24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02160 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02160  hypothetical protein  100 
 
 		 370 aa  759    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.313091 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2684  HNH nuclease  37.37 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.165249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0627  hypothetical protein  34.83 
 
 		 227 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2696  hypothetical protein  29.65 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.258653  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1599  hypothetical protein  45.9 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3733  HNH endonuclease  34.78 
 
 		 187 aa  53.5  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4834  HNH endonuclease  34.04 
 
 		 182 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5301  HNH endonuclease  34.04 
 
 		 182 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4342  HNH endonuclease  36.08 
 
 		 182 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7061  hypothetical protein  43.48 
 
 		 268 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.667269  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5379  HNH endonuclease  34.04 
 
 		 182 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.785631  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4555  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 183 aa  47  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00702162  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3060  HNH endonuclease  32.98 
 
 		 183 aa  47  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137861  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0478  HNH endonuclease  32.32 
 
 		 185 aa  47  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0558  HNH endonuclease  32.32 
 
 		 185 aa  46.2  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  35.53 
 
 		 186 aa  45.8  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1305  HNH endonuclease  41.82 
 
 		 146 aa  44.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.500836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  32.32 
 
 		 185 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0342  HNH endonuclease  32.32 
 
 		 185 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.440485  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  37.31 
 
 		 172 aa  44.3  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1499  HNH endonuclease  28.42 
 
 		 427 aa  43.9  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000016403  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3946  HNH endonuclease  43.14 
 
 		 151 aa  43.9  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0494  hypothetical protein  39.29 
 
 		 247 aa  43.5  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426631  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1736  hypothetical protein  25.26 
 
 		 233 aa  43.1  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.366884 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>