More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0304 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0546  excinuclease ABC, A subunit  38.95 
 
 		 946 aa  656    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0457921  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2758  excinuclease ABC family protein  57.03 
 
 		 1855 aa  2100    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3325  excinuclease ABC, A subunit  38.33 
 
 		 937 aa  649    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0483  excinuclease ABC subunit A  39.07 
 
 		 944 aa  637    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000649364 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1501  excinuclease ABC, subunit A, form 2  66.9 
 
 		 1970 aa  2592    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.776377  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2429  excinuclease ABC, A subunit  39.4 
 
 		 931 aa  713    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19031  excinuclease ABC subunit A  39.52 
 
 		 966 aa  664    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0427  excinuclease ABC subunit A  38.76 
 
 		 944 aa  654    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3548  excinuclease ABC subunit A  39.41 
 
 		 967 aa  642    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.658203  normal  0.309926 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1525  excinuclease ABC subunit A  39.96 
 
 		 925 aa  652    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000267289  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0994  excinuclease ABC subunit A  67.03 
 
 		 1945 aa  2668    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0618908 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5271  excinuclease ABC subunit A  37.43 
 
 		 958 aa  648    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4379  excinuclease ABC, A subunit  37.63 
 
 		 962 aa  641    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121684  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3339  excinuclease ABC subunit A  39.02 
 
 		 967 aa  639    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818177 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19211  excinuclease ABC subunit A  39.83 
 
 		 967 aa  668    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1218  excinuclease ABC, subunit A, form 2  66.9 
 
 		 1970 aa  2592    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.13215  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0654  excinuclease ABC, A subunit  39.11 
 
 		 992 aa  642    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5015  excinuclease ABC subunit A  37.43 
 
 		 958 aa  648    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.93666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4844  excinuclease ABC subunit A  37.43 
 
 		 958 aa  648    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4859  excinuclease ABC subunit A  37.43 
 
 		 958 aa  649    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0062  excinuclease ABC, subunit A, form 2  66.9 
 
 		 1970 aa  2592    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3065  excinuclease ABC, A subunit  37.79 
 
 		 956 aa  656    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000246359  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_19021  excinuclease ABC subunit A  40.11 
 
 		 967 aa  674    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4520  excinuclease ABC subunit A  38.74 
 
 		 961 aa  642    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.308582 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1685  excinuclease ABC subunit A  39.24 
 
 		 968 aa  653    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4831  excinuclease ABC subunit A  39.21 
 
 		 978 aa  649    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2024  excinuclease ABC subunit A  40.08 
 
 		 945 aa  684    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136428  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1323  excinuclease ABC subunit A  40.21 
 
 		 980 aa  672    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4240  UvrA family protein  67.01 
 
 		 1957 aa  2627    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.591545  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2710  excinuclease ABC subunit A  37.73 
 
 		 1008 aa  649    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00698098 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0436  excinuclease ABC subunit A  38.34 
 
 		 940 aa  647    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.64292  normal  0.354082 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3591  excinuclease ABC subunit A  40.06 
 
 		 965 aa  665    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.240208  normal  0.0431372 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1568  excinuclease ABC, subunit A, form 2  67.04 
 
 		 1971 aa  2605    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.49006  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0078  excinuclease ABC subunit A  53.71 
 
 		 1867 aa  2008    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5051  excinuclease ABC subunit A  38.57 
 
 		 944 aa  640    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0371407 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3747  UvrA family protein  77.4 
 
 		 1941 aa  3169    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0522  excinuclease ABC subunit A  38.47 
 
 		 944 aa  661    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0045705  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7351  UvrA family protein  66.8 
 
 		 1967 aa  2638    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.965085  normal  0.937028 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0539  excinuclease ABC subunit A  39.18 
 
 		 956 aa  679    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.111546  normal  0.557 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1662  excinuclease ABC subunit A  39.69 
 
 		 958 aa  645    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2317  excinuclease ABC subunit A  41.02 
 
 		 976 aa  651    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.458787  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0154  excinuclease ABC subunit A  38.84 
 
 		 951 aa  659    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.676306  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1301  excinuclease ABC subunit A  39.82 
 
 		 942 aa  710    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0773804  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2691  excinuclease ABC subunit A  41.54 
 
 		 987 aa  675    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0128  excinuclease ABC subunit A  37.93 
 
 		 937 aa  642    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2580  UvrA family protein  56.3 
 
 		 1892 aa  2075    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.603689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3346  UvrA family protein  69.68 
 
 		 1929 aa  2738    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.973275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5395  excinuclease ABC subunit A  37.43 
 
 		 958 aa  648    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1804  excinuclease ABC subunit A  39.81 
 
 		 967 aa  675    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0848  excinuclease ABC subunit A  40.54 
 
 		 1003 aa  667    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.23949 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2229  excinuclease ABC, A subunit  40.16 
 
