18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5462 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5462  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  690    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.99145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3442  hypothetical protein  38.81 
 
 		 295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000827494  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6341  hypothetical protein  35.64 
 
 		 245 aa  108  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5461  AAA ATPase  33.61 
 
 		 769 aa  106  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4983  hypothetical protein  31.44 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0022  hypothetical protein  31.12 
 
 		 299 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2958  hypothetical protein  31.75 
 
 		 269 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0856  hypothetical protein  36.99 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0182389  normal  0.108179 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3443  SMC domain-containing protein  29.1 
 
 		 709 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416993  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1782  hypothetical protein  29.29 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  28.92 
 
 		 736 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0929  hypothetical protein  35.17 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0953225  normal  0.150817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5504  hypothetical protein  25.35 
 
 		 252 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.241088  decreased coverage  0.000273581 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3597  hypothetical protein  33.67 
 
 		 287 aa  50.8  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00139996  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0121  hypothetical protein  27.49 
 
 		 216 aa  45.8  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.230908  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2904  hypothetical protein  25.86 
 
 		 276 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0796384  normal  0.464654 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3190  hypothetical protein  33.78 
 
 		 151 aa  44.3  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7061  hypothetical protein  25.99 
 
 		 268 aa  42.7  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.667269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>