17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1736 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1736  hypothetical protein  100 
 
 
233 aa  488  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.366884 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1585  putative EA31 gene protein, phage lambda  27.11 
 
 
281 aa  83.2  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.933672  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1203  hypothetical protein  28.02 
 
 
286 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0444543  normal  0.100552 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3690  hypothetical protein  26.44 
 
 
286 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.271759  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1568  hypothetical protein  23.91 
 
 
287 aa  55.8  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.445072  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2984  hypothetical protein  51.11 
 
 
411 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1003  hypothetical protein  30.21 
 
 
175 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00979437 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2083  hypothetical protein  34.85 
 
 
410 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000112256 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2598  HNH endonuclease  27.86 
 
 
286 aa  51.2  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000498075  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0270  hypothetical protein  24.6 
 
 
256 aa  50.1  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3009  hypothetical protein  36.92 
 
 
409 aa  49.7  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2346  hypothetical protein  24.32 
 
 
291 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.233683  normal  0.10158 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5273  hypothetical protein  36.92 
 
 
389 aa  46.6  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2728  hypothetical protein  44.68 
 
 
361 aa  45.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4943  putative phage-related protein  41.82 
 
 
292 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.269735  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02160  hypothetical protein  25.26 
 
 
370 aa  42.7  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.313091 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0033  hypothetical protein  38.3 
 
 
261 aa  42.7  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.809592 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>