14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_7061 on replicon NC_010374
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010374  M446_7061  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  555  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.667269  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5504  hypothetical protein  31.31 
 
 
252 aa  94.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.241088  decreased coverage  0.000273581 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0121  hypothetical protein  42.86 
 
 
216 aa  53.5  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.230908  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0627  hypothetical protein  51.06 
 
 
227 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2684  HNH nuclease  49.02 
 
 
234 aa  50.8  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.165249  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02160  hypothetical protein  43.48 
 
 
370 aa  47.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.313091 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4525  HNH endonuclease  25.93 
 
 
243 aa  46.6  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.148473  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0494  hypothetical protein  28.27 
 
 
247 aa  46.6  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426631  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  30 
 
 
736 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0200  hypothetical protein  30.28 
 
 
213 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.162545 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2904  hypothetical protein  34.92 
 
 
276 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0796384  normal  0.464654 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0022  hypothetical protein  28.31 
 
 
299 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2696  hypothetical protein  44.64 
 
 
235 aa  43.5  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.258653  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5462  hypothetical protein  25.99 
 
 
335 aa  42.7  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.99145  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>