17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6341 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6341  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  512  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4983  hypothetical protein  41.2 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3442  hypothetical protein  41.25 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000827494  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5462  hypothetical protein  35.64 
 
 		 335 aa  108  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.99145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5461  AAA ATPase  30.19 
 
 		 769 aa  90.1  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0121  hypothetical protein  30.04 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.230908  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0856  hypothetical protein  33.13 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0182389  normal  0.108179 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0022  hypothetical protein  27.46 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1782  hypothetical protein  30.57 
 
 		 253 aa  62  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3143  hypothetical protein  31.43 
 
 		 519 aa  58.5  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.814371  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  28.24 
 
 		 736 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5504  hypothetical protein  26.52 
 
 		 252 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.241088  decreased coverage  0.000273581 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3443  SMC domain-containing protein  27.54 
 
 		 709 aa  52  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416993  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0929  hypothetical protein  31.76 
 
 		 313 aa  50.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0953225  normal  0.150817 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3597  hypothetical protein  25.61 
 
 		 287 aa  47.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00139996  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2958  hypothetical protein  32.41 
 
 		 269 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2904  hypothetical protein  28.03 
 
 		 276 aa  42  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0796384  normal  0.464654 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>