22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5504 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5504  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  518  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.241088  decreased coverage  0.000273581 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7061  hypothetical protein  31.31 
 
 		 268 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.667269  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5461  AAA ATPase  36.25 
 
 		 769 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3442  hypothetical protein  29.22 
 
 		 295 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000827494  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1782  hypothetical protein  35 
 
 		 253 aa  67  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  33.33 
 
 		 736 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0121  hypothetical protein  30.34 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.230908  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4983  hypothetical protein  29.14 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5462  hypothetical protein  25.35 
 
 		 335 aa  55.5  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.99145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6341  hypothetical protein  26.52 
 
 		 245 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0270  hypothetical protein  27.94 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2481  hypothetical protein, putative phage gene  44.74 
 
 		 249 aa  49.7  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0324843  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0494  hypothetical protein  31.07 
 
 		 247 aa  49.7  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426631  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3443  SMC domain-containing protein  25.55 
 
 		 709 aa  49.3  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416993  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0022  hypothetical protein  25.9 
 
 		 299 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4527  HNH endonuclease  32.77 
 
 		 142 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000580213  normal  0.505709 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  39.34 
 
 		 169 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2728  hypothetical protein  29 
 
 		 361 aa  43.9  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0405  HNH endonuclease  39.19 
 
 		 169 aa  43.5  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.359772 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3143  hypothetical protein  28.57 
 
 		 519 aa  42.4  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.814371  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0200  hypothetical protein  31.43 
 
 		 213 aa  42  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.162545 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0084  restriction endonuclease  52.5 
 
 		 309 aa  42  0.01  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000299612  normal  0.866494 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>