More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1301 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03930  excinuclease ABC subunit A  44.03 
 
 		 940 aa  753    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.166439  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3934  excinuclease ABC, A subunit  44.03 
 
 		 940 aa  752    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0546  excinuclease ABC, A subunit  44.58 
 
 		 946 aa  801    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0457921  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2758  excinuclease ABC family protein  44 
 
 		 1855 aa  761    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3325  excinuclease ABC, A subunit  46.84 
 
 		 937 aa  845    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0483  excinuclease ABC subunit A  43.01 
 
 		 944 aa  751    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000649364 
 
 
-
 
NC_002950  PG2210  excinuclease ABC, A subunit  46.05 
 
 		 952 aa  839    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1010  excinuclease ABC subunit A  42.62 
 
 		 954 aa  746    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0427  excinuclease ABC subunit A  44.36 
 
 		 944 aa  788    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2694  excinuclease ABC, A subunit  42.95 
 
 		 942 aa  737    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0916  excinuclease ABC, A subunit  41.73 
 
 		 931 aa  731    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0420  excinuclease ABC subunit A  42.87 
 
 		 954 aa  742    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.790766  normal  0.236129 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0994  excinuclease ABC subunit A  41.94 
 
 		 1945 aa  729    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0618908 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5271  excinuclease ABC subunit A  42.83 
 
 		 958 aa  773    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0920  excinuclease ABC, A subunit  43.8 
 
 		 943 aa  758    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1709  excinuclease ABC subunit A  42.53 
 
 		 942 aa  746    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0152505  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1104  excinuclease ABC subunit A  42.9 
 
 		 974 aa  748    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.807702  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0654  excinuclease ABC, A subunit  42.04 
 
 		 992 aa  743    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5015  excinuclease ABC subunit A  42.93 
 
 		 958 aa  775    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.93666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4844  excinuclease ABC subunit A  42.93 
 
 		 958 aa  775    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl059  repair endonuclease subunit A  43.23 
 
 		 949 aa  738    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4859  excinuclease ABC subunit A  42.93 
 
 		 958 aa  775    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0451  excinuclease ABC subunit A  44.26 
 
 		 951 aa  783    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0427  excinuclease ABC subunit A  44.16 
 
 		 951 aa  781    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4520  excinuclease ABC subunit A  42.08 
 
 		 961 aa  747    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.308582 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1685  excinuclease ABC subunit A  42.46 
 
 		 968 aa  753    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0473  excinuclease ABC subunit A  42.49 
 
 		 941 aa  745    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.78914 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2024  excinuclease ABC subunit A  45.02 
 
 		 945 aa  833    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136428  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0367  excinuclease ABC subunit A  43.11 
 
 		 954 aa  739    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2710  excinuclease ABC subunit A  44.9 
 
 		 1008 aa  786    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00698098 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0436  excinuclease ABC subunit A  44.09 
 
 		 940 aa  761    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.64292  normal  0.354082 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1568  excinuclease ABC subunit A  41.79 
 
 		 993 aa  729    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.524179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3591  excinuclease ABC subunit A  42.96 
 
 		 965 aa  737    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.240208  normal  0.0431372 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0078  excinuclease ABC subunit A  43.76 
 
 		 1867 aa  761    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3021  excinuclease ABC subunit A  44.11 
 
 		 953 aa  747    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5051  excinuclease ABC subunit A  42.56 
 
 		 944 aa  743    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0371407 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0087  excinuclease ABC, A subunit  46.07 
 
 		 937 aa  811    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000141309  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0539  excinuclease ABC subunit A  75.64 
 
 		 956 aa  1480    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.111546  normal  0.557 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0154  excinuclease ABC subunit A  43.07 
 
 		 951 aa  735    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.676306  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1301  excinuclease ABC subunit A  100 
 
 		 942 aa  1945    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0773804  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0128  excinuclease ABC subunit A  46.42 
 
 		 937 aa  842    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2580  UvrA family protein  42.93 
 
 		 1892 aa  739    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.603689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0324  excinuclease ABC, A subunit  43.46 
 
 		 935 aa  744    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.71267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5395  excinuclease ABC subunit A  42.93 
 
 		 958 aa  775    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2229  excinuclease ABC, A subunit  43.02 
 
 		 944 aa  748    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.748559  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0774  excinuclease ABC, A subunit  41.88 
 
 		 946 aa  739    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1752  excinuclease ABC subunit A  45.69 
 
 		 950 aa  801    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72619  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0255  excinuclease ABC subunit A  44.95 
 
 		 971 aa  784    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1127  excinuclease ABC subunit A  43.22 
 
 		 966 aa  783    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1631  excinuclease ABC subunit A  43.23 
 
 		 976 aa  778    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.978501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1192  excinuclease ABC subunit A  43.37 
 
