More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2185 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03930  excinuclease ABC subunit A  39.88 
 
 		 940 aa  654    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.166439  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3934  excinuclease ABC, A subunit  39.88 
 
 		 940 aa  653    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2758  excinuclease ABC family protein  61.41 
 
 		 1855 aa  881    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3969  excinuclease ABC subunit A  39.88 
 
 		 940 aa  653    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0893236 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0074  excinuclease ABC, A subunit  53.61 
 
 		 1970 aa  770    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.862604  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4702  excinuclease ABC, A subunit  54.33 
 
 		 1981 aa  758    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2246  excinuclease ABC, A subunit  67.59 
 
 		 1896 aa  768    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186636  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0994  excinuclease ABC subunit A  54.2 
 
 		 1945 aa  797    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0618908 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5945  excinuclease ABC, A subunit  54.99 
 
 		 1996 aa  795    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6472  excinuclease ABC, A subunit  54.48 
 
 		 1964 aa  780    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.225819 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1549  excinuclease ABC, A subunit  53.76 
 
 		 1997 aa  786    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0062  excinuclease ABC, subunit A, form 2  53.61 
 
 		 1970 aa  770    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4441  excinuclease ABC, A subunit  54.37 
 
 		 1949 aa  810    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.407349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1809  excinuclease ABC subunit A  42.52 
 
 		 953 aa  671    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2142  excinuclease ABC, A subunit  41.46 
 
 		 949 aa  648    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.364139 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2024  excinuclease ABC subunit A  43.21 
 
 		 945 aa  706    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136428  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4240  UvrA family protein  54.22 
 
 		 1957 aa  791    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.591545  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0110  excinuclease ABC, A subunit  53.58 
 
 		 2017 aa  797    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5541  excinuclease ABC, A subunit  54.81 
 
 		 1974 aa  775    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0115667 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0976  excinuclease ABC subunit A  41.8 
 
 		 931 aa  709    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.177637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3028  excinuclease ABC, A subunit  55.05 
 
 		 1976 aa  798    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.500259  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1347  excinuclease ABC subunit A  37.5 
 
 		 941 aa  654    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0483663  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1568  excinuclease ABC, subunit A, form 2  53.61 
 
 		 1971 aa  769    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.49006  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0078  excinuclease ABC subunit A  59.09 
 
 		 1867 aa  860    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3021  excinuclease ABC subunit A  40.54 
 
 		 953 aa  642    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7351  UvrA family protein  54.74 
 
 		 1967 aa  785    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.965085  normal  0.937028 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0844  excinuclease ABC, A subunit  43.47 
 
 		 945 aa  685    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.752183  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4300  excinuclease ABC subunit A  39.88 
 
 		 940 aa  653    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4503  excinuclease ABC subunit A  40.35 
 
 		 941 aa  655    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.638684  normal  0.38667 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4572  excinuclease ABC subunit A  39.88 
 
 		 940 aa  653    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03890  hypothetical protein  39.88 
 
 		 940 aa  654    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108875  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2580  UvrA family protein  62.35 
 
 		 1892 aa  867    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.603689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1438  excinuclease ABC, A subunit  54.37 
 
 		 1983 aa  795    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.836359  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4574  excinuclease ABC, A subunit  54.37 
 
 		 1949 aa  810    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.479669 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0075  excinuclease ABC, subunit A, form 2  54.26 
 
 		 2021 aa  759    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2196  excinuclease ABC, A subunit  43.54 
 
 		 970 aa  672    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1501  excinuclease ABC, subunit A, form 2  53.61 
 
 		 1970 aa  770    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.776377  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3814  excinuclease ABC, A subunit  52.34 
 
 		 2098 aa  771    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0993  excinuclease ABC subunit A  39.42 
 
 		 946 aa  671    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.883407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5561  excinuclease ABC subunit A  39.98 
 
 		 940 aa  654    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.543966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4139  UvrA family protein  53.9 
 
 		 2024 aa  777    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.79148 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0304  excinuclease ABC, A subunit  54.39 
 
 		 2005 aa  780    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3001  UvrA family protein  54.24 
 
 		 1971 aa  791    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4511  excinuclease ABC subunit A  40.35 
 
 		 941 aa  656    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3511  excinuclease ABC subunit A  40.33 
 
 		 944 aa  658    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4549  excinuclease ABC subunit A  53.35 
 
 		 1959 aa  788    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.179328 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4520  excinuclease ABC subunit A  39.88 
 
 		 940 aa  653    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0261  excinuclease ABC subunit A  39.19 
 
 		 940 aa  647    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.358173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5608  excinuclease ABC, A subunit  54.73 
 
 		 1964 aa  783    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1893  excinuclease ABC, A subunit  38.94 
 
 		 945 aa  684    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0808708  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4192  excinuclease ABC, A subunit  53.53 
 
 		 1935 aa  775    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000700694 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4610  excinuclease ABC subunit A  39.88 
 
 		 940 aa  653    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3346  UvrA family protein  52.22 
 
