More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0110 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2758  excinuclease ABC family protein  61.48 
 
 		 1855 aa  1707    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1437  excinuclease ABC, A subunit  41.26 
 
 		 942 aa  710    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4702  excinuclease ABC, A subunit  56.58 
 
 		 1981 aa  1650    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0074  excinuclease ABC, A subunit  58.07 
 
 		 1970 aa  1647    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.862604  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3637  excinuclease ABC, A subunit  45.56 
 
 		 1847 aa  1115    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719781 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0994  excinuclease ABC subunit A  59.81 
 
 		 1945 aa  1714    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0618908 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1595  excinuclease ABC, A subunit  41.06 
 
 		 2434 aa  657    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4441  excinuclease ABC, A subunit  59.77 
 
 		 1949 aa  1739    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.407349  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0062  excinuclease ABC, subunit A, form 2  58.07 
 
 		 1970 aa  1647    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4419  excinuclease ABC, A subunit  39.04 
 
 		 1043 aa  671    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.834068  normal  0.3832 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5945  excinuclease ABC, A subunit  58.51 
 
 		 1996 aa  1680    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5541  excinuclease ABC, A subunit  58.7 
 
 		 1974 aa  1657    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0115667 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1323  excinuclease ABC subunit A  39.64 
 
 		 980 aa  677    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4240  UvrA family protein  58.99 
 
 		 1957 aa  1679    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.591545  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10450  Excinuclease ABC subunit A  39.83 
 
 		 960 aa  705    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0436929  hitchhiker  0.0000000651145 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0294  excinuclease ABC, A subunit  44.46 
 
 		 946 aa  722    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4583  excinuclease ABC, A subunit  38.21 
 
 		 1013 aa  661    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1568  excinuclease ABC, subunit A, form 2  58.19 
 
 		 1971 aa  1656    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.49006  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0078  excinuclease ABC subunit A  57.4 
 
 		 1867 aa  1634    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3747  UvrA family protein  58.78 
 
 		 1941 aa  1727    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1549  excinuclease ABC, A subunit  57.78 
 
 		 1997 aa  1666    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2823  excinuclease ABC, A subunit  40.86 
 
 		 980 aa  699    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.179729  normal  0.122251 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7351  UvrA family protein  56.98 
 
 		 1967 aa  2149    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.965085  normal  0.937028 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2246  excinuclease ABC, A subunit  55.93 
 
 		 1896 aa  1522    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186636  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1438  excinuclease ABC, A subunit  54.41 
 
 		 1983 aa  2042    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.836359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2580  UvrA family protein  60.61 
 
 		 1892 aa  1678    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.603689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4574  excinuclease ABC, A subunit  59.77 
 
 		 1949 aa  1739    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.479669 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1804  excinuclease ABC subunit A  39.41 
 
 		 967 aa  675    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1007  excinuclease ABC, A subunit  39.61 
 
 		 958 aa  672    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0075  excinuclease ABC, subunit A, form 2  58.3 
 
 		 2021 aa  1666    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0073  excinuclease ABC, A subunit  58.13 
 
 		 1997 aa  1653    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3814  excinuclease ABC, A subunit  56.19 
 
 		 2098 aa  1251    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3346  UvrA family protein  57.93 
 
 		 1929 aa  1107    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.973275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2426  excinuclease ABC subunit A  40.08 
 
 		 939 aa  645    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4139  UvrA family protein  52.7 
 
 		 2024 aa  1599    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.79148 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2585  excinuclease ABC subunit A  40 
 
 		 979 aa  697    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.771268  normal  0.888283 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3001  UvrA family protein  54.84 
 
 		 1971 aa  2041    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0168  excinuclease ABC subunit A  38.33 
 
 		 921 aa  652    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18501  excinuclease ABC subunit A  40.12 
 
 		 979 aa  671    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.95453  normal  0.0541711 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4549  excinuclease ABC subunit A  56.38 
 
 		 1959 aa  2120    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.179328 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3438  excinuclease ABC, A subunit  40 
 
 		 1040 aa  671    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160486 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5608  excinuclease ABC, A subunit  59.57 
 
 		 1964 aa  1057    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1501  excinuclease ABC, subunit A, form 2  58.07 
 
 		 1970 aa  1647    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.776377  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2176  excinuclease ABC, A subunit  47.69 
 
 		 1840 aa  1259    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0304  excinuclease ABC, A subunit  57.86 
 
 		 2005 aa  1701    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21961  excinuclease ABC subunit A  39.68 
 
 		 980 aa  676    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1525  excinuclease ABC subunit A  40 
 
 		 925 aa  654    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000267289  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6472  excinuclease ABC, A subunit  59.57 
 
 		 1964 aa  1059    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.225819 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3028  excinuclease ABC, A subunit  58.59 
 
 		 1976 aa  1723    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.500259  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0866  excinuclease ABC subunit A  38.72 
 
 		 945 aa  660    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2185  excinuclease ABC, A subunit  53.58 
 
 		 2175 aa  797    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.124158 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2709  excinuclease ABC, A subunit  44.32 
 
 		 1995 aa  1189    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.350248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6248  excinuclease ABC, A subunit  58.77 
 
