.8 
 
 
464 aa  47.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.0308944 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49480  hypothetical protein  28.57 
 
 
595 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000071972  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3691  ea59 protein  28.57 
 
 
513 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25413  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0136  hypothetical protein  33.72 
 
 
224 aa  47  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224631  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3739  hypothetical protein  34.67 
 
 
428 aa  46.6  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2545  ATPase-like  29.11 
 
 
419 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000977998  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2345  ea59 protein  29.13 
 
 
516 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1387  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.2 
 
 
550 aa  45.1  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.398618  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4526  hypothetical protein  32.18 
 
 
452 aa  44.7  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3524  hypothetical protein  31.43 
 
 
228 aa  44.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0470  SMC domain-containing protein  29.63 
 
 
346 aa  44.7  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2994  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.84 
 
 
608 aa  44.7  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2371  hypothetical protein  34.57 
 
 
369 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0524  hypothetical protein  34.55 
 
 
251 aa  44.7  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1873  hypothetical protein  30.67 
 
 
408 aa  44.3  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2955  hypothetical protein  35.14 
 
 
378 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  34.29 
 
 
623 aa  43.9  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2733  hypothetical protein  32.58 
 
 
465 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0286809  normal  0.420711 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>