More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1160 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03930  excinuclease ABC subunit A  55.87 
 
 		 940 aa  1032    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.166439  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3934  excinuclease ABC, A subunit  55.87 
 
 		 940 aa  1032    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0546  excinuclease ABC, A subunit  56.61 
 
 		 946 aa  1061    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0457921  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3325  excinuclease ABC, A subunit  59.1 
 
 		 937 aa  1129    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0483  excinuclease ABC subunit A  55.4 
 
 		 944 aa  1060    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000649364 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1010  excinuclease ABC subunit A  56.79 
 
 		 954 aa  1052    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0427  excinuclease ABC subunit A  57.86 
 
 		 944 aa  1105    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2694  excinuclease ABC, A subunit  54.89 
 
 		 942 aa  1022    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0916  excinuclease ABC, A subunit  52.37 
 
 		 931 aa  996    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0420  excinuclease ABC subunit A  54.09 
 
 		 954 aa  1000    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.790766  normal  0.236129 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5271  excinuclease ABC subunit A  57.14 
 
 		 958 aa  1118    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0920  excinuclease ABC, A subunit  55.6 
 
 		 943 aa  1019    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1709  excinuclease ABC subunit A  56.72 
 
 		 942 aa  1055    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0152505  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1104  excinuclease ABC subunit A  55.64 
 
 		 974 aa  1046    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.807702  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4030  excinuclease ABC, A subunit  55.72 
 
 		 950 aa  1018    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0654  excinuclease ABC, A subunit  55.61 
 
 		 992 aa  1060    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5015  excinuclease ABC subunit A  57.65 
 
 		 958 aa  1120    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.93666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4844  excinuclease ABC subunit A  57.75 
 
 		 958 aa  1121    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4859  excinuclease ABC subunit A  57.54 
 
 		 958 aa  1118    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3095  excinuclease ABC, A subunit  54.45 
 
 		 955 aa  1002    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0451  excinuclease ABC subunit A  55.5 
 
 		 951 aa  1056    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0427  excinuclease ABC subunit A  55.92 
 
 		 951 aa  1061    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4520  excinuclease ABC subunit A  55.93 
 
 		 961 aa  1061    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.308582 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1685  excinuclease ABC subunit A  55.49 
 
 		 968 aa  1026    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0473  excinuclease ABC subunit A  55.7 
 
 		 941 aa  1042    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.78914 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2024  excinuclease ABC subunit A  56.9 
 
 		 945 aa  1093    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136428  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1323  excinuclease ABC subunit A  54.71 
 
 		 980 aa  1026    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0367  excinuclease ABC subunit A  53.82 
 
 		 954 aa  1010    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2710  excinuclease ABC subunit A  73.97 
 
 		 1008 aa  1457    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00698098 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0436  excinuclease ABC subunit A  55.24 
 
 		 940 aa  1023    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.64292  normal  0.354082 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1568  excinuclease ABC subunit A  54.9 
 
 		 993 aa  1031    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.524179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3591  excinuclease ABC subunit A  55.48 
 
 		 965 aa  1014    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.240208  normal  0.0431372 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0779  excinuclease ABC, A subunit  54.45 
 
 		 955 aa  1002    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.159716  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5051  excinuclease ABC subunit A  55.66 
 
 		 944 aa  1055    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0371407 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2966  excinuclease ABC subunit A  54.7 
 
 		 952 aa  1000    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.741995  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0087  excinuclease ABC, A subunit  58.35 
 
 		 937 aa  1108    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000141309  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6109  excinuclease ABC subunit A  53.97 
 
 		 961 aa  1002    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.547092 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2691  excinuclease ABC subunit A  53.54 
 
 		 987 aa  1016    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0128  excinuclease ABC subunit A  58.57 
 
 		 937 aa  1116    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0324  excinuclease ABC, A subunit  55.64 
 
 		 935 aa  1026    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.71267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5395  excinuclease ABC subunit A  57.65 
 
 		 958 aa  1120    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1804  excinuclease ABC subunit A  55.09 
 
 		 967 aa  1031    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0848  excinuclease ABC subunit A  53.31 
 
 		 1003 aa  1006    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.23949 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2229  excinuclease ABC, A subunit  54.42 
 
 		 944 aa  997    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.748559  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1752  excinuclease ABC subunit A  55.52 
 
 		 950 aa  1054    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72619  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0255  excinuclease ABC subunit A  58.57 
 
 		 971 aa  1097    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0498  excinuclease ABC, A subunit  54.24 
 
 		 981 aa  1000    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0382753  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1127  excinuclease ABC subunit A  52.42 
 
 		 966 aa  1001    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1631  excinuclease ABC subunit A  54.14 
 
 		 976 aa  1021    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.978501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2715  excinuclease ABC subunit A  54.8 
 
 		 1011 aa  1028    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.199737 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1192  excinuclease ABC subunit A  54.91 
 
