More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0610 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0610  excinuclease ABC subunit A  100 
 
 		 1787 aa  3647    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4240  UvrA family protein  28.43 
 
 		 1957 aa  664    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.591545  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0143  excinuclease ABC, A subunit  28.64 
 
 		 1942 aa  755    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4574  excinuclease ABC, A subunit  28.09 
 
 		 1949 aa  677    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.479669 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4441  excinuclease ABC, A subunit  28.09 
 
 		 1949 aa  677    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.407349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2580  UvrA family protein  29.42 
 
 		 1892 aa  689    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.603689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1549  excinuclease ABC, A subunit  27.72 
 
 		 1997 aa  667    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3001  UvrA family protein  28.08 
 
 		 1971 aa  641    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2246  excinuclease ABC, A subunit  29.15 
 
 		 1896 aa  664    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186636  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4549  excinuclease ABC subunit A  28.46 
 
 		 1959 aa  672    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.179328 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0731  excinuclease ABC, A subunit  29.8 
 
 		 1895 aa  677    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4341  excinuclease ABC, A subunit  29.08 
 
 		 1969 aa  684    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.580395 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3028  excinuclease ABC, A subunit  28.55 
 
 		 1976 aa  712    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.500259  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3747  UvrA family protein  28.8 
 
 		 1941 aa  719    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5541  excinuclease ABC, A subunit  27.19 
 
 		 1974 aa  625  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0115667 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0075  excinuclease ABC, subunit A, form 2  27.41 
 
 		 2021 aa  626  1e-177  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1568  excinuclease ABC, subunit A, form 2  27.32 
 
 		 1971 aa  620  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.49006  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6472  excinuclease ABC, A subunit  27.12 
 
 		 1964 aa  622  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.225819 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5608  excinuclease ABC, A subunit  26.87 
 
 		 1964 aa  623  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5972  excinuclease ABC, A subunit  26.87 
 
 		 1964 aa  623  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0125228 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0074  excinuclease ABC, A subunit  27.3 
 
 		 1970 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.862604  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1501  excinuclease ABC, subunit A, form 2  27.3 
 
 		 1970 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.776377  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0062  excinuclease ABC, subunit A, form 2  27.3 
 
 		 1970 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1218  excinuclease ABC, subunit A, form 2  27.3 
 
 		 1970 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.13215  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0073  excinuclease ABC, A subunit  27.2 
 
 		 1997 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2882  excinuclease ABC, A subunit  37.89 
 
 		 964 aa  608  9.999999999999999e-173  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0337  excinuclease ABC subunit A  36.66 
 
 		 939 aa  606  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0329  excinuclease ABC subunit A  36.76 
 
 		 939 aa  605  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1437  excinuclease ABC, A subunit  38.15 
 
 		 942 aa  600  1e-169  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0158  excinuclease ABC subunit A  37.06 
 
 		 947 aa  597  1e-169  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.509879 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5040  excinuclease ABC, A subunit  36.96 
 
 		 971 aa  592  1e-167  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0294  excinuclease ABC, A subunit  37.37 
 
 		 946 aa  591  1e-167  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1999  excinuclease ABC subunit A  37.08 
 
 		 946 aa  591  1e-167  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0576024  normal  0.88061 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1820  excinuclease ABC subunit A  36.98 
 
 		 954 aa  590  1e-167  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.315317  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0375  excinuclease ABC, A subunit  36.98 
 
 		 954 aa  590  1e-167  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00180738  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16220  excinuclease ABC, A subunit  37.66 
 
 		 941 aa  593  1e-167  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.266346  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3281  excinuclease ABC, A subunit  37.97 
 
 		 950 aa  590  1e-166  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0260  excinuclease ABC, A subunit  36.48 
 
 		 947 aa  588  1e-166  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0669187  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10450  Excinuclease ABC subunit A  36.57 
 
 		 960 aa  588  1e-166  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0436929  hitchhiker  0.0000000651145 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2710  excinuclease ABC subunit A  38.07 
 
 		 1008 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00698098 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0081  excinuclease ABC, A subunit  37.29 
 
 		 981 aa  586  1.0000000000000001e-165  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0885  excinuclease ABC, A subunit  36.55 
 
 		 947 aa  585  1.0000000000000001e-165  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0704  excinuclease ABC, A subunit  37.13 
 
 		 939 aa  581  1e-164  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1053  excinuclease ABC, A subunit  36.78 
 
 		 927 aa  582  1e-164  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00826345  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3065  excinuclease ABC, A subunit  36.31 
 
 		 956 aa  581  1e-164  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000246359  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0304  excinuclease ABC, A subunit  28.68 
 
 		 2005 aa  582  1e-164  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0976  excinuclease ABC subunit A  38.02 
 
 		 931 aa  579  1.0000000000000001e-163  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.177637  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3325  excinuclease ABC, A subunit  36.41 
 
 		 937 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0206  excinuclease ABC, A subunit  36.18 
 
 		 947 aa  578  1.0000000000000001e-163  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000261219  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1158  excinuclease ABC subunit A  36.74 
 
 		 941 aa  579  1.0000000000000001e-163  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0942  hypothetical protein  38.78 
 
