16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4743 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4743  hypothetical protein  100 
 
 		 478 aa  987    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311034 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2495  hypothetical protein  49.48 
 
 		 630 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3598  AAA ATPase  26.28 
 
 		 530 aa  64.3  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234034  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0855  SMC domain-containing protein  24.53 
 
 		 556 aa  60.5  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0223965  normal  0.062418 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2959  hypothetical protein  19.37 
 
 		 533 aa  57.4  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3524  hypothetical protein  26.96 
 
 		 228 aa  47.4  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4238  ABC transporter  23.16 
 
 		 588 aa  47  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1387  ATP-dependent OLD family endonuclease  35.14 
 
 		 550 aa  46.2  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.398618  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0733  hypothetical protein  25.2 
 
 		 461 aa  45.8  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987867  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.55 
 
 		 652 aa  45.1  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0524  hypothetical protein  24 
 
 		 251 aa  44.7  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2727  ABC transporter  26.09 
 
 		 601 aa  44.7  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5034  hypothetical protein  41.94 
 
 		 572 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0629  AAA ATPase  39.24 
 
 		 446 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7321  AAA ATPase  22.45 
 
 		 455 aa  43.9  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0541267 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3230  hypothetical protein  40 
 
 		 451 aa  43.5  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>