More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2709 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0546  excinuclease ABC, A subunit  37.51 
 
 		 946 aa  655    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0457921  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2758  excinuclease ABC family protein  45.14 
 
 		 1855 aa  1533    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3325  excinuclease ABC, A subunit  37.05 
 
 		 937 aa  642    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1194  excinuclease ABC subunit A  36.02 
 
 		 932 aa  651    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2210  excinuclease ABC, A subunit  39.19 
 
 		 952 aa  676    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0226  hypothetical protein  37.35 
 
 		 935 aa  670    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.544357 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2176  excinuclease ABC, A subunit  43.93 
 
 		 1840 aa  1540    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4509  excinuclease ABC, A subunit  36.17 
 
 		 943 aa  642    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0420  excinuclease ABC subunit A  38.71 
 
 		 954 aa  648    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.790766  normal  0.236129 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0994  excinuclease ABC subunit A  43.87 
 
 		 1945 aa  1536    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0618908 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0110  excinuclease ABC, A subunit  44.36 
 
 		 2017 aa  1196    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1709  excinuclease ABC subunit A  39.33 
 
 		 942 aa  640    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0152505  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3339  excinuclease ABC subunit A  37.18 
 
 		 987 aa  652    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.535422  hitchhiker  0.000450974 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1444  excinuclease ABC, A subunit  43.33 
 
 		 1889 aa  1488    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1437  excinuclease ABC, A subunit  36.45 
 
 		 942 aa  652    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0677  excinuclease ABC, A subunit  37.73 
 
 		 956 aa  652    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0725474 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0073  excinuclease ABC, A subunit  43.75 
 
 		 1997 aa  1491    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0062  excinuclease ABC, subunit A, form 2  43.6 
 
 		 1970 aa  1482    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1104  excinuclease ABC subunit A  35.87 
 
 		 939 aa  642    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3111  excinuclease ABC subunit A  37.28 
 
 		 987 aa  645    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.400929  normal  0.194384 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5541  excinuclease ABC, A subunit  43.58 
 
 		 1974 aa  1483    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0115667 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1685  excinuclease ABC subunit A  38.21 
 
 		 968 aa  650    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4734  excinuclease ABC, A subunit  39.29 
 
 		 940 aa  637    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.332226  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0037  excinuclease ABC subunit A  37.84 
 
 		 920 aa  646    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2036  Excinuclease ABC subunit A  37.05 
 
 		 944 aa  656    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0663505  hitchhiker  0.000130956 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4240  UvrA family protein  43.78 
 
 		 1957 aa  1519    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.591545  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2710  excinuclease ABC subunit A  37.1 
 
 		 1008 aa  651    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00698098 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10878  excinuclease ABC subunit A  37.23 
 
 		 943 aa  645    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0495  excinuclease ABC, A subunit  38.21 
 
 		 952 aa  664    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0204806  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1501  excinuclease ABC, subunit A, form 2  43.6 
 
 		 1970 aa  1482    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.776377  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1568  excinuclease ABC, subunit A, form 2  43.63 
 
 		 1971 aa  1489    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.49006  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0078  excinuclease ABC subunit A  42.89 
 
 		 1867 aa  1506    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0538  excinuclease ABC subunit A  39.23 
 
 		 970 aa  642    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.566614  normal  0.542221 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1601  excinuclease ABC, A subunit  38.76 
 
 		 960 aa  648    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.409115  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4192  excinuclease ABC, A subunit  44.69 
 
 		 1935 aa  1499    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000700694 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7351  UvrA family protein  43.72 
 
 		 1967 aa  1512    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.965085  normal  0.937028 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0522  excinuclease ABC subunit A  37.51 
 
 		 944 aa  651    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0045705  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0539  excinuclease ABC subunit A  37.2 
 
 		 956 aa  652    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.111546  normal  0.557 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0154  excinuclease ABC subunit A  38.28 
 
 		 951 aa  639    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.676306  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1301  excinuclease ABC subunit A  37.2 
 
 		 942 aa  671    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0773804  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1549  excinuclease ABC, A subunit  43.32 
 
 		 1997 aa  1507    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0885  excinuclease ABC, A subunit  38.66 
 
 		 947 aa  691    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2580  UvrA family protein  44.19 
 
 		 1892 aa  1503    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.603689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3843  excinuclease ABC subunit A  36.86 
 
 		 957 aa  642    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16220  excinuclease ABC, A subunit  36.37 
 
 		 941 aa  640    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.266346  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1053  excinuclease ABC, A subunit  36.6 
 
 		 927 aa  645    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00826345  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1256  excinuclease ABC, A subunit  39.53 
 
 		 966 aa  671    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145328  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0275  excinuclease ABC, A subunit  38.1 
 
 		 954 aa  642    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0294  excinuclease ABC, A subunit  38.54 
 
 		 946 aa  664    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0255  excinuclease ABC subunit A  39.59 
 
