42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0181 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0181  ATPase  100 
 
 		 457 aa  919    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.269249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0945  ATPase  65.36 
 
 		 448 aa  555  1e-157  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0629  AAA ATPase  53.13 
 
 		 446 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0859  putative excinuclease ATPase subunit  51.84 
 
 		 450 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1645  ATPase  45.47 
 
 		 451 aa  371  1e-101  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0103  ATPase  36.09 
 
 		 423 aa  264  3e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0853  ATPase  35.08 
 
 		 445 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3206  ATPase  36.09 
 
 		 443 aa  227  3e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2919  putative ATPase  28.79 
 
 		 427 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.741445  hitchhiker  0.00681239 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1634  ATPase  51.25 
 
 		 94 aa  88.6  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7321  AAA ATPase  35.44 
 
 		 455 aa  62  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0541267 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4526  hypothetical protein  46.58 
 
 		 452 aa  60.8  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3922  hypothetical protein  27.13 
 
 		 440 aa  58.2  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.658608 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2487  hypothetical protein  29.09 
 
 		 336 aa  56.2  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0753624  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2482  putative ABC transporter, ATP-binding domain  36.59 
 
 		 976 aa  56.2  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0733  hypothetical protein  32.73 
 
 		 461 aa  55.1  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987867  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0111  hypothetical protein  31.75 
 
 		 368 aa  53.9  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1004  hypothetical protein  40.91 
 
 		 567 aa  53.5  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0319616 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1601  ABC transporter related  38.75 
 
 		 238 aa  51.2  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122919  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  38.57 
 
 		 532 aa  50.8  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2504  hypothetical protein  36.23 
 
 		 176 aa  50.4  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  35.21 
 
 		 457 aa  50.1  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3405  ATP-binding protein  29.93 
 
 		 454 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00177365  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1513  hypothetical protein  37.18 
 
 		 444 aa  50.1  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0524  hypothetical protein  34.29 
 
 		 251 aa  50.1  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49480  hypothetical protein  33.7 
 
 		 595 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000071972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1859  hypothetical protein  30.66 
 
 		 464 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0211  ATPase  38.75 
 
 		 586 aa  48.5  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0158049  hitchhiker  0.00000676149 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3577  hypothetical protein  36.49 
 
 		 458 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.292222 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3524  hypothetical protein  33.8 
 
 		 228 aa  47.4  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1454  ATPase  29.7 
 
 		 597 aa  47  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2959  hypothetical protein  34.15 
 
 		 533 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1735  AAA ATPase  34.72 
 
 		 484 aa  45.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331613 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3008  hypothetical protein  38.27 
 
 		 582 aa  45.8  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568683  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4387  hypothetical protein  27.46 
 
 		 256 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0842496  normal  0.0719628 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2422  hypothetical protein  40 
 
 		 442 aa  44.7  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2514  ABC transporter related protein  25.64 
 
 		 518 aa  45.1  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3230  hypothetical protein  30.39 
 
 		 451 aa  43.9  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2516  chromosome segregation protein SMC  24.21 
 
 		 1138 aa  43.5  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0576231  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2483  hypothetical protein  26.15 
 
 		 496 aa  43.5  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0802177  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4238  ABC transporter  35.62 
 
 		 588 aa  43.1  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2345  ea59 protein  32.91 
 
 		 516 aa  43.1  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>