15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1317 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1317  hypothetical protein  100 
 
 
388 aa  794    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.361107  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0026  hypothetical protein  40.55 
 
 
398 aa  287  2e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0291  hypothetical protein  38.68 
 
 
390 aa  259  4e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2593  hypothetical protein  42.9 
 
 
389 aa  257  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.14743  normal  0.0818693 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1005  hypothetical protein  22.84 
 
 
429 aa  60.8  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.729513  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  40 
 
 
595 aa  47.4  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  39.13 
 
 
626 aa  46.6  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  39.13 
 
 
626 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1770  hypothetical protein  30.53 
 
 
459 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1798  hypothetical protein  30.53 
 
 
478 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1140  putative ATP-binding protein  22.55 
 
 
349 aa  44.3  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49556  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4526  hypothetical protein  51.02 
 
 
452 aa  43.9  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  23.05 
 
 
529 aa  44.3  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.19 
 
 
594 aa  43.9  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.98 
 
 
603 aa  42.7  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>