78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0023 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  100 
 
 		 736 aa  1497    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5461  AAA ATPase  32.87 
 
 		 769 aa  295  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3443  SMC domain-containing protein  29.3 
 
 		 709 aa  244  3e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416993  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  26.79 
 
 		 440 aa  94.7  6e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1782  hypothetical protein  35.94 
 
 		 253 aa  85.9  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5503  AAA ATPase  24.88 
 
 		 464 aa  86.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328038  hitchhiker  0.00036536 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0928  SMC domain protein  28.95 
 
 		 577 aa  86.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.384804  normal  0.0676455 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  37.93 
 
 		 439 aa  86.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1600  ATPase  24.71 
 
 		 427 aa  82.8  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0426773  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6340  SMC domain protein  24.08 
 
 		 420 aa  81.6  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  23.5 
 
 		 421 aa  78.2  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0397  ATPase  29.15 
 
 		 360 aa  77.8  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2697  AAA ATPase  34.45 
 
 		 410 aa  77.4  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  39.8 
 
 		 430 aa  76.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5113  hypothetical protein  30.48 
 
 		 422 aa  76.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4983  hypothetical protein  25.79 
 
 		 262 aa  75.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  33.85 
 
 		 449 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  33.59 
 
 		 452 aa  75.1  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  33.59 
 
 		 455 aa  75.1  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3442  hypothetical protein  28.67 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000827494  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1783  hypothetical protein  25.97 
 
 		 447 aa  74.3  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.599015 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  31.65 
 
 		 482 aa  72.4  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1791  hypothetical protein  24.23 
 
 		 369 aa  72.4  0.00000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2683  hypothetical protein  30.67 
 
 		 478 aa  71.6  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7060  hypothetical protein  33.63 
 
 		 445 aa  71.2  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  29.75 
 
 		 403 aa  71.2  0.00000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  27.27 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0022  hypothetical protein  26.82 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4982  hypothetical protein  31.4 
 
 		 464 aa  70.9  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  39.36 
 
 		 454 aa  69.7  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  36.72 
 
 		 423 aa  70.1  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1964  hypothetical protein  33.66 
 
 		 203 aa  68.6  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  35.94 
 
 		 422 aa  68.6  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3668  hypothetical protein  31.15 
 
 		 408 aa  68.2  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5504  hypothetical protein  33.33 
 
 		 252 aa  67  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.241088  decreased coverage  0.000273581 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2940  hypothetical protein  33.33 
 
 		 410 aa  67  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2903  ATP-binding protein involved in virulence-like protein  28.48 
 
 		 453 aa  65.9  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0641  AAA ATPase  29.56 
 
 		 418 aa  65.1  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5462  hypothetical protein  28.92 
 
 		 335 aa  65.1  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.99145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2958  hypothetical protein  30.97 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0742  antigen PgaA  33.7 
 
 		 445 aa  64.7  0.000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  31.3 
 
 		 442 aa  62.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0853474 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0743  hypothetical protein, putative phage gene  25 
 
 		 414 aa  62.8  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4173  AAA ATPase  30.33 
 
 		 415 aa  62.4  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3143  hypothetical protein  28.57 
 
 		 519 aa  61.6  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.814371  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1398  hypothetical protein  32.26 
 
 		 610 aa  61.2  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  29.41 
 
 		 437 aa  60.5  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0856  hypothetical protein  25.76 
 
 		 270 aa  57  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0182389  normal  0.108179 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2959  hypothetical protein  30.61 
 
 		 533 aa  56.6  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6341  hypothetical protein  28.24 
 
 		 245 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0855  SMC domain-containing protein  33.33 
 
 		 556 aa  55.8  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0223965  normal  0.062418 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0121  hypothetical protein  32.84 
 
 		 216 aa  55.1  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.230908  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0929  hypothetical protein  28.32 
 
 		 313 aa  54.3  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0953225  normal  0.150817 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2482  putative ABC transporter, ATP-binding domain  24.56 
 
 		 976 aa  52.8  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0120  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.16 
 
 		 429 aa  52  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0455  hypothetical protein  29 
 
 		 452 aa  52  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0472  AAA ATPase  31.33 
 
 		 369 aa  50.8  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2531  hypothetical protein  29.76 
 
 		 608 aa  49.3  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.41472  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1606  ATPase  34.48 
 
 		 368 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00139192 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1235  SMC domain-containing protein  26.06 
 
 		 359 aa  47  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1131  SMC domain protein  25.78 
 
 		 450 aa  47.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.526004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0224  ATPase  29.79 
 
 		 352 aa  47  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0363611 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  31.58 
 
 		 399 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3597  hypothetical protein  30.59 
 
 		 287 aa  46.2  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00139996  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3008  hypothetical protein  25.21 
 
 		 582 aa  45.8  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568683  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  25.89 
 
 		 666 aa  45.8  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1584  putative EA59 gene protein, phage lambda  27.37 
 
 		 540 aa  45.8  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0818233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7061  hypothetical protein  30 
 
 		 268 aa  45.4  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.667269  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3514  hypothetical protein  22.88 
 
 		 562 aa  45.4  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0681  ATP-dependent endonuclease of the OLD family  27.03 
 
 		 353 aa  45.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.734229 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6344  AAA ATPase  24.34 
 
 		 537 aa  45.1  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1424  hypothetical protein  23.66 
 
 		 712 aa  45.1  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1102  hypothetical protein  24.5 
 
 		 411 aa  45.1  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.89522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2084  hypothetical protein  24.81 
 
 		 506 aa  44.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330543 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3655  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.67 
 
 		 793 aa  44.3  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523201  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4238  ABC transporter  30.3 
 
 		 588 aa  44.3  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4015  hypothetical protein  30.56 
 
 		 175 aa  44.3  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3598  AAA ATPase  24.53 
 
 		 530 aa  43.9  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234034  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>