More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0075 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0610  excinuclease ABC subunit A  27.51 
 
 
1787 aa  663    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0546  excinuclease ABC, A subunit  39.52 
 
 
946 aa  665    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0457921  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2758  excinuclease ABC family protein  60.16 
 
 
1855 aa  2188    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3325  excinuclease ABC, A subunit  39.39 
 
 
937 aa  664    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1218  excinuclease ABC, subunit A, form 2  94.17 
 
 
1970 aa  3632    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.13215  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1010  excinuclease ABC subunit A  38.48 
 
 
954 aa  645    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0427  excinuclease ABC subunit A  39.26 
 
 
944 aa  664    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0074  excinuclease ABC, A subunit  94.17 
 
 
1970 aa  3632    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.862604  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0916  excinuclease ABC, A subunit  37.6 
 
 
931 aa  643    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0311  excinuclease ABC subunit A  38.71 
 
 
942 aa  643    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00463978  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0994  excinuclease ABC subunit A  81.57 
 
 
1945 aa  3182    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0618908 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5271  excinuclease ABC subunit A  39.23 
 
 
958 aa  669    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4831  excinuclease ABC subunit A  40.1 
 
 
978 aa  657    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5015  excinuclease ABC subunit A  39.23 
 
 
958 aa  670    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.93666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4844  excinuclease ABC subunit A  39.23 
 
 
958 aa  669    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4859  excinuclease ABC subunit A  39.23 
 
 
958 aa  669    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0062  excinuclease ABC, subunit A, form 2  94.17 
 
 
1970 aa  3632    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0304  excinuclease ABC, A subunit  67.55 
 
 
2005 aa  2683    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0473  excinuclease ABC subunit A  40.06 
 
 
941 aa  640    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.78914 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2024  excinuclease ABC subunit A  41.97 
 
 
945 aa  682    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136428  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1323  excinuclease ABC subunit A  39.72 
 
 
980 aa  672    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19031  excinuclease ABC subunit A  41.26 
 
 
966 aa  679    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4240  UvrA family protein  83.86 
 
 
1957 aa  3235    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.591545  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2710  excinuclease ABC subunit A  39.42 
 
 
1008 aa  671    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00698098 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0436  excinuclease ABC subunit A  39.98 
 
 
940 aa  637    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.64292  normal  0.354082 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3591  excinuclease ABC subunit A  40.52 
 
 
965 aa  664    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.240208  normal  0.0431372 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1568  excinuclease ABC, subunit A, form 2  94.28 
 
 
1971 aa  3640    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.49006  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0078  excinuclease ABC subunit A  56.22 
 
 
1867 aa  2097    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_19021  excinuclease ABC subunit A  40.77 
 
 
967 aa  668    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0087  excinuclease ABC, A subunit  39.2 
 
 
937 aa  641    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000141309  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7351  UvrA family protein  91.57 
 
 
1967 aa  3579    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.965085  normal  0.937028 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0539  excinuclease ABC subunit A  40.76 
 
 
956 aa  687    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.111546  normal  0.557 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1662  excinuclease ABC subunit A  39.62 
 
 
958 aa  652    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2317  excinuclease ABC subunit A  40.18 
 
 
976 aa  646    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.458787  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0154  excinuclease ABC subunit A  38.98 
 
 
951 aa  658    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.676306  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1301  excinuclease ABC subunit A  40.45 
 
 
942 aa  710    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0773804  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2691  excinuclease ABC subunit A  40.62 
 
 
987 aa  673    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0128  excinuclease ABC subunit A  39.19 
 
 
937 aa  656    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2580  UvrA family protein  58.44 
 
 
1892 aa  2140    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.603689  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21961  excinuclease ABC subunit A  39.63 
 
 
980 aa  672    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4509  excinuclease ABC, A subunit  37.57 
 
 
943 aa  649    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5395  excinuclease ABC subunit A  39.23 
 
 
958 aa  670    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1804  excinuclease ABC subunit A  40.51 
 
 
967 aa  666    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0848  excinuclease ABC subunit A  39.94 
 
 
1003 aa  665    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.23949 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2229  excinuclease ABC, A subunit  41.12 
 
 
944 aa  676    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.748559  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19211  excinuclease ABC subunit A  41.07 
 
 
967 aa  665    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0073  excinuclease ABC, A subunit  94.32 
 
 
1997 aa  3635    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0255  excinuclease ABC subunit A  41.04 
 
 
971 aa  658    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0075  excinuclease ABC, subunit A, form 2  100 
 
 
2021 aa  4101    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1127  excinuclease ABC subunit A  39.21 
 
 
966 aa  647    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1631  excinuclease ABC subunit A  42.5 
 