 		 970 aa  1074    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.548367  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1160  excinuclease ABC, A subunit  100 
 
 		 953 aa  1960    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.216625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1723  excinuclease ABC subunit A  56.12 
 
 		 957 aa  1026    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.30006 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0993  excinuclease ABC subunit A  54.4 
 
 		 946 aa  1031    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.883407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2757  excinuclease ABC subunit A  54.67 
 
 		 1001 aa  996    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.30708  normal  0.666672 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2426  excinuclease ABC subunit A  54.14 
 
 		 939 aa  994    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4108  excinuclease ABC subunit A  53.53 
 
 		 957 aa  1004    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1158  excinuclease ABC subunit A  59.85 
 
 		 941 aa  1122    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2758  excinuclease ABC subunit A  55.17 
 
 		 1008 aa  1025    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0448  excinuclease ABC subunit A  55.39 
 
 		 957 aa  1022    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.775809  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2081  excinuclease ABC subunit A  53.93 
 
 		 1013 aa  1023    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0851595  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1960  excinuclease ABC, A subunit  55.38 
 
 		 968 aa  1026    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0313  excinuclease ABC subunit A  53.24 
 
 		 955 aa  994    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0776  excinuclease ABC subunit A  54.89 
 
 		 981 aa  1027    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.839433  normal  0.0723742 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0694  excinuclease ABC subunit A  53.96 
 
 		 1004 aa  1037    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.641362 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1098  excinuclease ABC subunit A  54.8 
 
 		 963 aa  1014    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0926  excinuclease ABC subunit A  54.98 
 
 		 967 aa  1051    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2165  excinuclease ABC, A subunit  54.14 
 
 		 961 aa  999    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611156  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2988  excinuclease ABC subunit A  55.64 
 
 		 973 aa  1043    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2016  excinuclease ABC subunit A  56.1 
 
 		 923 aa  1003    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0146  excinuclease ABC, A subunit  55.72 
 
 		 942 aa  1021    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1396  excinuclease ABC subunit A  55.38 
 
 		 970 aa  1028    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.398652  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0337  excinuclease ABC subunit A  60.3 
 
 		 939 aa  1142    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0329  excinuclease ABC subunit A  60.19 
 
 		 939 aa  1144    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4529  excinuclease ABC subunit A  53.42 
 
 		 1004 aa  1011    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.388668 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3421  excinuclease ABC subunit A  55.61 
 
 		 950 aa  1017    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00603968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0531  excinuclease ABC subunit A  55.4 
 
 		 950 aa  1014    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0391224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3712  excinuclease ABC, A subunit  55.19 
 
 		 953 aa  999    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0944752  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0252  excinuclease ABC (subunit A)  57.01 
 
 		 942 aa  1081    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00117135  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1885  excinuclease ABC subunit A  54.87 
 
 		 957 aa  1043    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.414426  normal  0.621255 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2839  excinuclease ABC, A subunit  53.55 
 
 		 961 aa  1002    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.696224  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09180  excinuclease ABC subunit A  54.97 
 
 		 945 aa  1047    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.533075 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2009  excinuclease ABC subunit A  58.18 
 
 		 943 aa  1075    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.407568  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0374  excinuclease ABC subunit A  54.22 
 
 		 952 aa  1012    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1317  excinuclease ATPase subunit  56.14 
 
 		 953 aa  1061    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.133455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0393  excinuclease ABC subunit A  53.82 
 
 		 952 aa  997    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1722  excinuclease ABC subunit A  56.4 
 
 		 941 aa  1060    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2079  excinuclease ABC subunit A  54.97 
 
 		 975 aa  1018    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.224045  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2779  excinuclease ABC, A subunit  54.14 
 
 		 961 aa  999    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3616  excinuclease ABC subunit A  55.43 
 
 		 950 aa  1046    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0557208 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3592  excinuclease ABC subunit A  55.4 
 
 		 950 aa  1016    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0287106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1109  excinuclease ABC subunit A  57.17 
 
 		 947 aa  1085    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.57709  normal  0.229428 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3515  excinuclease ABC, A subunit  58.95 
 
 		 954 aa  1109    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000620303  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2252  excinuclease ABC subunit A  55.8 
 
 		 959 aa  1025    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.174561  normal  0.0315795 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2524  excinuclease ABC subunit A  55.74 
 
 		 1019 aa  1073    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.247426  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0514  excinuclease ABC, A subunit  54.98 
 
 		 942 aa  1008    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3032  excinuclease ABC subunit A  55.64 
 
 		 973 aa  1043    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.69865 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0369  excinuclease ABC, A subunit  56 
 
 		 945 aa  1033    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3339  excinuclease ABC subunit A  56.02 
 
 		 967 aa  1062    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818177 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0746  excinuclease ABC, A subunit  56.69 
 
 		 940 aa  1045    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>