More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0495 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03930  excinuclease ABC subunit A  44.25 
 
 		 940 aa  745    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.166439  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3934  excinuclease ABC, A subunit  44.25 
 
 		 940 aa  746    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0546  excinuclease ABC, A subunit  45.43 
 
 		 946 aa  808    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0457921  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2758  excinuclease ABC family protein  45.11 
 
 		 1855 aa  768    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3325  excinuclease ABC, A subunit  48.42 
 
 		 937 aa  862    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0483  excinuclease ABC subunit A  43.49 
 
 		 944 aa  759    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000649364 
 
 
-
 
NC_002950  PG2210  excinuclease ABC, A subunit  47.7 
 
 		 952 aa  846    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1010  excinuclease ABC subunit A  43.44 
 
 		 954 aa  764    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0427  excinuclease ABC subunit A  45.73 
 
 		 944 aa  818    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2694  excinuclease ABC, A subunit  43.49 
 
 		 942 aa  742    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0916  excinuclease ABC, A subunit  42.6 
 
 		 931 aa  750    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0420  excinuclease ABC subunit A  44.62 
 
 		 954 aa  775    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.790766  normal  0.236129 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5271  excinuclease ABC subunit A  44.96 
 
 		 958 aa  811    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0920  excinuclease ABC, A subunit  44.77 
 
 		 943 aa  769    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1709  excinuclease ABC subunit A  45.27 
 
 		 942 aa  792    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0152505  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1104  excinuclease ABC subunit A  43.51 
 
 		 974 aa  749    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.807702  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0654  excinuclease ABC, A subunit  43.02 
 
 		 992 aa  755    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5015  excinuclease ABC subunit A  44.86 
 
 		 958 aa  809    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.93666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4844  excinuclease ABC subunit A  44.86 
 
 		 958 aa  809    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl059  repair endonuclease subunit A  44.19 
 
 		 949 aa  760    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4859  excinuclease ABC subunit A  44.41 
 
 		 958 aa  809    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3095  excinuclease ABC, A subunit  45.17 
 
 		 955 aa  770    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0451  excinuclease ABC subunit A  43.89 
 
 		 951 aa  773    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0427  excinuclease ABC subunit A  43.57 
 
 		 951 aa  768    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4520  excinuclease ABC subunit A  43.08 
 
 		 961 aa  757    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.308582 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1685  excinuclease ABC subunit A  43.24 
 
 		 968 aa  770    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0473  excinuclease ABC subunit A  43.54 
 
 		 941 aa  765    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.78914 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2024  excinuclease ABC subunit A  47.01 
 
 		 945 aa  853    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136428  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0367  excinuclease ABC subunit A  45.42 
 
 		 954 aa  781    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2710  excinuclease ABC subunit A  44.93 
 
 		 1008 aa  788    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00698098 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0436  excinuclease ABC subunit A  44 
 
 		 940 aa  758    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.64292  normal  0.354082 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0779  excinuclease ABC, A subunit  45.17 
 
 		 955 aa  770    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.159716  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0078  excinuclease ABC subunit A  43.55 
 
 		 1867 aa  752    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3021  excinuclease ABC subunit A  44.97 
 
 		 953 aa  757    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5051  excinuclease ABC subunit A  43.17 
 
 		 944 aa  751    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0371407 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0087  excinuclease ABC, A subunit  46.55 
 
 		 937 aa  810    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000141309  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6109  excinuclease ABC subunit A  44.8 
 
 		 961 aa  765    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.547092 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0539  excinuclease ABC subunit A  77.98 
 
 		 956 aa  1526    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.111546  normal  0.557 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1301  excinuclease ABC subunit A  76.29 
 
 		 942 aa  1461    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0773804  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0128  excinuclease ABC subunit A  48.31 
 
 		 937 aa  862    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2486  excinuclease ABC subunit A  43.09 
 
 		 926 aa  744    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000102064  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0324  excinuclease ABC, A subunit  44.01 
 
 		 935 aa  746    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.71267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5395  excinuclease ABC subunit A  44.86 
 
 		 958 aa  809    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2229  excinuclease ABC, A subunit  44.43 
 
 		 944 aa  766    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.748559  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0774  excinuclease ABC, A subunit  42.48 
 
 		 946 aa  759    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1752  excinuclease ABC subunit A  44.86 
 
 		 950 aa  795    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72619  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0255  excinuclease ABC subunit A  46.23 
 
 		 971 aa  808    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0498  excinuclease ABC, A subunit  45.28 
 
 		 981 aa  774    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0382753  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1127  excinuclease ABC subunit A  44.81 
 
 		 966 aa  799    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1631  excinuclease ABC subunit A  45.09 
 
 		 976 aa  806    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.978501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1192  excinuclease ABC subunit A  43.09 
 