 		 1996 aa  1684    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09180  excinuclease ABC subunit A  38.82 
 
 		 945 aa  662    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.533075 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1444  excinuclease ABC, A subunit  58.17 
 
 		 1889 aa  2138    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0318  excinuclease ABC, A subunit  38.85 
 
 		 1006 aa  681    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4192  excinuclease ABC, A subunit  58.05 
 
 		 1935 aa  2142    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000700694 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5972  excinuclease ABC, A subunit  59.57 
 
 		 1964 aa  1057    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0125228 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0731  excinuclease ABC, A subunit  46.2 
 
 		 1895 aa  684    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1602  excinuclease ABC, A subunit  44.31 
 
 		 874 aa  644    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5952  excinuclease ABC, A subunit  54.06 
 
 		 1984 aa  2050    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0024  excinuclease ABC, A subunit  41.71 
 
 		 940 aa  655    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1218  excinuclease ABC, subunit A, form 2  58.07 
 
 		 1970 aa  1647    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.13215  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0110  excinuclease ABC, A subunit  100 
 
 		 2017 aa  4081    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4341  excinuclease ABC, A subunit  58.61 
 
 		 1969 aa  1696    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.580395 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0488  excinuclease ABC, A subunit  54.39 
 
 		 1965 aa  1655    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3339  excinuclease ABC subunit A  38.57 
 
 		 967 aa  594  1e-168  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818177 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3003  excinuclease ABC subunit A  38.52 
 
 		 973 aa  597  1e-168  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.855569  normal  0.034696 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3548  excinuclease ABC subunit A  38.59 
 
 		 967 aa  592  1e-167  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.658203  normal  0.309926 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3168  excinuclease ABC, A subunit  38.43 
 
 		 999 aa  582  1e-164  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.249908  normal  0.823246 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2038  excinuclease ABC, A subunit  51.01 
 
 		 963 aa  567  1e-160  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225095  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2882  excinuclease ABC, A subunit  51.82 
 
 		 964 aa  569  1e-160  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06520  excinuclease ABC subunit A  35.98 
 
 		 944 aa  562  1e-158  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0252  excinuclease ABC (subunit A)  51.22 
 
 		 942 aa  561  1e-158  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00117135  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3827  excinuclease ABC, A subunit  36.65 
 
 		 1024 aa  562  1e-158  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.67305 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2036  Excinuclease ABC subunit A  50.7 
 
 		 944 aa  560  1e-157  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0663505  hitchhiker  0.000130956 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4734  excinuclease ABC, A subunit  52 
 
 		 940 aa  555  1e-156  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.332226  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2119  excinuclease ABC, A subunit  48.44 
 
 		 942 aa  556  1e-156  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000168396  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2024  excinuclease ABC subunit A  52.38 
 
 		 945 aa  555  1e-156  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136428  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1999  excinuclease ABC subunit A  51.74 
 
 		 946 aa  555  1e-156  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0576024  normal  0.88061 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09248  excinuclease ABC subunit A  36.1 
 
 		 927 aa  555  1e-156  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1053  excinuclease ABC, A subunit  49.21 
 
 		 927 aa  552  1e-155  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00826345  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3065  excinuclease ABC, A subunit  48.28 
 
 		 956 aa  552  1e-155  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000246359  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0411  excinuclease ABC, A subunit  51.4 
 
 		 957 aa  548  1e-154  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6045  excinuclease ABC subunit A  50.17 
 
 		 946 aa  550  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.834052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0976  excinuclease ABC subunit A  50.97 
 
 		 931 aa  547  1e-154  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.177637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16220  excinuclease ABC, A subunit  46.93 
 
 		 941 aa  548  1e-154  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.266346  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0776  excinuclease ABC subunit A  47.42 
 
 		 981 aa  548  1e-154  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.839433  normal  0.0723742 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2524  excinuclease ABC subunit A  50.68 
 
 		 1019 aa  549  1e-154  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.247426  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1949  excinuclease ABC, A subunit  52.41 
 
 		 957 aa  546  1e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0876147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0189  excinuclease ABC, A subunit  50.09 
 
 		 947 aa  545  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0119000000000001e-25 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0255  excinuclease ABC subunit A  53.5 
 
 		 971 aa  544  1e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13060  Excinuclease ABC subunit A  48.86 
 
 		 968 aa  543  1e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1160  excinuclease ABC, A subunit  49.21 
 
 		 953 aa  545  1e-153  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.216625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0206  excinuclease ABC, A subunit  50.09 
 
 		 947 aa  546  1e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000261219  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2694  excinuclease ABC, A subunit  52.54 
 
 		 942 aa  542  9.999999999999999e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3174  excinuclease ABC subunit A  47.18 
 
 		 955 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0374  excinuclease ABC subunit A  48.85 
 
 		 952 aa  541  9.999999999999999e-153  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1109  excinuclease ABC subunit A  48.11 
 
 		 947 aa  542  9.999999999999999e-153  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.57709  normal  0.229428 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0311  excinuclease ABC subunit A  50.43 
 
 		 942 aa  543  9.999999999999999e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00463978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>