 		 971 aa  665    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0075  excinuclease ABC, subunit A, form 2  44.15 
 
 		 2021 aa  1502    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1084  excinuclease ABC, A subunit  37.9 
 
 		 936 aa  675    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.293507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1127  excinuclease ABC subunit A  39.42 
 
 		 966 aa  666    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6472  excinuclease ABC, A subunit  43.72 
 
 		 1964 aa  1509    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.225819 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1160  excinuclease ABC, A subunit  36.95 
 
 		 953 aa  652    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.216625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3814  excinuclease ABC, A subunit  42.06 
 
 		 2098 aa  1226    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2246  excinuclease ABC, A subunit  42.84 
 
 		 1896 aa  1428    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186636  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4139  UvrA family protein  42.51 
 
 		 2024 aa  1226    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.79148 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3001  UvrA family protein  43.28 
 
 		 1971 aa  1519    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4702  excinuclease ABC, A subunit  43.9 
 
 		 1981 aa  1541    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3028  excinuclease ABC, A subunit  43.84 
 
 		 1976 aa  1552    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.500259  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0780  excinuclease ABC, A subunit  37.44 
 
 		 948 aa  654    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0344359  normal  0.338126 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1960  excinuclease ABC, A subunit  38.31 
 
 		 968 aa  656    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5952  excinuclease ABC, A subunit  42.55 
 
 		 1984 aa  1512    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4549  excinuclease ABC subunit A  44.06 
 
 		 1959 aa  1535    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.179328 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0831  excinuclease ABC, A subunit  37.67 
 
 		 948 aa  655    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0795854  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2022  excinuclease ABC subunit A  38.25 
 
 		 973 aa  667    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0304  excinuclease ABC, A subunit  43.04 
 
 		 2005 aa  1528    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3346  UvrA family protein  44.13 
 
 		 1929 aa  1528    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.973275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3065  excinuclease ABC, A subunit  37.96 
 
 		 956 aa  665    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000246359  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5608  excinuclease ABC, A subunit  43.74 
 
 		 1964 aa  1513    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4441  excinuclease ABC, A subunit  43.49 
 
 		 1949 aa  1530    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.407349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5945  excinuclease ABC, A subunit  43.27 
 
 		 1996 aa  1498    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0311  excinuclease ABC subunit A  35.81 
 
 		 942 aa  637    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00463978  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0976  excinuclease ABC subunit A  37.44 
 
 		 931 aa  654    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.177637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1187  excinuclease ABC, A subunit  39.43 
 
 		 965 aa  669    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0337  excinuclease ABC subunit A  35.9 
 
 		 939 aa  656    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0329  excinuclease ABC subunit A  36 
 
 		 939 aa  659    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0252  excinuclease ABC (subunit A)  37.13 
 
 		 942 aa  653    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00117135  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3709  excinuclease ABC subunit A  36.28 
 
 		 956 aa  637    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6248  excinuclease ABC, A subunit  43.36 
 
 		 1996 aa  1506    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0384  excinuclease ABC subunit A  37.87 
 
 		 954 aa  653    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000942847  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0374  excinuclease ABC subunit A  37.35 
 
 		 952 aa  647    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1322  excinuclease ABC, A subunit  37.6 
 
 		 934 aa  651    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0124703  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0393  excinuclease ABC subunit A  37.03 
 
 		 952 aa  637    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2429  excinuclease ABC, A subunit  36.92 
 
 		 931 aa  666    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5972  excinuclease ABC, A subunit  43.74 
 
 		 1964 aa  1513    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0125228 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0731  excinuclease ABC, A subunit  41.62 
 
 		 1895 aa  1328    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2709  excinuclease ABC, A subunit  100 
 
 		 1995 aa  4079    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.350248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1109  excinuclease ABC subunit A  39.03 
 
 		 947 aa  652    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.57709  normal  0.229428 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0853  excinuclease ABC subunit A  36.45 
 
 		 954 aa  642    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0596  excinuclease ABC, A subunit  37.41 
 
 		 943 aa  690    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.56752e-16 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2119  excinuclease ABC, A subunit  35.96 
 
 		 942 aa  663    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000168396  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0074  excinuclease ABC, A subunit  43.6 
 
 		 1970 aa  1482    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.862604  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1170  excinuclease ABC, A subunit  38.61 
 
 		 973 aa  670    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.813756 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4341  excinuclease ABC, A subunit  44.32 
 
 		 1969 aa  1559    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.580395 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1438  excinuclease ABC, A subunit  43.37 
 
 		 1983 aa  1512    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.836359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0488  excinuclease ABC, A subunit  43.64 
 
 		 1965 aa  1544    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3747  UvrA family protein  43.99 
 
 		 1941 aa  1559    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0157  excinuclease ABC, A subunit  36.32 
 
 		 954 aa  637    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.352383  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>