 		 944 aa  650    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.748559  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0255  excinuclease ABC subunit A  38.91 
 
 		 971 aa  637    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0075  excinuclease ABC, subunit A, form 2  67.21 
 
 		 2021 aa  2617    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1127  excinuclease ABC subunit A  38.11 
 
 		 966 aa  648    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1631  excinuclease ABC subunit A  39.67 
 
 		 976 aa  643    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.978501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0783  excinuclease ABC subunit A  37.57 
 
 		 948 aa  646    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.686779  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2940  excinuclease ABC subunit A  39.31 
 
 		 995 aa  641    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3814  excinuclease ABC, A subunit  70.95 
 
 		 2098 aa  2974    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0572  excinuclease ABC, A subunit  41.05 
 
 		 976 aa  665    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.114911  normal  0.199492 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4139  UvrA family protein  71.69 
 
 		 2024 aa  2922    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.79148 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3001  UvrA family protein  65.62 
 
 		 1971 aa  2595    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1158  excinuclease ABC subunit A  36.79 
 
 		 941 aa  639    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3709  excinuclease ABC subunit A  37.87 
 
 		 956 aa  645    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1960  excinuclease ABC, A subunit  39.24 
 
 		 968 aa  649    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4549  excinuclease ABC subunit A  66.91 
 
 		 1959 aa  2656    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.179328 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0776  excinuclease ABC subunit A  40.8 
 
 		 981 aa  681    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.839433  normal  0.0723742 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2022  excinuclease ABC subunit A  40.62 
 
 		 973 aa  738    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2246  excinuclease ABC, A subunit  52.46 
 
 		 1896 aa  1887    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186636  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5608  excinuclease ABC, A subunit  66.7 
 
 		 1964 aa  2625    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0516  excinuclease ABC subunit A  39.26 
 
 		 944 aa  640    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.567244  normal  0.0841787 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4341  excinuclease ABC, A subunit  79.88 
 
 		 1969 aa  3217    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.580395 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0488  excinuclease ABC, A subunit  72.37 
 
 		 1965 aa  2899    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0158  excinuclease ABC subunit A  37.08 
 
 		 947 aa  650    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.509879 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1084  excinuclease ABC, A subunit  38.12 
 
 		 936 aa  650    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.293507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0337  excinuclease ABC subunit A  36.44 
 
 		 939 aa  641    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0329  excinuclease ABC subunit A  36.39 
 
 		 939 aa  644    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4529  excinuclease ABC subunit A  37.84 
 
 		 1004 aa  648    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.388668 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1703  excinuclease ABC subunit A  39.03 
 
 		 949 aa  680    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0304  excinuclease ABC, A subunit  100 
 
 		 2005 aa  4065    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2185  excinuclease ABC, A subunit  54.39 
 
 		 2175 aa  781    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.124158 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0252  excinuclease ABC (subunit A)  38.52 
 
 		 942 aa  665    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00117135  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6248  excinuclease ABC, A subunit  66.5 
 
 		 1996 aa  2632    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0074  excinuclease ABC, A subunit  66.9 
 
 		 1970 aa  2592    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.862604  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0103  excinuclease ABC subunit A  41.21 
 
 		 1016 aa  650    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  unclonable  0.00106223  normal  0.272791 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0374  excinuclease ABC subunit A  37.19 
 
 		 952 aa  650    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0073  excinuclease ABC, A subunit  66.94 
 
 		 1997 aa  2602    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0393  excinuclease ABC subunit A  37.37 
 
 		 952 aa  636    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11654  excinuclease ABC subunit A  40.23 
 
 		 972 aa  653    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.550141 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0384  excinuclease ABC subunit A  37.49 
 
 		 954 aa  640    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000942847  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5972  excinuclease ABC, A subunit  66.7 
 
 		 1964 aa  2625    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0125228 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0731  excinuclease ABC, A subunit  43.29 
 
 		 1895 aa  1404    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3616  excinuclease ABC subunit A  38.18 
 
 		 950 aa  647    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0557208 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0440  excinuclease ABC subunit A  40.57 
 
 		 916 aa  668    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.674144  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1109  excinuclease ABC subunit A  39.75 
 
 		 947 aa  689    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.57709  normal  0.229428 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0168  excinuclease ABC subunit A  38.62 
 
 		 921 aa  664    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3111  excinuclease ABC subunit A  40.02 
 
 		 987 aa  668    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.400929  normal  0.194384 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2057  excinuclease ABC subunit A  39.96 
 
 		 965 aa  658    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0577341  normal  0.730418 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1939  excinuclease ABC subunit A  39.15 
 
 		 950 aa  673    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0317613  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2524  excinuclease ABC subunit A  38.77 
 
 		 1019 aa  662    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.247426  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21961  excinuclease ABC subunit A  40.02 
 
 		 980 aa  669    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>