 		 970 aa  793    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.548367  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1160  excinuclease ABC, A subunit  44.54 
 
 		 953 aa  781    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.216625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0993  excinuclease ABC subunit A  43.01 
 
 		 946 aa  758    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.883407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2426  excinuclease ABC subunit A  42.84 
 
 		 939 aa  745    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1158  excinuclease ABC subunit A  46.63 
 
 		 941 aa  835    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0448  excinuclease ABC subunit A  43.85 
 
 		 957 aa  754    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.775809  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1960  excinuclease ABC, A subunit  42.36 
 
 		 968 aa  752    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0313  excinuclease ABC subunit A  43.11 
 
 		 955 aa  741    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0776  excinuclease ABC subunit A  43.82 
 
 		 981 aa  766    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.839433  normal  0.0723742 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2022  excinuclease ABC subunit A  47.99 
 
 		 973 aa  892    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0926  excinuclease ABC subunit A  43.46 
 
 		 967 aa  763    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2988  excinuclease ABC subunit A  42.98 
 
 		 973 aa  774    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2016  excinuclease ABC subunit A  43.32 
 
 		 923 aa  734    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0146  excinuclease ABC, A subunit  43.17 
 
 		 942 aa  752    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1396  excinuclease ABC subunit A  42.06 
 
 		 970 aa  729    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.398652  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0158  excinuclease ABC subunit A  43.25 
 
 		 947 aa  758    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.509879 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3698  excinuclease ABC subunit A  49.09 
 
 		 944 aa  848    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0337  excinuclease ABC subunit A  43.79 
 
 		 939 aa  822    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0329  excinuclease ABC subunit A  43.58 
 
 		 939 aa  819    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1128  excinuclease ABC subunit A  43.35 
 
 		 943 aa  750    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0168519  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4529  excinuclease ABC subunit A  41.29 
 
 		 1004 aa  733    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.388668 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3421  excinuclease ABC subunit A  42.83 
 
 		 950 aa  730    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00603968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0531  excinuclease ABC subunit A  42.83 
 
 		 950 aa  729    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0391224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3712  excinuclease ABC, A subunit  43.45 
 
 		 953 aa  730    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0944752  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0252  excinuclease ABC (subunit A)  43.51 
 
 		 942 aa  777    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00117135  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1885  excinuclease ABC subunit A  44.51 
 
 		 957 aa  770    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.414426  normal  0.621255 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09180  excinuclease ABC subunit A  42.42 
 
 		 945 aa  746    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.533075 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2009  excinuclease ABC subunit A  44.49 
 
 		 943 aa  788    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.407568  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0374  excinuclease ABC subunit A  44.39 
 
 		 952 aa  801    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1317  excinuclease ATPase subunit  43.45 
 
 		 953 aa  774    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.133455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0393  excinuclease ABC subunit A  42.78 
 
 		 952 aa  761    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1722  excinuclease ABC subunit A  42.66 
 
 		 941 aa  760    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2079  excinuclease ABC subunit A  43.57 
 
 		 975 aa  777    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.224045  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3616  excinuclease ABC subunit A  44.42 
 
 		 950 aa  795    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0557208 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3592  excinuclease ABC subunit A  42.83 
 
 		 950 aa  732    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0287106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1109  excinuclease ABC subunit A  44.38 
 
 		 947 aa  812    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.57709  normal  0.229428 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3515  excinuclease ABC, A subunit  45.86 
 
 		 954 aa  820    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000620303  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1939  excinuclease ABC subunit A  74.23 
 
 		 950 aa  1430    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0317613  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2252  excinuclease ABC subunit A  42.53 
 
 		 959 aa  731    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.174561  normal  0.0315795 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2524  excinuclease ABC subunit A  43.95 
 
 		 1019 aa  808    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.247426  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3032  excinuclease ABC subunit A  42.98 
 
 		 973 aa  774    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.69865 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0369  excinuclease ABC, A subunit  43.14 
 
 		 945 aa  749    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3339  excinuclease ABC subunit A  43.38 
 
 		 967 aa  771    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818177 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0746  excinuclease ABC, A subunit  43.47 
 
 		 940 aa  743    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3747  UvrA family protein  41.3 
 
 		 1941 aa  729    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0735  excinuclease ABC subunit A  42.47 
 
 		 964 aa  739    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0936204  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0976  excinuclease ABC subunit A  45.08 
 
 		 931 aa  795    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.177637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0311  excinuclease ABC subunit A  47.32 
 
 		 942 aa  820    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00463978  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1322  excinuclease ABC, A subunit  44.43 
 
 		 934 aa  779    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0124703  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3755  excinuclease ABC, A subunit  42.52 
 
 		 960 aa  730    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0309833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>