 		 1929 aa  755    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.973275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1218  excinuclease ABC, subunit A, form 2  53.61 
 
 		 1970 aa  770    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.13215  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2185  excinuclease ABC, A subunit  100 
 
 		 2175 aa  4408    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.124158 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1444  excinuclease ABC, A subunit  58.27 
 
 		 1889 aa  845    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6248  excinuclease ABC, A subunit  54.78 
 
 		 1996 aa  795    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4598  excinuclease ABC subunit A  40.45 
 
 		 941 aa  657    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4597  excinuclease ABC subunit A  40.35 
 
 		 941 aa  656    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3661  excinuclease ABC subunit A  40.18 
 
 		 944 aa  664    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0737166  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00223  excinuclease ABC subunit A  39.92 
 
 		 943 aa  659    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.44866  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5972  excinuclease ABC, A subunit  54.73 
 
 		 1964 aa  783    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0125228 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07070  Excinuclease ABC subunit A  40.91 
 
 		 954 aa  667    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.478607 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0411  excinuclease ABC, A subunit  41.76 
 
 		 957 aa  713    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0344  excinuclease ABC subunit A  37.52 
 
 		 943 aa  645    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  unclonable  0.0000000163332  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3107  excinuclease ABC subunit A  39.77 
 
 		 988 aa  669    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.378595 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0073  excinuclease ABC, A subunit  53.49 
 
 		 1997 aa  766    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5952  excinuclease ABC, A subunit  54.49 
 
 		 1984 aa  775    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4341  excinuclease ABC, A subunit  53.54 
 
 		 1969 aa  752    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.580395 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4649  excinuclease ABC subunit A  40.35 
 
 		 941 aa  656    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.768489 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0488  excinuclease ABC, A subunit  53.51 
 
 		 1965 aa  790    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3747  UvrA family protein  54.91 
 
 		 1941 aa  791    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0538  excinuclease ABC subunit A  42.2 
 
 		 970 aa  635  1e-180  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.566614  normal  0.542221 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2176  excinuclease ABC, A subunit  47.43 
 
 		 1840 aa  593  1e-167  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1053  excinuclease ABC, A subunit  54.37 
 
 		 927 aa  558  1e-157  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00826345  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0255  excinuclease ABC subunit A  57.17 
 
 		 971 aa  548  1e-154  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0848  excinuclease ABC subunit A  54.99 
 
 		 1003 aa  544  1e-153  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.23949 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3111  excinuclease ABC subunit A  55.68 
 
 		 987 aa  541  9.999999999999999e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.400929  normal  0.194384 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2709  excinuclease ABC, A subunit  44.5 
 
 		 1995 aa  540  1e-151  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.350248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3339  excinuclease ABC subunit A  55.49 
 
 		 987 aa  538  1e-151  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.535422  hitchhiker  0.000450974 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3065  excinuclease ABC, A subunit  53.35 
 
 		 956 aa  540  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000246359  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0294  excinuclease ABC, A subunit  55.45 
 
 		 946 aa  532  1e-149  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0704  excinuclease ABC, A subunit  52.2 
 
 		 939 aa  530  1e-149  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0337  excinuclease ABC subunit A  49.91 
 
 		 939 aa  531  1e-149  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0474  excinuclease ABC, A subunit  53.15 
 
 		 946 aa  529  1e-148  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0183853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0037  excinuclease ABC subunit A  51.15 
 
 		 920 aa  530  1e-148  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2585  excinuclease ABC subunit A  53 
 
 		 979 aa  529  1e-148  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.771268  normal  0.888283 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1158  excinuclease ABC subunit A  51.82 
 
 		 941 aa  530  1e-148  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0329  excinuclease ABC subunit A  49.72 
 
 		 939 aa  529  1e-148  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4529  excinuclease ABC subunit A  52.17 
 
 		 1004 aa  528  1e-148  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.388668 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0252  excinuclease ABC (subunit A)  52.21 
 
 		 942 aa  528  1e-148  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00117135  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2823  excinuclease ABC, A subunit  53.92 
 
 		 980 aa  528  1e-148  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.179729  normal  0.122251 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2119  excinuclease ABC, A subunit  49.91 
 
 		 942 aa  529  1e-148  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000168396  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0649  excinuclease ABC subunit A  53.32 
 
 		 1002 aa  530  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2036  Excinuclease ABC subunit A  50.76 
 
 		 944 aa  525  1e-147  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0663505  hitchhiker  0.000130956 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0853  excinuclease ABC subunit A  51.41 
 
 		 954 aa  527  1e-147  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1104  excinuclease ABC subunit A  50.38 
 
 		 939 aa  526  1e-147  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0521  excinuclease ABC, A subunit  51.8 
 
 		 948 aa  526  1e-147  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.276548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2038  excinuclease ABC, A subunit  54.89 
 
 		 963 aa  526  1e-147  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225095  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3174  excinuclease ABC subunit A  52.77 
 
 		 955 aa  527  1e-147  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>