13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_00755 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_10058  ea59  100 
 
 
312 aa  595  1e-169  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.107318  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00755  hypothetical protein  100 
 
 
290 aa  595  1e-169  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.137784  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05619  hypothetical protein  44.4 
 
 
254 aa  207  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2345  ea59 protein  45.26 
 
 
516 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3691  ea59 protein  39.78 
 
 
513 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25413  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1584  putative EA59 gene protein, phage lambda  31.46 
 
 
540 aa  125  7e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0818233  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1735  AAA ATPase  28.12 
 
 
484 aa  97.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.331613 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1567  AAA ATPase  28.96 
 
 
556 aa  96.7  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1204  hypothetical protein  26.24 
 
 
567 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.530833  normal  0.121521 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0161  ABC transporter related  29.2 
 
 
251 aa  45.8  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.486582  normal  0.131526 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3675  ABC transporter-related protein  29.87 
 
 
454 aa  43.1  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3808  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  34.18 
 
 
269 aa  42.4  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0159276  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2851  SMC domain protein  29.79 
 
 
423 aa  42.4  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0808223 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>