14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0856 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0856  hypothetical protein  100 
 
 
270 aa  564  1e-160  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0182389  normal  0.108179 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2958  hypothetical protein  35.93 
 
 
269 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5461  AAA ATPase  42.02 
 
 
769 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323053  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3442  hypothetical protein  33.14 
 
 
295 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000827494  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3597  hypothetical protein  31.18 
 
 
287 aa  79  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00139996  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5462  hypothetical protein  36.99 
 
 
335 aa  72.4  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.99145  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0022  hypothetical protein  26.16 
 
 
299 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6341  hypothetical protein  33.13 
 
 
245 aa  69.3  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4983  hypothetical protein  32.24 
 
 
262 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298142  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1782  hypothetical protein  30.65 
 
 
253 aa  57.4  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  25.76 
 
 
736 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2904  hypothetical protein  26.94 
 
 
276 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0796384  normal  0.464654 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4015  hypothetical protein  30.18 
 
 
175 aa  49.7  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0929  hypothetical protein  31.68 
 
 
313 aa  43.9  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0953225  normal  0.150817 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>