15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_2904 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2904  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0796384  normal  0.464654 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0121  hypothetical protein  47.37 
 
 
216 aa  62.4  0.000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.230908  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0022  hypothetical protein  35.29 
 
 
299 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4983  hypothetical protein  32.29 
 
 
262 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298142  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0742  putative HNH endonuclease  32.85 
 
 
221 aa  52.4  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0642  hypothetical protein  30.83 
 
 
216 aa  52.4  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.254825  normal  0.0873851 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0856  hypothetical protein  26.94 
 
 
270 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0182389  normal  0.108179 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0494  hypothetical protein  34.25 
 
 
247 aa  50.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426631  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4172  hypothetical protein  33.33 
 
 
219 aa  48.5  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0270  hypothetical protein  30.77 
 
 
256 aa  48.5  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2684  HNH nuclease  42.59 
 
 
234 aa  44.3  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.165249  normal 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7061  hypothetical protein  34.92 
 
 
268 aa  43.9  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.667269  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5462  hypothetical protein  25.86 
 
 
335 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.99145  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5461  AAA ATPase  29.67 
 
 
769 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323053  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0627  hypothetical protein  32.05 
 
 
227 aa  42.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>