 
976 aa  659    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.978501  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2429  excinuclease ABC, A subunit  40.52 
 
 
931 aa  719    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1160  excinuclease ABC, A subunit  38.65 
 
 
953 aa  654    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.216625  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3814  excinuclease ABC, A subunit  66.77 
 
 
2098 aa  2175    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3346  UvrA family protein  71.97 
 
 
1929 aa  2772    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.973275  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4139  UvrA family protein  67.91 
 
 
2024 aa  2741    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.79148 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3001  UvrA family protein  86.35 
 
 
1971 aa  3372    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1158  excinuclease ABC subunit A  39.23 
 
 
941 aa  665    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0448  excinuclease ABC subunit A  41.63 
 
 
957 aa  670    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.775809  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3747  UvrA family protein  71.18 
 
 
1941 aa  2796    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1501  excinuclease ABC, subunit A, form 2  94.17 
 
 
1970 aa  3632    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.776377  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4549  excinuclease ABC subunit A  82.17 
 
 
1959 aa  3211    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.179328 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0776  excinuclease ABC subunit A  42.17 
 
 
981 aa  725    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.839433  normal  0.0723742 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2022  excinuclease ABC subunit A  42.16 
 
 
973 aa  760    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2246  excinuclease ABC, A subunit  54.4 
 
 
1896 aa  1932    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186636  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0976  excinuclease ABC subunit A  40.24 
 
 
931 aa  660    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.177637  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5608  excinuclease ABC, A subunit  90.87 
 
 
1964 aa  3549    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2988  excinuclease ABC subunit A  41.04 
 
 
973 aa  645    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3003  excinuclease ABC subunit A  41.04 
 
 
973 aa  646    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.855569  normal  0.034696 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0158  excinuclease ABC subunit A  38.86 
 
 
947 aa  669    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.509879 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0853  excinuclease ABC subunit A  38.29 
 
 
954 aa  650    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0337  excinuclease ABC subunit A  37.92 
 
 
939 aa  666    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0329  excinuclease ABC subunit A  38.45 
 
 
939 aa  670    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4529  excinuclease ABC subunit A  39.17 
 
 
1004 aa  652    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.388668 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3421  excinuclease ABC subunit A  39.76 
 
 
950 aa  657    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00603968  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2185  excinuclease ABC, A subunit  53.88 
 
 
2175 aa  789    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.124158 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2748  excinuclease ABC subunit A  42.24 
 
 
940 aa  644    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0880957  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1322  excinuclease ABC, A subunit  39.74 
 
 
934 aa  642    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0124703  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0252  excinuclease ABC (subunit A)  39.44 
 
 
942 aa  661    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00117135  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6248  excinuclease ABC, A subunit  90.71 
 
 
1996 aa  3570    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09180  excinuclease ABC subunit A  40.81 
 
 
945 aa  669    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.533075 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2009  excinuclease ABC subunit A  39.68 
 
 
943 aa  650    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.407568  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0374  excinuclease ABC subunit A  39.03 
 
 
952 aa  664    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1317  excinuclease ATPase subunit  39.84 
 
 
953 aa  660    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.133455  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0393  excinuclease ABC subunit A  41.3 
 
 
952 aa  694    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1722  excinuclease ABC subunit A  39.24 
 
 
941 aa  644    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3111  excinuclease ABC subunit A  42.02 
 
 
987 aa  688    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.400929  normal  0.194384 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5972  excinuclease ABC, A subunit  90.87 
 
 
1964 aa  3549    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0125228 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0731  excinuclease ABC, A subunit  45.12 
 
 
1895 aa  1429    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231834  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3616  excinuclease ABC subunit A  40.26 
 
 
950 aa  664    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0557208 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1109  excinuclease ABC subunit A  41.67 
 
 
947 aa  685    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.57709  normal  0.229428 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3515  excinuclease ABC, A subunit  38.93 
 
 
954 aa  647    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000620303  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3065  excinuclease ABC, A subunit  42.03 
 
 
956 aa  741    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000246359  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1939  excinuclease ABC subunit A  40.62 
 
 
950 aa  675    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0317613  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2524  excinuclease ABC subunit A  41.05 
 
 
1019 aa  680    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.247426  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3032  excinuclease ABC subunit A  41.04 
 
 
973 aa  645    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.69865 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0369  excinuclease ABC, A subunit  39.72 
 
 
945 aa  662    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0522  excinuclease ABC subunit A  39.28 
 
 
944 aa  671    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0045705  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30191  excinuclease ABC subunit A  40.12 
 
 
991 aa  637    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.213667 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4341  excinuclease ABC, A subunit  70.9 
 
 
1969 aa  2783    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.580395 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>