More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1779 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2236  DNA repair protein RecN  58.71 
 
 		 582 aa  647    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.48735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1779  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 581 aa  1160    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.666721 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3647  DNA repair protein RecN  57.32 
 
 		 575 aa  625  1e-178  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1995  DNA repair protein RecN  52.59 
 
 		 586 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2022  DNA repair protein RecN  52.59 
 
 		 586 aa  581  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.499212  normal  0.676493 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3118  DNA repair protein RecN  54.39 
 
 		 586 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1274  DNA repair protein RecN  55.63 
 
 		 595 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0644  DNA repair protein RecN  53.68 
 
 		 592 aa  573  1.0000000000000001e-162  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.659362  normal  0.0659728 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2692  DNA repair protein RecN  45.13 
 
 		 560 aa  400  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2318  DNA repair protein RecN  43.85 
 
 		 561 aa  371  1e-101  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30201  DNA repair protein RecN, ABC transporter  43.21 
 
 		 562 aa  365  1e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.15425 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  37.72 
 
 		 554 aa  324  3e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  39.09 
 
 		 574 aa  319  7.999999999999999e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  34.84 
 
 		 577 aa  318  2e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1324  ATPase  35.37 
 
 		 561 aa  315  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1507  DNA repair protein RecN  39.65 
 
 		 558 aa  315  9.999999999999999e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18511  DNA repair protein recN, ABC transporter  37.61 
 
 		 568 aa  315  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0157571  normal  0.0737248 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21971  DNA repair protein RecN, ABC transporter  34.68 
 
 		 561 aa  310  5e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  35.61 
 
 		 572 aa  310  5.9999999999999995e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  33.74 
 
 		 579 aa  306  6e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  34.4 
 
 		 565 aa  306  6e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  33.57 
 
 		 579 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  35.2 
 
 		 555 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  33.57 
 
 		 579 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  36.16 
 
 		 558 aa  304  4.0000000000000003e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  33.39 
 
 		 583 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  33.39 
 
 		 579 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  33.22 
 
 		 579 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  33.39 
 
 		 579 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  33.39 
 
 		 583 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  33.22 
 
 		 579 aa  303  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  33.51 
 
 		 579 aa  302  1e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  33.03 
 
 		 566 aa  300  3e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  38.23 
 
 		 554 aa  300  6e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0769  DNA repair protein RecN  38.41 
 
 		 606 aa  299  7e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0769  DNA repair protein RecN  38.38 
 
 		 606 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0732  DNA repair protein RecN  38.23 
 
 		 606 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.813778  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  34.67 
 
 		 567 aa  295  1e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  34.8 
 
 		 557 aa  294  3e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  32.71 
 
 		 579 aa  293  4e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  35.4 
 
 		 565 aa  293  5e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1031  DNA repair protein RecN  36.94 
 
 		 572 aa  293  5e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  33.7 
 
 		 580 aa  292  1e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  35.68 
 
 		 567 aa  291  2e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  33.39 
 
 		 555 aa  291  2e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0756  DNA repair ATPase  33.27 
 
 		 562 aa  291  2e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000414406  hitchhiker  0.0000280252 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  34.88 
 
 		 555 aa  291  2e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1707  DNA repair protein RecN  35.65 
 
 		 553 aa  290  4e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0776  DNA repair protein RecN  37.65 
 
 		 611 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163902  normal  0.739738 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2499  DNA repair protein RecN  31.81 
 
 		 561 aa  287  5e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  36.05 
 
 		 601 aa  286  9e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  33.92 
 
 		 573 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  33.33 
 
 		 559 aa  285  2.0000000000000002e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  32.38 
 
 		 573 aa  282  1e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2472  DNA repair protein RecN  34.25 
 
 		 605 aa  281  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3831  DNA repair protein RecN  35.42 
 
 		 549 aa  277  4e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  31.05 
 
 		 570 aa  277  4e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  32.01 
 
 		 558 aa  276  7e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2651  DNA repair protein  35.84 
 
 		 569 aa  276  8e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2171  DNA repair protein RecN  35.68 
 
 		 575 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00879264  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2032  DNA repair protein RecN  35.27 
 
 		 567 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  32.68 
 
 		 556 aa  276  1.0000000000000001e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0934  DNA repair protein RecN  31.7 
 
 		 588 aa  273  5.000000000000001e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.590863  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1769  DNA repair protein RecN  35.93 
 
 		 557 aa  273  5.000000000000001e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  33.86 
 
 		 556 aa  273  8.000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1394  DNA repair protein RecN  38.76 
 
 		 551 aa  273  9e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  32.72 
 
 		 552 aa  272  1e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3320  DNA repair protein RecN  33.94 
 
 		 587 aa  272  1e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0713  DNA repair protein RecN  35.06 
 
 		 549 aa  272  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.685992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2888  DNA repair protein RecN  34.99 
 
 		 568 aa  272  1e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2421  DNA repair protein RecN  35.3 
 
 		 563 aa  271  2e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.955613  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0661  DNA repair protein RecN  34.81 
 
 		 549 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0259  DNA repair protein RecN  35.06 
 
 		 549 aa  272  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255628  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0743  DNA repair protein RecN  35.06 
 
 		 549 aa  272  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259434  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2641  DNA repair protein RecN  34.87 
 
 		 549 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6056  DNA repair and genetic recombination  34.85 
 
 		 570 aa  271  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2326  DNA repair protein RecN  35.02 
 
 		 560 aa  270  4e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000910227  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  33.78 
 
 		 578 aa  271  4e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1517  DNA repair protein RecN  34.2 
 
 		 579 aa  270  4e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000776355 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0637  DNA repair protein RecN  34.81 
 
 		 549 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  34.51 
 
 		 559 aa  270  5e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0426  DNA repair protein RecN  31.34 
 
 		 553 aa  269  8e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0456  DNA repair protein RecN  36.53 
 
 		 553 aa  269  8e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2482  DNA repair protein RecN  34.63 
 
 		 568 aa  269  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  36.98 
 
 		 559 aa  268  2e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0119  DNA repair protein RecN  35.08 
 
 		 599 aa  268  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1055  DNA repair protein RecN  31.93 
 
 		 588 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  32.12 
 
 		 572 aa  267  4e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_923  DNA repair protein  31.93 
 
 		 588 aa  266  8e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0553147  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3096  recombination and repair protein  34.96 
 
 		 553 aa  265  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.316238  normal  0.467754 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  30.97 
 
 		 562 aa  265  2e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2333  DNA repair protein RecN  35.05 
 
 		 549 aa  265  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2214  DNA repair protein RecN  35.05 
 
 		 549 aa  265  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.725261  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3319  DNA repair protein RecN  35.05 
 
 		 549 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0492  DNA repair protein RecN  35.05 
 
 		 549 aa  265  2e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3286  DNA repair protein RecN  35.05 
 
 		 549 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0539815  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1107  DNA repair protein RecN  35.05 
 
 		 549 aa  265  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0249547  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3329  DNA repair protein RecN  35.05 
 
 		 549 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  31.53 
 
 		 559 aa  264  3e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  31.53 
 
 		 559 aa  264  3e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>