 		 950 aa  577  1.0000000000000001e-163  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.971464 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0252  excinuclease ABC (subunit A)  36.64 
 
 		 942 aa  577  1.0000000000000001e-163  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00117135  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1893  excinuclease ABC, A subunit  37.51 
 
 		 945 aa  574  1.0000000000000001e-162  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0808708  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0189  excinuclease ABC, A subunit  36.18 
 
 		 947 aa  576  1.0000000000000001e-162  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0119000000000001e-25 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0087  excinuclease ABC, A subunit  35.92 
 
 		 937 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000141309  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4139  UvrA family protein  28.6 
 
 		 2024 aa  576  1.0000000000000001e-162  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.79148 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2991  excinuclease ABC subunit A  36.12 
 
 		 954 aa  575  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.9416  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3709  excinuclease ABC subunit A  36.01 
 
 		 956 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2038  excinuclease ABC, A subunit  36.64 
 
 		 963 aa  572  1e-161  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225095  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5952  excinuclease ABC, A subunit  28.86 
 
 		 1984 aa  572  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0128  excinuclease ABC subunit A  36.09 
 
 		 937 aa  570  1e-161  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1160  excinuclease ABC, A subunit  38.04 
 
 		 953 aa  571  1e-161  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.216625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0926  excinuclease ABC subunit A  35.96 
 
 		 967 aa  571  1e-161  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4702  excinuclease ABC, A subunit  28.83 
 
 		 1981 aa  567  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1422  excinuclease ABC, A subunit  36.17 
 
 		 963 aa  567  1e-160  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0151035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3956  excinuclease ABC, A subunit  36.35 
 
 		 963 aa  567  1e-160  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000293672  hitchhiker  0.00020375 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1752  excinuclease ABC subunit A  36.72 
 
 		 950 aa  568  1e-160  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72619  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0255  excinuclease ABC subunit A  36.93 
 
 		 971 aa  570  1e-160  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3174  excinuclease ABC subunit A  35.91 
 
 		 955 aa  567  1e-160  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2585  excinuclease ABC subunit A  36.06 
 
 		 979 aa  568  1e-160  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.771268  normal  0.888283 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1084  excinuclease ABC, A subunit  36.45 
 
 		 936 aa  567  1e-160  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.293507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0440  excinuclease ABC subunit A  37.7 
 
 		 916 aa  570  1e-160  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.674144  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1109  excinuclease ABC subunit A  36.72 
 
 		 947 aa  568  1e-160  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.57709  normal  0.229428 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6045  excinuclease ABC subunit A  36.95 
 
 		 946 aa  570  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.834052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0746  excinuclease ABC, A subunit  35.71 
 
 		 940 aa  568  1e-160  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0455  excinuclease ABC subunit A  37.88 
 
 		 916 aa  567  1.0000000000000001e-159  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0811639  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0037  excinuclease ABC subunit A  35.98 
 
 		 920 aa  564  1.0000000000000001e-159  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2694  excinuclease ABC, A subunit  37.38 
 
 		 942 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5271  excinuclease ABC subunit A  34.75 
 
 		 958 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0411  excinuclease ABC, A subunit  36.16 
 
 		 957 aa  566  1.0000000000000001e-159  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5015  excinuclease ABC subunit A  34.75 
 
 		 958 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.93666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4844  excinuclease ABC subunit A  34.75 
 
 		 958 aa  566  1.0000000000000001e-159  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4859  excinuclease ABC subunit A  34.75 
 
 		 958 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5328  excinuclease ABC subunit A  34.75 
 
 		 958 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2024  excinuclease ABC subunit A  35.53 
 
 		 945 aa  566  1.0000000000000001e-159  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136428  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2823  excinuclease ABC, A subunit  35.89 
 
 		 980 aa  563  1.0000000000000001e-159  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.179729  normal  0.122251 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1824  excinuclease ABC, A subunit  37.1 
 
 		 945 aa  566  1.0000000000000001e-159  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00152877  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5395  excinuclease ABC subunit A  34.75 
 
 		 958 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5251  excinuclease ABC subunit A  34.75 
 
 		 958 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0785  excinuclease ABC, A subunit  35.33 
 
 		 961 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3893  excinuclease ABC subunit A  36.11 
 
 		 957 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0968231 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2119  excinuclease ABC, A subunit  36.52 
 
 		 942 aa  565  1.0000000000000001e-159  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000168396  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2036  Excinuclease ABC subunit A  36.06 
 
 		 944 aa  562  1e-158  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0663505  hitchhiker  0.000130956 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1187  excinuclease ABC, A subunit  34.71 
 
 		 965 aa  562  1e-158  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5285  excinuclease ABC subunit A  34.65 
 
 		 958 aa  563  1e-158  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0554  excinuclease ABC, A subunit  35.59 
 
 		 938 aa  562  1e-158  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1127  excinuclease ABC subunit A  34.76 
 
 		 966 aa  562  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1192  excinuclease ABC subunit A  35.32 
 
 		 970 aa  561  1e-158  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.548367  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0120  excinuclease ABC subunit A  35.82 
 
 		 948 aa  561  1e-158  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.973474  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1339  excinuclease ABC, A subunit  37.89 
 
 		 918 aa  562  1e-158  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>