 		 970 aa  773    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.548367  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1160  excinuclease ABC, A subunit  45.75 
 
 		 953 aa  796    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.216625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0993  excinuclease ABC subunit A  44.06 
 
 		 946 aa  778    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.883407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2426  excinuclease ABC subunit A  44.11 
 
 		 939 aa  756    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4108  excinuclease ABC subunit A  44.48 
 
 		 957 aa  764    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1158  excinuclease ABC subunit A  47.01 
 
 		 941 aa  844    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0448  excinuclease ABC subunit A  44.36 
 
 		 957 aa  758    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.775809  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1960  excinuclease ABC, A subunit  43.14 
 
 		 968 aa  771    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0313  excinuclease ABC subunit A  45.62 
 
 		 955 aa  784    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0776  excinuclease ABC subunit A  44.41 
 
 		 981 aa  779    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.839433  normal  0.0723742 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2022  excinuclease ABC subunit A  48.51 
 
 		 973 aa  881    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0926  excinuclease ABC subunit A  43.11 
 
 		 967 aa  756    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2165  excinuclease ABC, A subunit  45.11 
 
 		 961 aa  761    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611156  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2988  excinuclease ABC subunit A  45.39 
 
 		 973 aa  808    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2016  excinuclease ABC subunit A  45.23 
 
 		 923 aa  745    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0146  excinuclease ABC, A subunit  44.13 
 
 		 942 aa  770    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0158  excinuclease ABC subunit A  43.52 
 
 		 947 aa  755    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.509879 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3698  excinuclease ABC subunit A  48.56 
 
 		 944 aa  838    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0337  excinuclease ABC subunit A  44.83 
 
 		 939 aa  828    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0329  excinuclease ABC subunit A  45.04 
 
 		 939 aa  832    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1128  excinuclease ABC subunit A  43.89 
 
 		 943 aa  758    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0168519  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4529  excinuclease ABC subunit A  42.14 
 
 		 1004 aa  758    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.388668 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0252  excinuclease ABC (subunit A)  43.55 
 
 		 942 aa  768    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00117135  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1885  excinuclease ABC subunit A  44.62 
 
 		 957 aa  758    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.414426  normal  0.621255 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2839  excinuclease ABC, A subunit  44.8 
 
 		 961 aa  767    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.696224  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09180  excinuclease ABC subunit A  43.55 
 
 		 945 aa  754    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.533075 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2009  excinuclease ABC subunit A  45.79 
 
 		 943 aa  806    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.407568  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0374  excinuclease ABC subunit A  46.79 
 
 		 952 aa  830    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1317  excinuclease ATPase subunit  44.88 
 
 		 953 aa  800    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.133455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0393  excinuclease ABC subunit A  44.84 
 
 		 952 aa  788    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1722  excinuclease ABC subunit A  44.32 
 
 		 941 aa  787    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2079  excinuclease ABC subunit A  44.25 
 
 		 975 aa  792    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.224045  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2779  excinuclease ABC, A subunit  45.11 
 
 		 961 aa  761    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3616  excinuclease ABC subunit A  44.64 
 
 		 950 aa  798    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0557208 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1109  excinuclease ABC subunit A  46.92 
 
 		 947 aa  839    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.57709  normal  0.229428 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3515  excinuclease ABC, A subunit  47.17 
 
 		 954 aa  832    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000620303  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0517  excinuclease ABC subunit A  43.41 
 
 		 962 aa  744    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.516633  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1939  excinuclease ABC subunit A  79.32 
 
 		 950 aa  1530    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0317613  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2252  excinuclease ABC subunit A  44.57 
 
 		 959 aa  741    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.174561  normal  0.0315795 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2524  excinuclease ABC subunit A  45.53 
 
 		 1019 aa  825    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.247426  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3032  excinuclease ABC subunit A  45.39 
 
 		 973 aa  808    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.69865 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0369  excinuclease ABC, A subunit  43.63 
 
 		 945 aa  765    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3339  excinuclease ABC subunit A  45.11 
 
 		 967 aa  793    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818177 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0746  excinuclease ABC, A subunit  44.43 
 
 		 940 aa  755    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4708  excinuclease ABC subunit A  42.69 
 
 		 1023 aa  741    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.879248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0735  excinuclease ABC subunit A  42.8 
 
 		 964 aa  742    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0936204  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0063  excinuclease ABC, A subunit  45.17 
 
 		 955 aa  770    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19211  excinuclease ABC subunit A  41.18 
 
 		 967 aa  740    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1527  excinuclease ABC, A subunit  45.17 
 
 		 955 aa  770    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0976  excinuclease ABC subunit A  46.58 
 
 		 931 aa  802    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.177637  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>